MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 37736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017834	GTGG	2	8	157464	157471	0 %	25 %	75 %	0 %	386866336
3003	NC_017834	CG	3	6	157493	157498	0 %	0 %	50 %	50 %	386866336
3004	NC_017834	AGG	2	6	157526	157531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866336
3005	NC_017834	CAT	2	6	157584	157589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866336
3006	NC_017834	GCG	2	6	157652	157657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866336
3007	NC_017834	ATC	2	6	157660	157665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866336
3008	NC_017834	ATC	2	6	157714	157719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866336
3009	NC_017834	ACA	2	6	157748	157753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866336
3010	NC_017834	GCTCG	2	10	157857	157866	0 %	20 %	40 %	40 %	386866336
3011	NC_017834	CTC	2	6	157906	157911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866336
3012	NC_017834	GAT	2	6	157920	157925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866336
3013	NC_017834	TCG	3	9	157958	157966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866336
3014	NC_017834	GCT	2	6	157991	157996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866336
3015	NC_017834	GAG	2	6	157999	158004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866336
3016	NC_017834	GCC	2	6	158049	158054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866336
3017	NC_017834	CTA	2	6	158073	158078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866336
3018	NC_017834	TCG	2	6	158084	158089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866336
3019	NC_017834	ATG	2	6	158101	158106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866336
3020	NC_017834	GAT	2	6	158118	158123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866336
3021	NC_017834	GGC	2	6	158190	158195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866336
3022	NC_017834	ATC	2	6	158200	158205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866336
3023	NC_017834	CCA	2	6	158207	158212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866336
3024	NC_017834	TCG	2	6	158228	158233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866336
3025	NC_017834	CGC	2	6	158244	158249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866336
3026	NC_017834	ACCG	2	8	158269	158276	25 %	0 %	25 %	50 %	386866336
3027	NC_017834	TTC	2	6	158347	158352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866336
3028	NC_017834	AT	3	6	158368	158373	50 %	50 %	0 %	0 %	386866336
3029	NC_017834	CGC	2	6	158379	158384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866336
3030	NC_017834	TGC	2	6	158444	158449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866336
3031	NC_017834	GAAG	2	8	158457	158464	50 %	0 %	50 %	0 %	386866336
3032	NC_017834	CTCG	2	8	158532	158539	0 %	25 %	25 %	50 %	386866336
3033	NC_017834	CCA	2	6	158573	158578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866336
3034	NC_017834	CCG	2	6	158582	158587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866336
3035	NC_017834	GATCGT	2	12	158616	158627	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386866336
3036	NC_017834	CGC	2	6	158631	158636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866336
3037	NC_017834	TCA	2	6	158645	158650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866336
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3039	NC_017834	CGA	2	6	158875	158880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3040	NC_017834	GCA	2	6	158901	158906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3041	NC_017834	CTG	2	6	158915	158920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3042	NC_017834	GTATC	2	10	159043	159052	20 %	40 %	20 %	20 %	386866337
3043	NC_017834	TCA	2	6	159060	159065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866337
3044	NC_017834	TCG	2	6	159099	159104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3045	NC_017834	GCA	2	6	159109	159114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866337
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3047	NC_017834	GC	3	6	159368	159373	0 %	0 %	50 %	50 %	386866337
3048	NC_017834	ACA	2	6	159454	159459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866337
3049	NC_017834	GCG	2	6	159466	159471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866337
3050	NC_017834	CGCAT	2	10	159524	159533	20 %	20 %	20 %	40 %	386866337
3051	NC_017834	GGAG	2	8	159543	159550	25 %	0 %	75 %	0 %	386866337
3052	NC_017834	CGG	2	6	159562	159567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866337
3053	NC_017834	GGATTC	2	12	159571	159582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386866337
3054	NC_017834	CGT	2	6	159708	159713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3055	NC_017834	TTC	2	6	159755	159760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866337
3056	NC_017834	CAG	2	6	159794	159799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3057	NC_017834	CATG	2	8	159802	159809	25 %	25 %	25 %	25 %	386866337
3058	NC_017834	CTG	2	6	159902	159907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3059	NC_017834	TGC	2	6	159937	159942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3060	NC_017834	GCC	2	6	160010	160015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866337
3061	NC_017834	CAA	2	6	160018	160023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866337
3062	NC_017834	TGC	2	6	160182	160187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3063	NC_017834	TGA	2	6	160207	160212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866337
3064	NC_017834	TTC	2	6	160239	160244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866337
3065	NC_017834	GCA	2	6	160264	160269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866337
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3067	NC_017834	GGGAT	2	10	160321	160330	20 %	20 %	60 %	0 %	386866337
3068	NC_017834	AGA	2	6	160404	160409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866337
3069	NC_017834	GGC	2	6	160465	160470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866337
3070	NC_017834	GAT	2	6	160506	160511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866337
3071	NC_017834	CGA	2	6	160523	160528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866338
3072	NC_017834	TGA	2	6	160608	160613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866338
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3078	NC_017834	GCA	2	6	160734	160739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866338
3079	NC_017834	TGA	2	6	160785	160790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866338
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3081	NC_017834	TGCCG	2	10	160843	160852	0 %	20 %	40 %	40 %	386866338
3082	NC_017834	TGCG	2	8	160880	160887	0 %	25 %	50 %	25 %	386866338
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3085	NC_017834	GTC	2	6	160915	160920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866338
3086	NC_017834	GCC	2	6	160970	160975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866338
3087	NC_017834	AT	3	6	161007	161012	50 %	50 %	0 %	0 %	386866338
3088	NC_017834	CGTG	2	8	161091	161098	0 %	25 %	50 %	25 %	386866338
3089	NC_017834	GCC	2	6	161106	161111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866338
3090	NC_017834	GACC	2	8	161115	161122	25 %	0 %	25 %	50 %	386866338
3091	NC_017834	GCG	2	6	161153	161158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866338
3092	NC_017834	CAT	2	6	161178	161183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866338
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3094	NC_017834	GTC	2	6	161328	161333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866338
3095	NC_017834	GCC	2	6	161337	161342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866338
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3099	NC_017834	CATG	2	8	161544	161551	25 %	25 %	25 %	25 %	386866338
3100	NC_017834	TGC	2	6	161552	161557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866338
3101	NC_017834	GGC	2	6	161569	161574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866338
3102	NC_017834	TC	3	6	161606	161611	0 %	50 %	0 %	50 %	386866338
3103	NC_017834	TGA	2	6	161613	161618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866338
3104	NC_017834	AGA	2	6	161676	161681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866338
3105	NC_017834	GAC	2	6	161695	161700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866338
3106	NC_017834	GGA	2	6	161712	161717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866338
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3109	NC_017834	CAT	2	6	161775	161780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866338
3110	NC_017834	TGC	2	6	161836	161841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866338
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3113	NC_017834	CAG	2	6	161899	161904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866338
3114	NC_017834	CAA	2	6	161949	161954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866338
3115	NC_017834	TGC	2	6	161978	161983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866338
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3117	NC_017834	TGC	2	6	162194	162199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866338
3118	NC_017834	CGA	2	6	162272	162277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866338
3119	NC_017834	GTG	2	6	162300	162305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866338
3120	NC_017834	CGA	2	6	162324	162329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866338
3121	NC_017834	GCAA	2	8	162350	162357	50 %	0 %	25 %	25 %	386866338
3122	NC_017834	TTCCGC	2	12	162358	162369	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386866338
3123	NC_017834	CGC	2	6	162395	162400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866338
3124	NC_017834	GCG	3	9	162413	162421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866338
3125	NC_017834	GAC	2	6	162436	162441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866338
3126	NC_017834	CAA	2	6	162486	162491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866338
3127	NC_017834	CGATG	2	10	162495	162504	20 %	20 %	40 %	20 %	386866338
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3130	NC_017834	AAGA	2	8	162846	162853	75 %	0 %	25 %	0 %	386866339
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3132	NC_017834	CGG	2	6	163196	163201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866340
3133	NC_017834	CGA	2	6	163256	163261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866340
3134	NC_017834	CGGC	2	8	163289	163296	0 %	0 %	50 %	50 %	386866340
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3138	NC_017834	TCG	2	6	163462	163467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866340
3139	NC_017834	GAT	2	6	163476	163481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866340
3140	NC_017834	TCG	2	6	163483	163488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866340
3141	NC_017834	ACT	2	6	163523	163528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866340
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3148	NC_017834	CGACC	2	10	163716	163725	20 %	0 %	20 %	60 %	386866340
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3151	NC_017834	CGA	2	6	163835	163840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866341
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3154	NC_017834	GCTCG	2	10	163940	163949	0 %	20 %	40 %	40 %	386866341
3155	NC_017834	GC	3	6	163959	163964	0 %	0 %	50 %	50 %	386866341
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3159	NC_017834	GGC	2	6	164094	164099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866341
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3222	NC_017834	CGC	2	6	166879	166884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866342
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3227	NC_017834	GCT	2	6	167023	167028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866342
3228	NC_017834	CG	3	6	167039	167044	0 %	0 %	50 %	50 %	386866342
3229	NC_017834	CGC	2	6	167074	167079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866342
3230	NC_017834	ACGT	2	8	167120	167127	25 %	25 %	25 %	25 %	386866342
3231	NC_017834	CGG	2	6	167184	167189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866342
3232	NC_017834	GCC	2	6	167198	167203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866342
3233	NC_017834	GTG	2	6	167210	167215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866342
3234	NC_017834	CGC	2	6	167227	167232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866342
3235	NC_017834	TCC	2	6	167237	167242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866342
3236	NC_017834	TGC	2	6	167244	167249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866342
3237	NC_017834	GCG	2	6	167321	167326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866342
3238	NC_017834	ATT	2	6	167365	167370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386866342
3239	NC_017834	CGC	2	6	167371	167376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866342
3240	NC_017834	CGG	2	6	167380	167385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866342
3241	NC_017834	TCGC	2	8	167408	167415	0 %	25 %	25 %	50 %	386866342
3242	NC_017834	GCA	2	6	167449	167454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866342
3243	NC_017834	TGC	2	6	167475	167480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866342
3244	NC_017834	CGT	3	9	167512	167520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866342
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3260	NC_017834	TTC	2	6	168272	168277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866343
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3263	NC_017834	GCCC	2	8	168344	168351	0 %	0 %	25 %	75 %	386866343
3264	NC_017834	GCTC	2	8	168357	168364	0 %	25 %	25 %	50 %	386866343
3265	NC_017834	TCG	2	6	168408	168413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866343
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3348	NC_017834	CG	3	6	172398	172403	0 %	0 %	50 %	50 %	386866345
3349	NC_017834	CAA	2	6	172411	172416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866345
3350	NC_017834	TGC	2	6	172422	172427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866345
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3353	NC_017834	GCTCG	2	10	172534	172543	0 %	20 %	40 %	40 %	386866345
3354	NC_017834	GTT	2	6	172558	172563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866345
3355	NC_017834	GCA	2	6	172564	172569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866345
3356	NC_017834	CAC	2	6	172612	172617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866345
3357	NC_017834	CGC	2	6	172635	172640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866345
3358	NC_017834	GTG	2	6	172697	172702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866345
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3360	NC_017834	TGACT	2	10	173413	173422	20 %	40 %	20 %	20 %	386866346
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3475	NC_017834	CGA	2	6	179030	179035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866349
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3480	NC_017834	CGA	2	6	179135	179140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866349
3481	NC_017834	CCG	2	6	179233	179238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866349
3482	NC_017834	TCACCG	2	12	179251	179262	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386866349
3483	NC_017834	CGTG	2	8	179273	179280	0 %	25 %	50 %	25 %	386866349
3484	NC_017834	CGA	2	6	179306	179311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866349
3485	NC_017834	GCT	2	6	179342	179347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866349
3486	NC_017834	CGC	3	9	179408	179416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866349
3487	NC_017834	TGC	2	6	179422	179427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866349
3488	NC_017834	GT	3	6	179768	179773	0 %	50 %	50 %	0 %	386866350
3489	NC_017834	CG	3	6	179828	179833	0 %	0 %	50 %	50 %	386866350
3490	NC_017834	TGC	2	6	179840	179845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866350
3491	NC_017834	GC	3	6	179851	179856	0 %	0 %	50 %	50 %	386866350
3492	NC_017834	TCGC	2	8	179890	179897	0 %	25 %	25 %	50 %	386866350
3493	NC_017834	CGCGCA	2	12	179903	179914	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386866350
3494	NC_017834	GCT	2	6	179946	179951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866350
3495	NC_017834	CAT	2	6	179967	179972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866350
3496	NC_017834	ACT	2	6	180014	180019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866350
3497	NC_017834	GCT	2	6	180021	180026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866350
3498	NC_017834	GAC	2	6	180049	180054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866350
3499	NC_017834	GCT	4	12	180102	180113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866350
3500	NC_017834	TGA	2	6	180146	180151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866350

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