MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 37736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017834	TCGGC	2	10	254062	254071	0 %	20 %	40 %	40 %	386866410
5002	NC_017834	CTG	2	6	254121	254126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866410
5003	NC_017834	GCG	2	6	254322	254327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866411
5004	NC_017834	GGC	2	6	254388	254393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866411
5005	NC_017834	TGC	2	6	254443	254448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866411
5006	NC_017834	GGC	2	6	254449	254454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866411
5007	NC_017834	GC	3	6	254459	254464	0 %	0 %	50 %	50 %	386866411
5008	NC_017834	CCG	2	6	254483	254488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866411
5009	NC_017834	CTG	2	6	254491	254496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866411
5010	NC_017834	ATG	2	6	254537	254542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866411
5011	NC_017834	TCC	2	6	254545	254550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866411
5012	NC_017834	GGA	2	6	254601	254606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866411
5013	NC_017834	CGC	2	6	254615	254620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866411
5014	NC_017834	CG	4	8	254665	254672	0 %	0 %	50 %	50 %	386866411
5015	NC_017834	TGC	3	9	254708	254716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866411
5016	NC_017834	CTG	2	6	254731	254736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866411
5017	NC_017834	GGT	2	6	254757	254762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866411
5018	NC_017834	CGA	2	6	254765	254770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866411
5019	NC_017834	TCAT	2	8	254776	254783	25 %	50 %	0 %	25 %	386866411
5020	NC_017834	AGG	2	6	255003	255008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866412
5021	NC_017834	GCT	2	6	255047	255052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866412
5022	NC_017834	GGA	2	6	255104	255109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866412
5023	NC_017834	CCG	2	6	255121	255126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866412
5024	NC_017834	GGT	2	6	255134	255139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866412
5025	NC_017834	GCG	2	6	255147	255152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866412
5026	NC_017834	CGC	2	6	255161	255166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866412
5027	NC_017834	TGG	2	6	255172	255177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866412
5028	NC_017834	GCT	2	6	255206	255211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866412
5029	NC_017834	GAA	2	6	255224	255229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866412
5030	NC_017834	GGC	2	6	255306	255311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866413
5031	NC_017834	GGT	2	6	255327	255332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866413
5032	NC_017834	GTG	2	6	255346	255351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866413
5033	NC_017834	GGC	2	6	255354	255359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866413
5034	NC_017834	TGC	2	6	255362	255367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866413
5035	NC_017834	GCG	2	6	255412	255417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866413
5036	NC_017834	CGC	2	6	255423	255428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866413
5037	NC_017834	TGG	2	6	255440	255445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866413
5038	NC_017834	CCG	2	6	255524	255529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866413
5039	NC_017834	GGT	2	6	255561	255566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866413
5040	NC_017834	AGG	2	6	255626	255631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866413
5041	NC_017834	GAG	2	6	255638	255643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866413
5042	NC_017834	CG	3	6	255661	255666	0 %	0 %	50 %	50 %	386866414
5043	NC_017834	CTG	2	6	255669	255674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866414
5044	NC_017834	GTG	2	6	255723	255728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866414
5045	NC_017834	AGGCGC	2	12	255778	255789	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386866414
5046	NC_017834	GGC	2	6	255806	255811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866414
5047	NC_017834	GCC	2	6	255819	255824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866414
5048	NC_017834	GC	3	6	255879	255884	0 %	0 %	50 %	50 %	386866414
5049	NC_017834	CG	4	8	255987	255994	0 %	0 %	50 %	50 %	386866414
5050	NC_017834	GCG	2	6	256033	256038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866414
5051	NC_017834	CGCA	2	8	256359	256366	25 %	0 %	25 %	50 %	386866415
5052	NC_017834	TG	3	6	256387	256392	0 %	50 %	50 %	0 %	386866415
5053	NC_017834	GCG	2	6	256415	256420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866415
5054	NC_017834	TCGA	2	8	256462	256469	25 %	25 %	25 %	25 %	386866415
5055	NC_017834	GTG	2	6	256471	256476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866415
5056	NC_017834	GAC	2	6	256507	256512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
5057	NC_017834	CGA	2	6	256578	256583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
5058	NC_017834	CTC	2	6	256618	256623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866415
5059	NC_017834	GGA	2	6	256632	256637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866415
5060	NC_017834	GCC	2	6	256638	256643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866415
5061	NC_017834	CCA	2	6	256667	256672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866415
5062	NC_017834	CACC	2	8	256710	256717	25 %	0 %	0 %	75 %	386866415
5063	NC_017834	TCCGT	2	10	256722	256731	0 %	40 %	20 %	40 %	386866415
5064	NC_017834	CCT	2	6	256738	256743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866415
5065	NC_017834	TG	3	6	256770	256775	0 %	50 %	50 %	0 %	386866415
5066	NC_017834	GCGG	2	8	256828	256835	0 %	0 %	75 %	25 %	386866415
5067	NC_017834	TG	3	6	256885	256890	0 %	50 %	50 %	0 %	386866415
5068	NC_017834	GGCGA	2	10	256954	256963	20 %	0 %	60 %	20 %	386866415
5069	NC_017834	ATC	2	6	256972	256977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866415
5070	NC_017834	CAT	2	6	257004	257009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866415
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5072	NC_017834	GC	3	6	257065	257070	0 %	0 %	50 %	50 %	386866415
5073	NC_017834	CGG	2	6	257097	257102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866415
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5080	NC_017834	GC	3	6	257347	257352	0 %	0 %	50 %	50 %	386866415
5081	NC_017834	CTG	2	6	257360	257365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866415
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5087	NC_017834	GGA	2	6	257580	257585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866415
5088	NC_017834	GGC	2	6	257631	257636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866415
5089	NC_017834	GC	3	6	257652	257657	0 %	0 %	50 %	50 %	386866415
5090	NC_017834	GCAA	2	8	257714	257721	50 %	0 %	25 %	25 %	386866415
5091	NC_017834	CAC	2	6	257799	257804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866415
5092	NC_017834	CGT	2	6	257808	257813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866415
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5094	NC_017834	GGA	2	6	257925	257930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866415
5095	NC_017834	GCT	2	6	257952	257957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866415
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5098	NC_017834	CG	3	6	257990	257995	0 %	0 %	50 %	50 %	386866415
5099	NC_017834	ATC	2	6	257997	258002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866415
5100	NC_017834	GCA	2	6	258012	258017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
5101	NC_017834	CCA	2	6	258020	258025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866415
5102	NC_017834	TCC	2	6	258034	258039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866415
5103	NC_017834	GCC	2	6	258061	258066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866415
5104	NC_017834	GAC	3	9	258133	258141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
5105	NC_017834	GAG	2	6	258211	258216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866415
5106	NC_017834	GCA	2	6	258225	258230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
5107	NC_017834	CGA	2	6	258309	258314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
5108	NC_017834	CAG	2	6	258355	258360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
5109	NC_017834	CGA	2	6	258393	258398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
5110	NC_017834	GGCG	2	8	258540	258547	0 %	0 %	75 %	25 %	386866415
5111	NC_017834	GCC	2	6	258558	258563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866415
5112	NC_017834	CGA	3	9	258582	258590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
5113	NC_017834	GAC	2	6	258604	258609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
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5115	NC_017834	CGA	2	6	258693	258698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
5116	NC_017834	AAC	2	6	258703	258708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866415
5117	NC_017834	TGGCAT	2	12	258785	258796	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386866416
5118	NC_017834	ACG	2	6	258797	258802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866416
5119	NC_017834	GC	3	6	258860	258865	0 %	0 %	50 %	50 %	386866416
5120	NC_017834	CTG	2	6	258883	258888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866416
5121	NC_017834	TCG	2	6	258917	258922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866416
5122	NC_017834	TG	3	6	258975	258980	0 %	50 %	50 %	0 %	386866416
5123	NC_017834	AGC	2	6	258985	258990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866416
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5222	NC_017834	CG	3	6	262784	262789	0 %	0 %	50 %	50 %	386866420
5223	NC_017834	AGA	2	6	263199	263204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866421
5224	NC_017834	GGGTCA	2	12	263206	263217	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386866421
5225	NC_017834	CGC	2	6	263236	263241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866421
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5227	NC_017834	GCT	2	6	263278	263283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866421
5228	NC_017834	TCG	2	6	263508	263513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866421
5229	NC_017834	CGA	2	6	263608	263613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866421
5230	NC_017834	TCG	2	6	263622	263627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866421
5231	NC_017834	GC	3	6	263689	263694	0 %	0 %	50 %	50 %	386866421
5232	NC_017834	TGC	2	6	263724	263729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866421
5233	NC_017834	CG	3	6	263756	263761	0 %	0 %	50 %	50 %	386866421
5234	NC_017834	AAG	2	6	263768	263773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866421
5235	NC_017834	GCG	2	6	263786	263791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866421
5236	NC_017834	TAC	2	6	263837	263842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866421
5237	NC_017834	GAT	2	6	263941	263946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866421
5238	NC_017834	CAA	2	6	264016	264021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866421
5239	NC_017834	GTG	2	6	264041	264046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866421
5240	NC_017834	ACG	2	6	264066	264071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866421
5241	NC_017834	CGC	2	6	264085	264090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866421
5242	NC_017834	TC	3	6	264226	264231	0 %	50 %	0 %	50 %	386866421
5243	NC_017834	AAG	2	6	264353	264358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866421
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5245	NC_017834	CGC	2	6	264379	264384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866421
5246	NC_017834	GGCG	2	8	264391	264398	0 %	0 %	75 %	25 %	386866421
5247	NC_017834	CGAT	2	8	264438	264445	25 %	25 %	25 %	25 %	386866421
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5254	NC_017834	GTC	2	6	264766	264771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866421
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5256	NC_017834	CGT	2	6	264919	264924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866421
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5264	NC_017834	ATC	2	6	265085	265090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866421
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5271	NC_017834	GCC	2	6	265405	265410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866422
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5273	NC_017834	CTG	3	9	265492	265500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866422
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5303	NC_017834	TCT	2	6	266637	266642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866422
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5322	NC_017834	ATG	2	6	267239	267244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866422
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5325	NC_017834	GGT	2	6	267367	267372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866422
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5329	NC_017834	GCCGAT	2	12	267463	267474	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386866422
5330	NC_017834	CAG	2	6	267478	267483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866422
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5336	NC_017834	GCGCG	2	10	267606	267615	0 %	0 %	60 %	40 %	386866422
5337	NC_017834	GAGCTT	2	12	267620	267631	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386866422
5338	NC_017834	CAA	2	6	268083	268088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866423
5339	NC_017834	CGG	2	6	268092	268097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866423
5340	NC_017834	AAC	2	6	268192	268197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866423
5341	NC_017834	TGC	2	6	268238	268243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866423
5342	NC_017834	GACC	2	8	268247	268254	25 %	0 %	25 %	50 %	386866423
5343	NC_017834	ACG	2	6	268256	268261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866423
5344	NC_017834	TAC	2	6	268273	268278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866423
5345	NC_017834	GAT	2	6	268284	268289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866423
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5347	NC_017834	TGC	2	6	268328	268333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866423
5348	NC_017834	AAG	2	6	268339	268344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866423
5349	NC_017834	GCC	2	6	268408	268413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866423
5350	NC_017834	CTGC	2	8	268440	268447	0 %	25 %	25 %	50 %	386866423
5351	NC_017834	ATC	2	6	268507	268512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866423
5352	NC_017834	CGA	2	6	268515	268520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866423
5353	NC_017834	CGCC	2	8	268563	268570	0 %	0 %	25 %	75 %	386866423
5354	NC_017834	GGC	2	6	268621	268626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866423
5355	NC_017834	AAG	2	6	268672	268677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866423
5356	NC_017834	CG	3	6	268688	268693	0 %	0 %	50 %	50 %	386866423
5357	NC_017834	GTG	2	6	268705	268710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866423
5358	NC_017834	CGA	2	6	268770	268775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866423
5359	NC_017834	CCG	2	6	268871	268876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866423
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5361	NC_017834	GGCC	2	8	268929	268936	0 %	0 %	50 %	50 %	386866423
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5484	NC_017834	CTC	2	6	274689	274694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866426
5485	NC_017834	CGG	2	6	274710	274715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866426
5486	NC_017834	CGA	2	6	274731	274736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866426
5487	NC_017834	CTG	2	6	274771	274776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866426
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5489	NC_017834	CG	3	6	274808	274813	0 %	0 %	50 %	50 %	386866426
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