MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei 1026b chromosome 2

Total Repeats: 3039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017832	TGCGC	2	10	45	54	0 %	20 %	40 %	40 %	386863736
2	NC_017832	TGGCT	2	10	1289	1298	0 %	40 %	40 %	20 %	386863737
3	NC_017832	GTGCG	2	10	1500	1509	0 %	20 %	60 %	20 %	386863737
4	NC_017832	GCGCC	2	10	1839	1848	0 %	0 %	40 %	60 %	386863737
5	NC_017832	CGGCA	2	10	2527	2536	20 %	0 %	40 %	40 %	386863738
6	NC_017832	CGGGC	2	10	4962	4971	0 %	0 %	60 %	40 %	386863741
7	NC_017832	TCGAA	2	10	7209	7218	40 %	20 %	20 %	20 %	386863743
8	NC_017832	ACGCG	2	10	7606	7615	20 %	0 %	40 %	40 %	386863743
9	NC_017832	CGACG	2	10	10147	10156	20 %	0 %	40 %	40 %	386863746
10	NC_017832	GTGCC	2	10	10373	10382	0 %	20 %	40 %	40 %	386863746
11	NC_017832	GCACG	2	10	10522	10531	20 %	0 %	40 %	40 %	386863746
12	NC_017832	CCGCG	2	10	13261	13270	0 %	0 %	40 %	60 %	386863749
13	NC_017832	CAGCG	2	10	14418	14427	20 %	0 %	40 %	40 %	386863751
14	NC_017832	CGGCG	2	10	14461	14470	0 %	0 %	60 %	40 %	386863751
15	NC_017832	CGCGG	2	10	15368	15377	0 %	0 %	60 %	40 %	386863752
16	NC_017832	CGCGC	2	10	20007	20016	0 %	0 %	40 %	60 %	386863757
17	NC_017832	GCGCG	2	10	21352	21361	0 %	0 %	60 %	40 %	386863758
18	NC_017832	CGATT	2	10	23018	23027	20 %	40 %	20 %	20 %	386863759
19	NC_017832	CGCGG	2	10	24659	24668	0 %	0 %	60 %	40 %	386863762
20	NC_017832	CGCAA	2	10	24918	24927	40 %	0 %	20 %	40 %	386863762
21	NC_017832	GCCGC	2	10	27236	27245	0 %	0 %	40 %	60 %	386863763
22	NC_017832	CGCGC	2	10	28679	28688	0 %	0 %	40 %	60 %	386863765
23	NC_017832	GCCGA	2	10	29695	29704	20 %	0 %	40 %	40 %	386863766
24	NC_017832	CGAGC	2	10	30445	30454	20 %	0 %	40 %	40 %	386863767
25	NC_017832	TCGCC	2	10	31310	31319	0 %	20 %	20 %	60 %	386863768
26	NC_017832	GCGTG	2	10	31525	31534	0 %	20 %	60 %	20 %	386863768
27	NC_017832	AGGCG	2	10	32230	32239	20 %	0 %	60 %	20 %	386863769
28	NC_017832	GCGCC	2	10	34202	34211	0 %	0 %	40 %	60 %	386863770
29	NC_017832	CACGG	2	10	37766	37775	20 %	0 %	40 %	40 %	386863774
30	NC_017832	GCCGC	2	10	40451	40460	0 %	0 %	40 %	60 %	386863777
31	NC_017832	GTGCG	2	10	40724	40733	0 %	20 %	60 %	20 %	386863777
32	NC_017832	CGGAT	2	10	41540	41549	20 %	20 %	40 %	20 %	386863778
33	NC_017832	AGGCG	2	10	42728	42737	20 %	0 %	60 %	20 %	386863779
34	NC_017832	CGACG	2	10	43890	43899	20 %	0 %	40 %	40 %	386863780
35	NC_017832	CGCAC	2	10	44486	44495	20 %	0 %	20 %	60 %	386863781
36	NC_017832	CGACG	2	10	45138	45147	20 %	0 %	40 %	40 %	386863781
37	NC_017832	GCGCG	2	10	45473	45482	0 %	0 %	60 %	40 %	386863782
38	NC_017832	GCGCA	2	10	46573	46582	20 %	0 %	40 %	40 %	386863783
39	NC_017832	CGATC	2	10	48428	48437	20 %	20 %	20 %	40 %	386863785
40	NC_017832	CGGGC	2	10	49105	49114	0 %	0 %	60 %	40 %	386863786
41	NC_017832	GAGCG	2	10	50890	50899	20 %	0 %	60 %	20 %	386863788
42	NC_017832	ATCGT	2	10	52950	52959	20 %	40 %	20 %	20 %	386863790
43	NC_017832	GAGCC	2	10	54255	54264	20 %	0 %	40 %	40 %	386863791
44	NC_017832	GCCGC	2	10	54686	54695	0 %	0 %	40 %	60 %	386863791
45	NC_017832	GCGTC	2	10	56182	56191	0 %	20 %	40 %	40 %	386863793
46	NC_017832	TGCGT	2	10	58192	58201	0 %	40 %	40 %	20 %	386863796
47	NC_017832	CGCGG	2	10	58800	58809	0 %	0 %	60 %	40 %	386863797
48	NC_017832	GGCGC	2	10	59433	59442	0 %	0 %	60 %	40 %	386863798
49	NC_017832	CGTCG	2	10	59445	59454	0 %	20 %	40 %	40 %	386863798
50	NC_017832	TCGAA	2	10	60023	60032	40 %	20 %	20 %	20 %	386863798
51	NC_017832	CCCGG	2	10	60652	60661	0 %	0 %	40 %	60 %	386863798
52	NC_017832	GCGCA	2	10	64396	64405	20 %	0 %	40 %	40 %	386863798
53	NC_017832	CGCGG	2	10	64448	64457	0 %	0 %	60 %	40 %	386863798
54	NC_017832	GGCTT	2	10	65859	65868	0 %	40 %	40 %	20 %	386863800
55	NC_017832	GCGCA	2	10	65975	65984	20 %	0 %	40 %	40 %	386863800
56	NC_017832	CGGCG	2	10	68807	68816	0 %	0 %	60 %	40 %	386863803
57	NC_017832	GGCGT	2	10	70189	70198	0 %	20 %	60 %	20 %	386863804
58	NC_017832	CGGGA	2	10	72016	72025	20 %	0 %	60 %	20 %	386863805
59	NC_017832	GATTC	2	10	72645	72654	20 %	40 %	20 %	20 %	386863805
60	NC_017832	TCGCG	2	10	72657	72666	0 %	20 %	40 %	40 %	386863805
61	NC_017832	GGCAT	2	10	72786	72795	20 %	20 %	40 %	20 %	386863805
62	NC_017832	TCGAT	2	10	76982	76991	20 %	40 %	20 %	20 %	386863808
63	NC_017832	GCACG	2	10	77665	77674	20 %	0 %	40 %	40 %	386863809
64	NC_017832	CGGCT	2	10	77765	77774	0 %	20 %	40 %	40 %	386863809
65	NC_017832	TGCGC	2	10	79724	79733	0 %	20 %	40 %	40 %	386863810
66	NC_017832	CGATC	2	10	81591	81600	20 %	20 %	20 %	40 %	386863811
67	NC_017832	TACGC	2	10	88346	88355	20 %	20 %	20 %	40 %	386863816
68	NC_017832	GGGCA	2	10	90606	90615	20 %	0 %	60 %	20 %	386863816
69	NC_017832	GGCCG	2	10	92158	92167	0 %	0 %	60 %	40 %	386863817
70	NC_017832	GCTCG	2	10	92919	92928	0 %	20 %	40 %	40 %	386863817
71	NC_017832	GATCG	2	10	94256	94265	20 %	20 %	40 %	20 %	386863818
72	NC_017832	ACGGC	2	10	94976	94985	20 %	0 %	40 %	40 %	386863818
73	NC_017832	CTCGT	2	10	95284	95293	0 %	40 %	20 %	40 %	386863819
74	NC_017832	CGTGA	2	10	98381	98390	20 %	20 %	40 %	20 %	386863823
75	NC_017832	GCCGC	2	10	99316	99325	0 %	0 %	40 %	60 %	386863824
76	NC_017832	CGATG	2	10	100988	100997	20 %	20 %	40 %	20 %	386863825
77	NC_017832	CCGCG	2	10	101086	101095	0 %	0 %	40 %	60 %	386863825
78	NC_017832	GGGGA	2	10	101285	101294	20 %	0 %	80 %	0 %	386863825
79	NC_017832	GCCGT	2	10	103832	103841	0 %	20 %	40 %	40 %	386863827
80	NC_017832	CGGCG	2	10	107432	107441	0 %	0 %	60 %	40 %	386863829
81	NC_017832	CGCGC	2	10	108014	108023	0 %	0 %	40 %	60 %	386863829
82	NC_017832	CGCAG	2	10	110028	110037	20 %	0 %	40 %	40 %	386863831
83	NC_017832	TCGGC	2	10	111839	111848	0 %	20 %	40 %	40 %	386863833
84	NC_017832	TTGCG	2	10	114108	114117	0 %	40 %	40 %	20 %	386863833
85	NC_017832	GGCGC	2	10	114208	114217	0 %	0 %	60 %	40 %	386863834
86	NC_017832	CGAAC	2	10	115927	115936	40 %	0 %	20 %	40 %	386863837
87	NC_017832	CGGAG	2	10	116578	116587	20 %	0 %	60 %	20 %	386863837
88	NC_017832	GGCCG	2	10	121645	121654	0 %	0 %	60 %	40 %	386863842
89	NC_017832	GATCG	2	10	122436	122445	20 %	20 %	40 %	20 %	386863843
90	NC_017832	CGCTG	2	10	122992	123001	0 %	20 %	40 %	40 %	386863843
91	NC_017832	GCGGA	2	10	123004	123013	20 %	0 %	60 %	20 %	386863843
92	NC_017832	CGAGC	2	10	125788	125797	20 %	0 %	40 %	40 %	386863844
93	NC_017832	CGGCG	2	10	126436	126445	0 %	0 %	60 %	40 %	386863844
94	NC_017832	CTGCG	2	10	128730	128739	0 %	20 %	40 %	40 %	386863846
95	NC_017832	CGGCC	2	10	129180	129189	0 %	0 %	40 %	60 %	386863846
96	NC_017832	GCGAC	2	10	129904	129913	20 %	0 %	40 %	40 %	386863846
97	NC_017832	GCGCG	2	10	132213	132222	0 %	0 %	60 %	40 %	386863848
98	NC_017832	CTTGC	2	10	136996	137005	0 %	40 %	20 %	40 %	386863850
99	NC_017832	GCATC	2	10	137983	137992	20 %	20 %	20 %	40 %	386863851
100	NC_017832	AGCGC	2	10	138213	138222	20 %	0 %	40 %	40 %	386863851
101	NC_017832	GGGTG	2	10	138229	138238	0 %	20 %	80 %	0 %	386863851
102	NC_017832	GCGCG	2	10	138381	138390	0 %	0 %	60 %	40 %	386863852
103	NC_017832	GCGAT	2	10	139071	139080	20 %	20 %	40 %	20 %	386863852
104	NC_017832	AGCTG	2	10	139691	139700	20 %	20 %	40 %	20 %	386863853
105	NC_017832	TTCCG	2	10	139935	139944	0 %	40 %	20 %	40 %	386863853
106	NC_017832	TTCGC	2	10	143121	143130	0 %	40 %	20 %	40 %	386863857
107	NC_017832	GGGCC	2	10	147347	147356	0 %	0 %	60 %	40 %	386863859
108	NC_017832	GAATG	2	10	148284	148293	40 %	20 %	40 %	0 %	386863859
109	NC_017832	GCATT	2	10	148793	148802	20 %	40 %	20 %	20 %	386863859
110	NC_017832	AGCGC	2	10	149009	149018	20 %	0 %	40 %	40 %	386863859
111	NC_017832	CGTCG	2	10	149331	149340	0 %	20 %	40 %	40 %	386863859
112	NC_017832	GCCCG	2	10	150793	150802	0 %	0 %	40 %	60 %	386863861
113	NC_017832	ACAAA	2	10	151261	151270	80 %	0 %	0 %	20 %	386863863
114	NC_017832	CGGTG	2	10	153118	153127	0 %	20 %	60 %	20 %	386863867
115	NC_017832	TGCCG	2	10	153424	153433	0 %	20 %	40 %	40 %	386863867
116	NC_017832	GTCAG	2	10	156944	156953	20 %	20 %	40 %	20 %	386863870
117	NC_017832	TGAAA	2	10	159367	159376	60 %	20 %	20 %	0 %	386863872
118	NC_017832	ATGCG	2	10	159942	159951	20 %	20 %	40 %	20 %	386863872
119	NC_017832	GACGC	2	10	162377	162386	20 %	0 %	40 %	40 %	386863874
120	NC_017832	CGGCG	2	10	163310	163319	0 %	0 %	60 %	40 %	386863875
121	NC_017832	CGAAA	2	10	163897	163906	60 %	0 %	20 %	20 %	386863876
122	NC_017832	CGGCG	2	10	164988	164997	0 %	0 %	60 %	40 %	386863876
123	NC_017832	CGGCG	2	10	166423	166432	0 %	0 %	60 %	40 %	386863877
124	NC_017832	CGCGA	2	10	166682	166691	20 %	0 %	40 %	40 %	386863877
125	NC_017832	CGTTT	2	10	167317	167326	0 %	60 %	20 %	20 %	386863878
126	NC_017832	CGTGC	2	10	168203	168212	0 %	20 %	40 %	40 %	386863879
127	NC_017832	GGCGC	2	10	168772	168781	0 %	0 %	60 %	40 %	386863879
128	NC_017832	AGGCG	2	10	169052	169061	20 %	0 %	60 %	20 %	386863879
129	NC_017832	CCGCG	2	10	175170	175179	0 %	0 %	40 %	60 %	386863885
130	NC_017832	GCGCC	2	10	182605	182614	0 %	0 %	40 %	60 %	386863891
131	NC_017832	TCGCG	2	10	183085	183094	0 %	20 %	40 %	40 %	386863892
132	NC_017832	CGCGG	2	10	183875	183884	0 %	0 %	60 %	40 %	386863892
133	NC_017832	CGCGC	2	10	185232	185241	0 %	0 %	40 %	60 %	386863893
134	NC_017832	CGGCG	2	10	185285	185294	0 %	0 %	60 %	40 %	386863893
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261	NC_017832	GCGCC	2	10	316938	316947	0 %	0 %	40 %	60 %	386863987
262	NC_017832	CGCGG	2	10	317812	317821	0 %	0 %	60 %	40 %	386863989
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