MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07 chromosome

Total Repeats: 38090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017867	CGG	2	6	200114	200119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821753
4002	NC_017867	GAT	2	6	200207	200212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387821753
4003	NC_017867	CCG	2	6	200236	200241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821753
4004	NC_017867	ACA	2	6	200284	200289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387821753
4005	NC_017867	CTG	2	6	200312	200317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821753
4006	NC_017867	TGC	2	6	200338	200343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821753
4007	NC_017867	GTG	3	9	200367	200375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821753
4008	NC_017867	GCA	2	6	200383	200388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821753
4009	NC_017867	CG	3	6	200395	200400	0 %	0 %	50 %	50 %	387821753
4010	NC_017867	CGT	2	6	200414	200419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821753
4011	NC_017867	TGC	2	6	200443	200448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821753
4012	NC_017867	GC	3	6	200513	200518	0 %	0 %	50 %	50 %	387821753
4013	NC_017867	CGA	2	6	200519	200524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821753
4014	NC_017867	GCC	2	6	200526	200531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821753
4015	NC_017867	GC	4	8	200630	200637	0 %	0 %	50 %	50 %	387821754
4016	NC_017867	GCG	2	6	200691	200696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821754
4017	NC_017867	TGG	2	6	200707	200712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821754
4018	NC_017867	GCG	2	6	200761	200766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821754
4019	NC_017867	CGG	3	9	200788	200796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821754
4020	NC_017867	GCG	2	6	200797	200802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821754
4021	NC_017867	GCT	2	6	200804	200809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821754
4022	NC_017867	GGC	2	6	200812	200817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821754
4023	NC_017867	GC	3	6	200828	200833	0 %	0 %	50 %	50 %	387821754
4024	NC_017867	TGC	2	6	200857	200862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821754
4025	NC_017867	ACG	2	6	200928	200933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821754
4026	NC_017867	TCG	2	6	200958	200963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821754
4027	NC_017867	CGG	2	6	201020	201025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821754
4028	NC_017867	GCGT	2	8	201047	201054	0 %	25 %	50 %	25 %	387821754
4029	NC_017867	CCT	2	6	202058	202063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387821755
4030	NC_017867	AAG	2	6	202072	202077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387821755
4031	NC_017867	GTC	2	6	202092	202097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821755
4032	NC_017867	GTT	2	6	202140	202145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387821755
4033	NC_017867	TCA	2	6	202196	202201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821755
4034	NC_017867	TGG	2	6	202241	202246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821755
4035	NC_017867	TTC	2	6	202267	202272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387821755
4036	NC_017867	GCCGC	2	10	202291	202300	0 %	0 %	40 %	60 %	387821755
4037	NC_017867	CGT	2	6	202334	202339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821755
4038	NC_017867	TCG	2	6	202364	202369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821755
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4042	NC_017867	TCG	2	6	202595	202600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821755
4043	NC_017867	GATG	2	8	202617	202624	25 %	25 %	50 %	0 %	387821755
4044	NC_017867	GTT	2	6	202629	202634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387821755
4045	NC_017867	ACG	2	6	202669	202674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821755
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4047	NC_017867	GC	3	6	202711	202716	0 %	0 %	50 %	50 %	387821755
4048	NC_017867	TCG	2	6	202732	202737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821755
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4050	NC_017867	CGG	2	6	202815	202820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821755
4051	NC_017867	GAA	2	6	202830	202835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387821755
4052	NC_017867	GTC	2	6	202839	202844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821755
4053	NC_017867	CGT	2	6	202899	202904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821755
4054	NC_017867	GAC	2	6	202926	202931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821755
4055	NC_017867	CGG	2	6	202941	202946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821755
4056	NC_017867	GAC	2	6	202953	202958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821755
4057	NC_017867	TTC	2	6	202966	202971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387821755
4058	NC_017867	ACTGC	2	10	202982	202991	20 %	20 %	20 %	40 %	387821755
4059	NC_017867	TTG	2	6	203050	203055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387821755
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4061	NC_017867	CCGC	2	8	203158	203165	0 %	0 %	25 %	75 %	387821755
4062	NC_017867	CCG	2	6	203180	203185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821755
4063	NC_017867	CGC	2	6	203244	203249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821755
4064	NC_017867	GTG	2	6	203263	203268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821755
4065	NC_017867	CT	3	6	203313	203318	0 %	50 %	0 %	50 %	387821755
4066	NC_017867	GTG	2	6	203358	203363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821755
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4068	NC_017867	AGCG	2	8	203897	203904	25 %	0 %	50 %	25 %	387821756
4069	NC_017867	CAG	2	6	203912	203917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821756
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4072	NC_017867	CAT	2	6	203975	203980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821756
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4083	NC_017867	GC	3	6	204396	204401	0 %	0 %	50 %	50 %	387821756
4084	NC_017867	CGGG	2	8	204458	204465	0 %	0 %	75 %	25 %	387821756
4085	NC_017867	GGGCGC	2	12	204466	204477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821756
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4088	NC_017867	GC	4	8	204492	204499	0 %	0 %	50 %	50 %	387821756
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4093	NC_017867	AGT	2	6	204682	204687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387821757
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4101	NC_017867	AGC	3	9	205113	205121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821757
4102	NC_017867	GC	3	6	205120	205125	0 %	0 %	50 %	50 %	387821757
4103	NC_017867	GGAA	2	8	205137	205144	50 %	0 %	50 %	0 %	387821757
4104	NC_017867	GCG	2	6	205164	205169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821757
4105	NC_017867	GAG	2	6	205256	205261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387821757
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4107	NC_017867	GAG	2	6	205434	205439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387821757
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4109	NC_017867	TCGTC	2	10	205519	205528	0 %	40 %	20 %	40 %	387821757
4110	NC_017867	CGA	2	6	205544	205549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821757
4111	NC_017867	CGA	2	6	205553	205558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821757
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4117	NC_017867	GTT	2	6	205820	205825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387821757
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4119	NC_017867	GC	3	6	205957	205962	0 %	0 %	50 %	50 %	387821757
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4121	NC_017867	GA	3	6	205995	206000	50 %	0 %	50 %	0 %	387821757
4122	NC_017867	TCG	2	6	206001	206006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821757
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4229	NC_017867	TGGGCA	2	12	210645	210656	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387821760
4230	NC_017867	CGC	2	6	210697	210702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821760
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4232	NC_017867	ATG	2	6	210764	210769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387821760
4233	NC_017867	TCG	2	6	210825	210830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821760
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4236	NC_017867	CG	3	6	210907	210912	0 %	0 %	50 %	50 %	387821760
4237	NC_017867	GCA	2	6	210933	210938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821760
4238	NC_017867	GCTC	2	8	210993	211000	0 %	25 %	25 %	50 %	387821760
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4241	NC_017867	TGC	2	6	211113	211118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821760
4242	NC_017867	TGC	2	6	211154	211159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821760
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4358	NC_017867	AAC	2	6	216316	216321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387821765
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4481	NC_017867	TCG	2	6	222235	222240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821770
4482	NC_017867	CGG	2	6	222290	222295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821770
4483	NC_017867	CGG	2	6	222304	222309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821770
4484	NC_017867	GCC	2	6	222339	222344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821770
4485	NC_017867	GTT	2	6	222366	222371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387821770
4486	NC_017867	CGC	2	6	222380	222385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821770
4487	NC_017867	TCA	2	6	222397	222402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821770
4488	NC_017867	TCA	2	6	222409	222414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821770
4489	NC_017867	CTG	2	6	222489	222494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821770
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4491	NC_017867	CTCG	2	8	222572	222579	0 %	25 %	25 %	50 %	387821770
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4493	NC_017867	TCG	2	6	222664	222669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821770
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4496	NC_017867	CCTG	2	8	222754	222761	0 %	25 %	25 %	50 %	387821770
4497	NC_017867	GCTC	2	8	222766	222773	0 %	25 %	25 %	50 %	387821770
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4500	NC_017867	TCG	2	6	222835	222840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821770

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