MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 37736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017834	GCAG	2	8	28022	28029	25 %	0 %	50 %	25 %	386866220
502	NC_017834	CAT	2	6	28107	28112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866220
503	NC_017834	TTC	2	6	28114	28119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866220
504	NC_017834	AATC	2	8	28156	28163	50 %	25 %	0 %	25 %	386866220
505	NC_017834	AGC	2	6	28372	28377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866220
506	NC_017834	AGC	2	6	28443	28448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866220
507	NC_017834	CGA	2	6	28502	28507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866220
508	NC_017834	CGT	2	6	28523	28528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866220
509	NC_017834	GACT	2	8	28533	28540	25 %	25 %	25 %	25 %	386866220
510	NC_017834	GAT	2	6	28724	28729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866221
511	NC_017834	TCC	2	6	28735	28740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866221
512	NC_017834	TTC	2	6	28759	28764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866221
513	NC_017834	TGC	3	9	28807	28815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866221
514	NC_017834	GCCA	2	8	28819	28826	25 %	0 %	25 %	50 %	386866221
515	NC_017834	TCG	2	6	28837	28842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866221
516	NC_017834	TGA	3	9	28907	28915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866221
517	NC_017834	GGC	2	6	28935	28940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866221
518	NC_017834	TCG	2	6	28957	28962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866221
519	NC_017834	TGCAG	2	10	28980	28989	20 %	20 %	40 %	20 %	386866221
520	NC_017834	TCA	2	6	29051	29056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866221
521	NC_017834	AATG	2	8	29085	29092	50 %	25 %	25 %	0 %	386866221
522	NC_017834	CTT	2	6	29114	29119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866221
523	NC_017834	GAG	2	6	29160	29165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866221
524	NC_017834	TGAG	2	8	29245	29252	25 %	25 %	50 %	0 %	386866222
525	NC_017834	GAT	2	6	29315	29320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866222
526	NC_017834	CG	3	6	29364	29369	0 %	0 %	50 %	50 %	386866222
527	NC_017834	TC	3	6	29414	29419	0 %	50 %	0 %	50 %	386866222
528	NC_017834	GGT	2	6	29481	29486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866222
529	NC_017834	TCG	2	6	29494	29499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866222
530	NC_017834	TCG	2	6	29512	29517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866222
531	NC_017834	TCG	2	6	29581	29586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866222
532	NC_017834	TCA	2	6	29666	29671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866222
533	NC_017834	AGC	2	6	30055	30060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866223
534	NC_017834	GCG	2	6	30075	30080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866223
535	NC_017834	GTA	3	9	30110	30118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866223
536	NC_017834	CAC	2	6	30131	30136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866223
537	NC_017834	TGAG	2	8	30139	30146	25 %	25 %	50 %	0 %	386866223
538	NC_017834	GGC	2	6	30173	30178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866223
539	NC_017834	GGTG	2	8	30185	30192	0 %	25 %	75 %	0 %	386866223
540	NC_017834	TCG	2	6	30213	30218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866223
541	NC_017834	GC	4	8	30224	30231	0 %	0 %	50 %	50 %	386866223
542	NC_017834	AGCC	2	8	30252	30259	25 %	0 %	25 %	50 %	386866223
543	NC_017834	GAA	2	6	30287	30292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866223
544	NC_017834	GAT	2	6	30338	30343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866223
545	NC_017834	GTG	2	6	30360	30365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866223
546	NC_017834	ATG	2	6	30399	30404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866223
547	NC_017834	CAG	2	6	30407	30412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866223
548	NC_017834	TGC	2	6	30464	30469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866224
549	NC_017834	CTG	2	6	30482	30487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866224
550	NC_017834	TTTC	2	8	30530	30537	0 %	75 %	0 %	25 %	386866224
551	NC_017834	CCTT	2	8	30539	30546	0 %	50 %	0 %	50 %	386866224
552	NC_017834	GCG	2	6	30551	30556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866224
553	NC_017834	GC	4	8	30624	30631	0 %	0 %	50 %	50 %	386866224
554	NC_017834	TGC	2	6	31668	31673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866225
555	NC_017834	CGG	2	6	31723	31728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866225
556	NC_017834	GC	3	6	31752	31757	0 %	0 %	50 %	50 %	386866225
557	NC_017834	TCG	2	6	31814	31819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866225
558	NC_017834	GACG	2	8	32202	32209	25 %	0 %	50 %	25 %	386866226
559	NC_017834	AGG	2	6	32240	32245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866226
560	NC_017834	GGA	2	6	32265	32270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866226
561	NC_017834	GCC	2	6	32276	32281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866226
562	NC_017834	GAC	2	6	32299	32304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866226
563	NC_017834	CAT	2	6	32364	32369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866226
564	NC_017834	GGC	2	6	32389	32394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866226
565	NC_017834	GCGG	2	8	32545	32552	0 %	0 %	75 %	25 %	386866227
566	NC_017834	TCT	2	6	32604	32609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866227
567	NC_017834	CGG	2	6	32628	32633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866227
568	NC_017834	GGC	2	6	32643	32648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866227
569	NC_017834	ACC	2	6	32649	32654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866227
570	NC_017834	ACC	2	6	32663	32668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866227
571	NC_017834	CAG	2	6	32695	32700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866227
572	NC_017834	AGGT	2	8	32717	32724	25 %	25 %	50 %	0 %	386866227
573	NC_017834	CAC	2	6	32749	32754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866227
574	NC_017834	CAG	2	6	32786	32791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866227
575	NC_017834	CGG	2	6	32793	32798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866227
576	NC_017834	CGG	2	6	32804	32809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866227
577	NC_017834	GCC	2	6	32834	32839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866227
578	NC_017834	CGC	2	6	32874	32879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866227
579	NC_017834	TTC	3	9	32966	32974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866227
580	NC_017834	G	6	6	33464	33469	0 %	0 %	100 %	0 %	386866228
581	NC_017834	GCT	2	6	33480	33485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866228
582	NC_017834	CG	3	6	33521	33526	0 %	0 %	50 %	50 %	386866228
583	NC_017834	CGA	2	6	33534	33539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866228
584	NC_017834	CAG	2	6	33551	33556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866228
585	NC_017834	TCG	2	6	33668	33673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866228
586	NC_017834	GAC	2	6	33681	33686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866228
587	NC_017834	GTG	2	6	33709	33714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866228
588	NC_017834	TGG	2	6	33717	33722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866228
589	NC_017834	ACGT	2	8	33781	33788	25 %	25 %	25 %	25 %	386866228
590	NC_017834	GGC	2	6	33803	33808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866228
591	NC_017834	CCA	2	6	33824	33829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866228
592	NC_017834	GAT	2	6	33889	33894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866228
593	NC_017834	A	6	6	33928	33933	100 %	0 %	0 %	0 %	386866228
594	NC_017834	AGACA	2	10	33945	33954	60 %	0 %	20 %	20 %	386866228
595	NC_017834	GAC	2	6	33955	33960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866228
596	NC_017834	TGA	2	6	34017	34022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866228
597	NC_017834	ACA	2	6	34092	34097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866228
598	NC_017834	GTC	2	6	34102	34107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866228
599	NC_017834	CAT	2	6	34132	34137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866228
600	NC_017834	GAT	2	6	34204	34209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866228
601	NC_017834	CAA	2	6	34227	34232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866228
602	NC_017834	CAT	2	6	34233	34238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866228
603	NC_017834	CAA	2	6	34311	34316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866228
604	NC_017834	CGG	2	6	34443	34448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866228
605	NC_017834	CGCATG	2	12	34475	34486	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386866228
606	NC_017834	TCC	2	6	34567	34572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866228
607	NC_017834	AGG	2	6	34682	34687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866228
608	NC_017834	GCGG	2	8	34709	34716	0 %	0 %	75 %	25 %	386866228
609	NC_017834	CGG	2	6	34857	34862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866228
610	NC_017834	GAA	2	6	34866	34871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866228
611	NC_017834	CGA	2	6	34989	34994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866228
612	NC_017834	A	6	6	35066	35071	100 %	0 %	0 %	0 %	386866228
613	NC_017834	GAT	2	6	35248	35253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866228
614	NC_017834	GTTC	2	8	35316	35323	0 %	50 %	25 %	25 %	386866228
615	NC_017834	GTG	2	6	35347	35352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866228
616	NC_017834	GAC	2	6	35391	35396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866228
617	NC_017834	GTT	2	6	35505	35510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866228
618	NC_017834	GGCA	2	8	35543	35550	25 %	0 %	50 %	25 %	386866228
619	NC_017834	CGG	2	6	35628	35633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866228
620	NC_017834	CGA	2	6	35798	35803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866228
621	NC_017834	GGA	2	6	35848	35853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866228
622	NC_017834	GGC	2	6	35862	35867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866228
623	NC_017834	TG	4	8	35885	35892	0 %	50 %	50 %	0 %	386866228
624	NC_017834	CCG	2	6	35928	35933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866228
625	NC_017834	CAT	2	6	36081	36086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866229
626	NC_017834	TAGA	2	8	36105	36112	50 %	25 %	25 %	0 %	386866229
627	NC_017834	TGA	2	6	36122	36127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866229
628	NC_017834	CAT	2	6	36355	36360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866230
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642	NC_017834	CAT	2	6	37985	37990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866231
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663	NC_017834	GCCT	2	8	39721	39728	0 %	25 %	25 %	50 %	386866234
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