MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07 chromosome

Total Repeats: 1202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017867	ACCAC	2	10	1767	1776	40 %	0 %	0 %	60 %	387821586
2	NC_017867	CCGGC	2	10	2784	2793	0 %	0 %	40 %	60 %	387821587
3	NC_017867	CCGTT	2	10	3097	3106	0 %	40 %	20 %	40 %	387821587
4	NC_017867	AACGC	2	10	3315	3324	40 %	0 %	20 %	40 %	387821587
5	NC_017867	CGATC	2	10	5830	5839	20 %	20 %	20 %	40 %	387821590
6	NC_017867	AAGGC	2	10	7644	7653	40 %	0 %	40 %	20 %	387821590
7	NC_017867	GCACG	2	10	14420	14429	20 %	0 %	40 %	40 %	387821595
8	NC_017867	GGTGG	2	10	15065	15074	0 %	20 %	80 %	0 %	387821595
9	NC_017867	GCGAG	2	10	15797	15806	20 %	0 %	60 %	20 %	387821596
10	NC_017867	CGTGC	2	10	15944	15953	0 %	20 %	40 %	40 %	387821596
11	NC_017867	GATTG	2	10	16718	16727	20 %	40 %	40 %	0 %	387821596
12	NC_017867	TTCGA	2	10	17127	17136	20 %	40 %	20 %	20 %	387821598
13	NC_017867	ACCGA	2	10	17784	17793	40 %	0 %	20 %	40 %	387821598
14	NC_017867	CGCAC	2	10	24588	24597	20 %	0 %	20 %	60 %	387821605
15	NC_017867	CGACG	2	10	25256	25265	20 %	0 %	40 %	40 %	387821605
16	NC_017867	CGCTG	2	10	25402	25411	0 %	20 %	40 %	40 %	387821605
17	NC_017867	GGGGA	2	10	27082	27091	20 %	0 %	80 %	0 %	387821606
18	NC_017867	GGGAA	2	10	32962	32971	40 %	0 %	60 %	0 %	387821613
19	NC_017867	TGAGT	2	10	34473	34482	20 %	40 %	40 %	0 %	387821614
20	NC_017867	GATGT	2	10	35032	35041	20 %	40 %	40 %	0 %	387821614
21	NC_017867	TATGC	2	10	38421	38430	20 %	40 %	20 %	20 %	387821615
22	NC_017867	AAAGC	2	10	39670	39679	60 %	0 %	20 %	20 %	387821615
23	NC_017867	CATCA	2	10	40475	40484	40 %	20 %	0 %	40 %	387821617
24	NC_017867	TGCTG	2	10	41065	41074	0 %	40 %	40 %	20 %	387821617
25	NC_017867	GAGAT	2	10	43617	43626	40 %	20 %	40 %	0 %	387821618
26	NC_017867	CAAGC	2	10	44321	44330	40 %	0 %	20 %	40 %	387821619
27	NC_017867	TTCGT	2	10	44833	44842	0 %	60 %	20 %	20 %	387821620
28	NC_017867	GATCG	2	10	45763	45772	20 %	20 %	40 %	20 %	387821623
29	NC_017867	CGCCA	2	10	46431	46440	20 %	0 %	20 %	60 %	387821624
30	NC_017867	CCGAC	2	10	47665	47674	20 %	0 %	20 %	60 %	387821626
31	NC_017867	CTCGG	2	10	48383	48392	0 %	20 %	40 %	40 %	387821627
32	NC_017867	GCCAT	2	10	49083	49092	20 %	20 %	20 %	40 %	387821627
33	NC_017867	GCCCG	2	10	49960	49969	0 %	0 %	40 %	60 %	387821627
34	NC_017867	CGGTC	2	10	52543	52552	0 %	20 %	40 %	40 %	387821631
35	NC_017867	GCACG	2	10	53344	53353	20 %	0 %	40 %	40 %	387821631
36	NC_017867	ATTCA	2	10	55364	55373	40 %	40 %	0 %	20 %	387821633
37	NC_017867	TCCGC	2	10	55585	55594	0 %	20 %	20 %	60 %	387821633
38	NC_017867	TGAAT	2	10	56420	56429	40 %	40 %	20 %	0 %	387821633
39	NC_017867	GGATC	2	10	57076	57085	20 %	20 %	40 %	20 %	387821633
40	NC_017867	ATCGC	2	10	66393	66402	20 %	20 %	20 %	40 %	387821644
41	NC_017867	TGGGG	2	10	67092	67101	0 %	20 %	80 %	0 %	387821645
42	NC_017867	GGCGC	2	10	69592	69601	0 %	0 %	60 %	40 %	387821646
43	NC_017867	GCTCG	2	10	72756	72765	0 %	20 %	40 %	40 %	387821648
44	NC_017867	GCTGA	2	10	74919	74928	20 %	20 %	40 %	20 %	387821650
45	NC_017867	CATCG	2	10	76719	76728	20 %	20 %	20 %	40 %	387821650
46	NC_017867	CGGTC	2	10	79327	79336	0 %	20 %	40 %	40 %	387821652
47	NC_017867	GCACG	2	10	80128	80137	20 %	0 %	40 %	40 %	387821652
48	NC_017867	CGGTG	2	10	80718	80727	0 %	20 %	60 %	20 %	387821653
49	NC_017867	TCATT	2	10	81634	81643	20 %	60 %	0 %	20 %	387821653
50	NC_017867	CCAAA	2	10	82117	82126	60 %	0 %	0 %	40 %	387821654
51	NC_017867	CCGGG	2	10	82610	82619	0 %	0 %	60 %	40 %	387821655
52	NC_017867	CGAAC	2	10	89401	89410	40 %	0 %	20 %	40 %	387821659
53	NC_017867	GCTCG	2	10	90882	90891	0 %	20 %	40 %	40 %	387821661
54	NC_017867	GGTGC	2	10	96163	96172	0 %	20 %	60 %	20 %	387821666
55	NC_017867	GTCTT	2	10	102629	102638	0 %	60 %	20 %	20 %	387821671
56	NC_017867	GCGCC	2	10	106948	106957	0 %	0 %	40 %	60 %	387821673
57	NC_017867	GCCGC	2	10	107904	107913	0 %	0 %	40 %	60 %	387821674
58	NC_017867	CGGCG	2	10	115051	115060	0 %	0 %	60 %	40 %	387821681
59	NC_017867	TGGCG	2	10	115075	115084	0 %	20 %	60 %	20 %	387821681
60	NC_017867	ACGGC	2	10	115167	115176	20 %	0 %	40 %	40 %	387821681
61	NC_017867	GACGA	2	10	115223	115232	40 %	0 %	40 %	20 %	387821681
62	NC_017867	CCGAG	2	10	115449	115458	20 %	0 %	40 %	40 %	387821681
63	NC_017867	CGATT	2	10	115684	115693	20 %	40 %	20 %	20 %	387821681
64	NC_017867	ACCTG	2	10	116905	116914	20 %	20 %	20 %	40 %	387821682
65	NC_017867	GCCCG	2	10	117612	117621	0 %	0 %	40 %	60 %	387821682
66	NC_017867	AGTCG	2	10	117960	117969	20 %	20 %	40 %	20 %	387821682
67	NC_017867	TGGTG	2	10	121855	121864	0 %	40 %	60 %	0 %	387821685
68	NC_017867	GTTCG	2	10	123971	123980	0 %	40 %	40 %	20 %	387821687
69	NC_017867	TCGAA	2	10	125602	125611	40 %	20 %	20 %	20 %	387821688
70	NC_017867	TGGCA	2	10	128088	128097	20 %	20 %	40 %	20 %	387821692
71	NC_017867	GCCGA	2	10	128127	128136	20 %	0 %	40 %	40 %	387821692
72	NC_017867	TCGCG	2	10	129027	129036	0 %	20 %	40 %	40 %	387821693
73	NC_017867	CGCAT	2	10	135235	135244	20 %	20 %	20 %	40 %	387821698
74	NC_017867	TGCTC	2	10	139189	139198	0 %	40 %	20 %	40 %	387821703
75	NC_017867	CGGCT	2	10	141048	141057	0 %	20 %	40 %	40 %	387821705
76	NC_017867	TCTCA	2	10	144025	144034	20 %	40 %	0 %	40 %	387821708
77	NC_017867	CAAGA	2	10	147644	147653	60 %	0 %	20 %	20 %	387821712
78	NC_017867	GACAA	2	10	149868	149877	60 %	0 %	20 %	20 %	387821714
79	NC_017867	CCCGA	2	10	150045	150054	20 %	0 %	20 %	60 %	387821714
80	NC_017867	CGACG	2	10	152524	152533	20 %	0 %	40 %	40 %	387821716
81	NC_017867	GCACC	2	10	155958	155967	20 %	0 %	20 %	60 %	387821718
82	NC_017867	GCTCG	2	10	156863	156872	0 %	20 %	40 %	40 %	387821719
83	NC_017867	CGGCA	2	10	157523	157532	20 %	0 %	40 %	40 %	387821719
84	NC_017867	CGACC	2	10	158592	158601	20 %	0 %	20 %	60 %	387821720
85	NC_017867	GCTCG	2	10	158912	158921	0 %	20 %	40 %	40 %	387821721
86	NC_017867	CACCG	2	10	161606	161615	20 %	0 %	20 %	60 %	387821723
87	NC_017867	TGGCA	2	10	162248	162257	20 %	20 %	40 %	20 %	387821723
88	NC_017867	GCGCC	2	10	164849	164858	0 %	0 %	40 %	60 %	387821727
89	NC_017867	CCGCG	2	10	165533	165542	0 %	0 %	40 %	60 %	387821727
90	NC_017867	TGCCG	2	10	174261	174270	0 %	20 %	40 %	40 %	387821732
91	NC_017867	TGCCC	2	10	177031	177040	0 %	20 %	20 %	60 %	387821735
92	NC_017867	TGCGC	2	10	178043	178052	0 %	20 %	40 %	40 %	387821736
93	NC_017867	GCGTG	2	10	178656	178665	0 %	20 %	60 %	20 %	387821737
94	NC_017867	CCACG	2	10	179562	179571	20 %	0 %	20 %	60 %	387821737
95	NC_017867	CTCGC	2	10	184343	184352	0 %	20 %	20 %	60 %	387821741
96	NC_017867	CGCCA	2	10	185951	185960	20 %	0 %	20 %	60 %	387821742
97	NC_017867	CGTGG	2	10	186642	186651	0 %	20 %	60 %	20 %	387821742
98	NC_017867	TCGCC	2	10	188683	188692	0 %	20 %	20 %	60 %	387821743
99	NC_017867	GTTCT	2	10	191420	191429	0 %	60 %	20 %	20 %	387821746
100	NC_017867	CAGCG	2	10	193031	193040	20 %	0 %	40 %	40 %	387821748
101	NC_017867	ATGGC	2	10	193252	193261	20 %	20 %	40 %	20 %	387821748
102	NC_017867	GCTCG	2	10	193590	193599	0 %	20 %	40 %	40 %	387821749
103	NC_017867	TCGAA	2	10	194750	194759	40 %	20 %	20 %	20 %	387821749
104	NC_017867	GCGAG	2	10	194903	194912	20 %	0 %	60 %	20 %	387821749
105	NC_017867	CGGCG	2	10	196253	196262	0 %	0 %	60 %	40 %	387821750
106	NC_017867	TGCCG	2	10	196830	196839	0 %	20 %	40 %	40 %	387821750
107	NC_017867	TGTGT	2	10	198690	198699	0 %	60 %	40 %	0 %	387821751
108	NC_017867	TGCCC	2	10	198735	198744	0 %	20 %	20 %	60 %	387821751
109	NC_017867	GCCGC	2	10	202291	202300	0 %	0 %	40 %	60 %	387821755
110	NC_017867	ACTGC	2	10	202982	202991	20 %	20 %	20 %	40 %	387821755
111	NC_017867	TCGTC	2	10	205519	205528	0 %	40 %	20 %	40 %	387821757
112	NC_017867	GCGTG	2	10	206344	206353	0 %	20 %	60 %	20 %	387821757
113	NC_017867	TCGAC	2	10	207057	207066	20 %	20 %	20 %	40 %	387821758
114	NC_017867	GCCGG	2	10	210006	210015	0 %	0 %	60 %	40 %	387821759
115	NC_017867	CACGC	2	10	213193	213202	20 %	0 %	20 %	60 %	387821762
116	NC_017867	CCGTG	2	10	213831	213840	0 %	20 %	40 %	40 %	387821762
117	NC_017867	CGGAA	2	10	214880	214889	40 %	0 %	40 %	20 %	387821764
118	NC_017867	AAGAC	2	10	221028	221037	60 %	0 %	20 %	20 %	387821769
119	NC_017867	TGGCG	2	10	221885	221894	0 %	20 %	60 %	20 %	387821770
120	NC_017867	GGTGG	2	10	225517	225526	0 %	20 %	80 %	0 %	387821772
121	NC_017867	GCGCA	2	10	227064	227073	20 %	0 %	40 %	40 %	387821774
122	NC_017867	AGCAA	2	10	229334	229343	60 %	0 %	20 %	20 %	387821776
123	NC_017867	CGGCA	2	10	232270	232279	20 %	0 %	40 %	40 %	387821778
124	NC_017867	GCCCG	2	10	233159	233168	0 %	0 %	40 %	60 %	387821779
125	NC_017867	CGTGG	2	10	233849	233858	0 %	20 %	60 %	20 %	387821779
126	NC_017867	TGCTC	2	10	235218	235227	0 %	40 %	20 %	40 %	387821781
127	NC_017867	GGGGC	2	10	235762	235771	0 %	0 %	80 %	20 %	387821781
128	NC_017867	CGTTT	2	10	236151	236160	0 %	60 %	20 %	20 %	387821782
129	NC_017867	CTCAC	2	10	236472	236481	20 %	20 %	0 %	60 %	387821782
130	NC_017867	CTCGA	2	10	237219	237228	20 %	20 %	20 %	40 %	387821783
131	NC_017867	TCCGG	2	10	237274	237283	0 %	20 %	40 %	40 %	387821783
132	NC_017867	GCGCG	2	10	237594	237603	0 %	0 %	60 %	40 %	387821783
133	NC_017867	CTCGA	2	10	238141	238150	20 %	20 %	20 %	40 %	387821783
134	NC_017867	TCGTC	2	10	239051	239060	0 %	40 %	20 %	40 %	387821783
135	NC_017867	ACCCG	2	10	241961	241970	20 %	0 %	20 %	60 %	387821787
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254	NC_017867	TGCAT	2	10	411500	411509	20 %	40 %	20 %	20 %	387821916
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257	NC_017867	CGCCT	2	10	416403	416412	0 %	20 %	20 %	60 %	387821921
258	NC_017867	GCGCA	2	10	416613	416622	20 %	0 %	40 %	40 %	387821921
259	NC_017867	TTCGA	2	10	417540	417549	20 %	40 %	20 %	20 %	387821921
260	NC_017867	CGACC	2	10	418631	418640	20 %	0 %	20 %	60 %	387821923
261	NC_017867	TGCGA	2	10	419585	419594	20 %	20 %	40 %	20 %	387821924
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