MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 37736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017834	GCG	2	6	205214	205219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866369
4003	NC_017834	CTG	2	6	205222	205227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866369
4004	NC_017834	GGC	2	6	205229	205234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866369
4005	NC_017834	GC	3	6	205245	205250	0 %	0 %	50 %	50 %	386866369
4006	NC_017834	TGC	2	6	205274	205279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866369
4007	NC_017834	ACG	2	6	205345	205350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866369
4008	NC_017834	CGT	2	6	205359	205364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866369
4009	NC_017834	TCG	2	6	205375	205380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866369
4010	NC_017834	CGG	2	6	205437	205442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866369
4011	NC_017834	TAG	2	6	205459	205464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866369
4012	NC_017834	TG	3	6	205835	205840	0 %	50 %	50 %	0 %	386866370
4013	NC_017834	ATG	2	6	205871	205876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866370
4014	NC_017834	TGA	2	6	205896	205901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866370
4015	NC_017834	GCT	2	6	205941	205946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866370
4016	NC_017834	TGC	2	6	205949	205954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866370
4017	NC_017834	GCAA	2	8	205976	205983	50 %	0 %	25 %	25 %	386866370
4018	NC_017834	CGG	2	6	205994	205999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866370
4019	NC_017834	GCC	2	6	206007	206012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866370
4020	NC_017834	AG	3	6	206021	206026	50 %	0 %	50 %	0 %	386866370
4021	NC_017834	AGA	3	9	206030	206038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866370
4022	NC_017834	AAG	2	6	206039	206044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866370
4023	NC_017834	GCGG	2	8	206527	206534	0 %	0 %	75 %	25 %	386866371
4024	NC_017834	CAG	2	6	206548	206553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866371
4025	NC_017834	GGA	2	6	206584	206589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866371
4026	NC_017834	GGC	2	6	206605	206610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866371
4027	NC_017834	CAT	2	6	206611	206616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866371
4028	NC_017834	GCT	2	6	206709	206714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866371
4029	NC_017834	GGGC	2	8	206715	206722	0 %	0 %	75 %	25 %	386866371
4030	NC_017834	CGA	2	6	206764	206769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866371
4031	NC_017834	ACG	2	6	206774	206779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866371
4032	NC_017834	CTC	2	6	206800	206805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866371
4033	NC_017834	GTG	2	6	206855	206860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866371
4034	NC_017834	GCA	2	6	206910	206915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866371
4035	NC_017834	TCG	2	6	206918	206923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866371
4036	NC_017834	CGG	2	6	206936	206941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866371
4037	NC_017834	AGG	2	6	207114	207119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866371
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4039	NC_017834	GCG	2	6	207143	207148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866371
4040	NC_017834	GGA	2	6	207154	207159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866371
4041	NC_017834	CAG	2	6	207187	207192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866372
4042	NC_017834	GCA	2	6	207249	207254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866372
4043	NC_017834	AGT	2	6	207312	207317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866372
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4045	NC_017834	GAA	2	6	207517	207522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866372
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4050	NC_017834	ACC	2	6	207737	207742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866372
4051	NC_017834	AGC	3	9	207743	207751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866372
4052	NC_017834	CACC	2	8	207753	207760	25 %	0 %	0 %	75 %	386866372
4053	NC_017834	GGAA	2	8	207767	207774	50 %	0 %	50 %	0 %	386866372
4054	NC_017834	GCG	2	6	207794	207799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866372
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4057	NC_017834	GAG	2	6	208064	208069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866372
4058	NC_017834	CGC	2	6	208102	208107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866372
4059	NC_017834	CGA	2	6	208174	208179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866372
4060	NC_017834	CGA	2	6	208183	208188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866372
4061	NC_017834	CGT	2	6	208257	208262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866372
4062	NC_017834	GTC	2	6	208300	208305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866372
4063	NC_017834	TGA	2	6	208326	208331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866372
4064	NC_017834	CGG	2	6	208341	208346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866372
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4069	NC_017834	GC	3	6	208587	208592	0 %	0 %	50 %	50 %	386866372
4070	NC_017834	GGC	2	6	208618	208623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866372
4071	NC_017834	GTC	2	6	208630	208635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866372
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4080	NC_017834	GTA	2	6	208963	208968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866372
4081	NC_017834	GCGTG	2	10	208974	208983	0 %	20 %	60 %	20 %	386866372
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4088	NC_017834	GGC	2	6	209044	209049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866372
4089	NC_017834	GTA	2	6	209050	209055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866372
4090	NC_017834	CG	3	6	209125	209130	0 %	0 %	50 %	50 %	386866372
4091	NC_017834	CCA	2	6	209139	209144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866372
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4094	NC_017834	TTC	2	6	209225	209230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866372
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4100	NC_017834	CTC	2	6	209505	209510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866373
4101	NC_017834	CCG	2	6	209567	209572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866373
4102	NC_017834	GTT	2	6	209592	209597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866373
4103	NC_017834	TCGAC	2	10	209687	209696	20 %	20 %	20 %	40 %	386866373
4104	NC_017834	TCA	2	6	209699	209704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866373
4105	NC_017834	GAT	4	12	209709	209720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866373
4106	NC_017834	CGA	2	6	209777	209782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866373
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4108	NC_017834	GCG	2	6	209877	209882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866373
4109	NC_017834	CGA	2	6	209975	209980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866373
4110	NC_017834	GGT	2	6	210014	210019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866373
4111	NC_017834	CAC	2	6	210042	210047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866373
4112	NC_017834	GAA	2	6	210057	210062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866373
4113	NC_017834	GAGCAT	2	12	210084	210095	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386866373
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4116	NC_017834	GC	3	6	210182	210187	0 %	0 %	50 %	50 %	386866373
4117	NC_017834	CAT	2	6	210201	210206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866373
4118	NC_017834	GCA	2	6	210242	210247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866373
4119	NC_017834	CGA	3	9	210257	210265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866373
4120	NC_017834	CATG	2	8	210278	210285	25 %	25 %	25 %	25 %	386866373
4121	NC_017834	AGCG	2	8	210321	210328	25 %	0 %	50 %	25 %	386866373
4122	NC_017834	GCC	2	6	210420	210425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866373
4123	NC_017834	CAG	3	9	210435	210443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866373
4124	NC_017834	TCG	2	6	210467	210472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866373
4125	NC_017834	CCCA	2	8	210541	210548	25 %	0 %	0 %	75 %	386866373
4126	NC_017834	GCG	2	6	210569	210574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866373
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4133	NC_017834	TGCG	2	8	210959	210966	0 %	25 %	50 %	25 %	386866373
4134	NC_017834	CGT	2	6	210996	211001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866373
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4142	NC_017834	GGC	2	6	211455	211460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866373
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4232	NC_017834	CACGC	2	10	215823	215832	20 %	0 %	20 %	60 %	386866377
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4237	NC_017834	TCG	2	6	215963	215968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866377
4238	NC_017834	CCAGC	2	10	215973	215982	20 %	0 %	20 %	60 %	386866377
4239	NC_017834	TCT	2	6	215987	215992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866377
4240	NC_017834	GCT	2	6	216005	216010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866377
4241	NC_017834	TGA	2	6	216020	216025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866377
4242	NC_017834	CTT	2	6	216060	216065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866377
4243	NC_017834	CTC	2	6	216118	216123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866377
4244	NC_017834	CGT	2	6	216167	216172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866377
4245	NC_017834	GAT	2	6	216240	216245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866377
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4264	NC_017834	TGCGGC	2	12	216825	216836	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386866377
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4269	NC_017834	CGT	2	6	217223	217228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866378
4270	NC_017834	GAT	2	6	217308	217313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866378
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4272	NC_017834	GC	3	6	217373	217378	0 %	0 %	50 %	50 %	386866378
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4334	NC_017834	TCAGC	2	10	220545	220554	20 %	20 %	20 %	40 %	386866382
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4344	NC_017834	TCGGC	2	10	221339	221348	0 %	20 %	40 %	40 %	386866383
4345	NC_017834	GAT	2	6	221352	221357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866383
4346	NC_017834	GCT	2	6	221374	221379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866383
4347	NC_017834	CT	4	8	221392	221399	0 %	50 %	0 %	50 %	386866383
4348	NC_017834	CGACC	2	10	221492	221501	20 %	0 %	20 %	60 %	386866383
4349	NC_017834	AAGA	2	8	221518	221525	75 %	0 %	25 %	0 %	386866383
4350	NC_017834	GGC	2	6	221535	221540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866383
4351	NC_017834	CGC	2	6	221556	221561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866383
4352	NC_017834	TGGC	2	8	221570	221577	0 %	25 %	50 %	25 %	386866383
4353	NC_017834	CGA	2	6	221655	221660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866383
4354	NC_017834	GGC	3	9	221697	221705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866383
4355	NC_017834	CGC	2	6	221829	221834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866383
4356	NC_017834	TTG	2	6	222005	222010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866383
4357	NC_017834	GGC	2	6	222018	222023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866383
4358	NC_017834	GAT	2	6	222093	222098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866383
4359	NC_017834	ATTC	2	8	222112	222119	25 %	50 %	0 %	25 %	386866383
4360	NC_017834	TCGG	2	8	222287	222294	0 %	25 %	50 %	25 %	386866384
4361	NC_017834	AAC	2	6	222330	222335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866384
4362	NC_017834	GCA	2	6	222473	222478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866384
4363	NC_017834	GTT	2	6	222485	222490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866384
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4368	NC_017834	GCTC	2	8	222872	222879	0 %	25 %	25 %	50 %	386866385
4369	NC_017834	GC	3	6	222908	222913	0 %	0 %	50 %	50 %	386866385
4370	NC_017834	ACG	2	6	222919	222924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866385
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4392	NC_017834	CGC	2	6	223699	223704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866388
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4471	NC_017834	CG	4	8	229971	229978	0 %	0 %	50 %	50 %	386866392
4472	NC_017834	CGCA	2	8	230047	230054	25 %	0 %	25 %	50 %	386866392
4473	NC_017834	GCT	2	6	230058	230063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866392
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4476	NC_017834	CCG	2	6	230323	230328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866393
4477	NC_017834	GCC	2	6	230337	230342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866393
4478	NC_017834	GCG	2	6	230427	230432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866393
4479	NC_017834	GCT	2	6	230434	230439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866393
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4481	NC_017834	CAG	2	6	230594	230599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866393
4482	NC_017834	CGA	2	6	230600	230605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866393
4483	NC_017834	TA	3	6	230675	230680	50 %	50 %	0 %	0 %	386866393
4484	NC_017834	CCA	2	6	230749	230754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866393
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4486	NC_017834	ACC	3	9	230787	230795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866393
4487	NC_017834	GCC	2	6	230813	230818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866393
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