MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 28634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017834	CAC	2	6	274	279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866199
2	NC_017834	GCC	2	6	406	411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
3	NC_017834	GGA	2	6	445	450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866199
4	NC_017834	GCC	2	6	482	487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
5	NC_017834	CGG	2	6	561	566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866199
6	NC_017834	GCC	2	6	627	632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
7	NC_017834	ACG	2	6	678	683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866199
8	NC_017834	CCG	2	6	750	755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
9	NC_017834	CGC	2	6	768	773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
10	NC_017834	CGG	2	6	958	963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866199
11	NC_017834	TCT	2	6	985	990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866199
12	NC_017834	TGC	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866199
13	NC_017834	CGA	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866199
14	NC_017834	CGG	2	6	1189	1194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866199
15	NC_017834	TTC	2	6	1217	1222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866199
16	NC_017834	GCC	2	6	1279	1284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
17	NC_017834	GGA	2	6	1294	1299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866199
18	NC_017834	GCC	2	6	1354	1359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866199
19	NC_017834	ACG	2	6	1425	1430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866199
20	NC_017834	CAA	2	6	1459	1464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866199
21	NC_017834	ACC	2	6	1518	1523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866199
22	NC_017834	CAC	2	6	1570	1575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866199
23	NC_017834	CAT	2	6	1600	1605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866199
24	NC_017834	CGA	2	6	1639	1644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866199
25	NC_017834	CGG	2	6	1753	1758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866199
26	NC_017834	AGC	2	6	1863	1868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866199
27	NC_017834	GAC	2	6	2533	2538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866200
28	NC_017834	CGT	2	6	2683	2688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866200
29	NC_017834	GCT	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866200
30	NC_017834	TGC	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866200
31	NC_017834	CCG	2	6	2730	2735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866200
32	NC_017834	GAC	2	6	2761	2766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866200
33	NC_017834	CGA	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866200
34	NC_017834	GCG	2	6	3056	3061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866200
35	NC_017834	CCG	2	6	3213	3218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866200
36	NC_017834	GCC	2	6	3284	3289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866200
37	NC_017834	TGG	2	6	3303	3308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866200
38	NC_017834	CAG	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866200
39	NC_017834	CGG	2	6	3367	3372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866200
40	NC_017834	GAC	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866200
41	NC_017834	GCA	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866200
42	NC_017834	GAG	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866200
43	NC_017834	TCG	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866201
44	NC_017834	TCG	2	6	3842	3847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866201
45	NC_017834	CCA	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866201
46	NC_017834	ACA	2	6	3911	3916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866201
47	NC_017834	ACC	2	6	3940	3945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866201
48	NC_017834	CGG	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866201
49	NC_017834	GCC	2	6	4114	4119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866201
50	NC_017834	GCT	2	6	4188	4193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866201
51	NC_017834	AGG	2	6	4211	4216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866201
52	NC_017834	GAG	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866201
53	NC_017834	CGT	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866201
54	NC_017834	CGA	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866201
55	NC_017834	GGC	2	6	4479	4484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866201
56	NC_017834	GAC	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866201
57	NC_017834	TCG	2	6	4603	4608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866201
58	NC_017834	GTG	2	6	4693	4698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866201
59	NC_017834	CGA	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866201
60	NC_017834	ATC	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866201
61	NC_017834	GCG	2	6	4789	4794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866201
62	NC_017834	GAC	2	6	4819	4824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866201
63	NC_017834	GGC	2	6	4848	4853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866201
64	NC_017834	GGC	2	6	4873	4878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866201
65	NC_017834	GCC	2	6	4939	4944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866201
66	NC_017834	CGA	2	6	5120	5125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866202
67	NC_017834	CGG	2	6	5187	5192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866202
68	NC_017834	GAG	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866202
69	NC_017834	CGA	2	6	5237	5242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866202
70	NC_017834	GTT	2	6	5258	5263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866202
71	NC_017834	ACC	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866202
72	NC_017834	ACG	2	6	5876	5881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
73	NC_017834	GAC	2	6	5890	5895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
74	NC_017834	CAC	2	6	6007	6012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866203
75	NC_017834	TCG	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866203
76	NC_017834	CGA	2	6	6042	6047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
77	NC_017834	CGA	2	6	6114	6119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
78	NC_017834	CGA	2	6	6138	6143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
79	NC_017834	CGG	2	6	6198	6203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866203
80	NC_017834	GGC	2	6	6214	6219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866203
81	NC_017834	CGG	2	6	6234	6239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866203
82	NC_017834	GGT	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866203
83	NC_017834	CTA	2	6	6312	6317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866203
84	NC_017834	CGA	3	9	6381	6389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
85	NC_017834	GAC	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
86	NC_017834	GCA	2	6	6467	6472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
87	NC_017834	CAG	2	6	6478	6483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
88	NC_017834	CGA	2	6	6537	6542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
89	NC_017834	GGA	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866203
90	NC_017834	CCA	2	6	6794	6799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866203
91	NC_017834	GGC	2	6	6805	6810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866203
92	NC_017834	GAG	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866203
93	NC_017834	TGA	2	6	7028	7033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866203
94	NC_017834	GAA	2	6	7077	7082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866203
95	NC_017834	CAT	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866203
96	NC_017834	GAA	2	6	7128	7133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866203
97	NC_017834	CGC	2	6	7150	7155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866203
98	NC_017834	CCG	2	6	7172	7177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866203
99	NC_017834	GGC	2	6	7258	7263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866203
100	NC_017834	CGG	3	9	7395	7403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866203
101	NC_017834	ATC	2	6	7450	7455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866203
102	NC_017834	TTC	2	6	7510	7515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866203
103	NC_017834	GCC	2	6	7563	7568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866203
104	NC_017834	ACC	2	6	7738	7743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866203
105	NC_017834	ACC	2	6	7754	7759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866203
106	NC_017834	CGA	2	6	7800	7805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
107	NC_017834	CGA	2	6	7827	7832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866203
108	NC_017834	CCG	2	6	7842	7847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866203
109	NC_017834	AAC	2	6	7983	7988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866204
110	NC_017834	CGA	2	6	8021	8026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866204
111	NC_017834	AGG	2	6	8068	8073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866204
112	NC_017834	ACA	2	6	8077	8082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866204
113	NC_017834	TGG	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866204
114	NC_017834	CCG	2	6	8225	8230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866204
115	NC_017834	CGG	2	6	8252	8257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866204
116	NC_017834	ACA	2	6	8278	8283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866204
117	NC_017834	ACC	2	6	8320	8325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866204
118	NC_017834	TCG	2	6	8395	8400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866204
119	NC_017834	CGA	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866204
120	NC_017834	CGG	2	6	8437	8442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866204
121	NC_017834	ACG	2	6	8536	8541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866204
122	NC_017834	TGC	2	6	8563	8568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866204
123	NC_017834	TCC	2	6	8636	8641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866204
124	NC_017834	ACC	2	6	8686	8691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866204
125	NC_017834	GAG	2	6	8706	8711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866204
126	NC_017834	CGA	2	6	8764	8769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866204
127	NC_017834	TCA	2	6	8818	8823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866204
128	NC_017834	GAG	2	6	8847	8852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866204
129	NC_017834	GTC	2	6	8874	8879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866204
130	NC_017834	CGA	2	6	8975	8980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866204
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132	NC_017834	AAC	2	6	9051	9056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866204
133	NC_017834	CAG	2	6	9078	9083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866204
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153	NC_017834	CTT	2	6	9737	9742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866204
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164	NC_017834	CGA	2	6	10208	10213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866204
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252	NC_017834	TGA	2	6	16012	16017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866209
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254	NC_017834	GCA	3	9	16183	16191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866209
255	NC_017834	CAG	2	6	16259	16264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866209
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258	NC_017834	CAT	2	6	16481	16486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866209
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500	NC_017834	TCC	2	6	41876	41881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866236

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