MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017817	CT	3	6	428	433	0 %	50 %	0 %	50 %	386858973
2	NC_017817	CT	3	6	742	747	0 %	50 %	0 %	50 %	386858974
3	NC_017817	TA	3	6	1281	1286	50 %	50 %	0 %	0 %	386858974
4	NC_017817	CT	5	10	1802	1811	0 %	50 %	0 %	50 %	386858975
5	NC_017817	CT	4	8	1814	1821	0 %	50 %	0 %	50 %	386858975
6	NC_017817	AT	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	386858977
7	NC_017817	TC	3	6	3431	3436	0 %	50 %	0 %	50 %	386858978
8	NC_017817	TA	3	6	3528	3533	50 %	50 %	0 %	0 %	386858978
9	NC_017817	TC	3	6	3674	3679	0 %	50 %	0 %	50 %	386858979
10	NC_017817	AT	3	6	4001	4006	50 %	50 %	0 %	0 %	386858979
11	NC_017817	CT	4	8	5147	5154	0 %	50 %	0 %	50 %	386858980
12	NC_017817	TC	3	6	6608	6613	0 %	50 %	0 %	50 %	386858982
13	NC_017817	TC	3	6	7331	7336	0 %	50 %	0 %	50 %	386858982
14	NC_017817	CT	3	6	7590	7595	0 %	50 %	0 %	50 %	386858982
15	NC_017817	TC	3	6	7596	7601	0 %	50 %	0 %	50 %	386858982
16	NC_017817	CT	3	6	7602	7607	0 %	50 %	0 %	50 %	386858982
17	NC_017817	AC	3	6	7770	7775	50 %	0 %	0 %	50 %	386858982
18	NC_017817	TC	3	6	7928	7933	0 %	50 %	0 %	50 %	386858983
19	NC_017817	AT	3	6	8267	8272	50 %	50 %	0 %	0 %	386858983
20	NC_017817	AT	3	6	10871	10876	50 %	50 %	0 %	0 %	386858985
21	NC_017817	AT	3	6	16740	16745	50 %	50 %	0 %	0 %	386858989
22	NC_017817	TA	3	6	16822	16827	50 %	50 %	0 %	0 %	386858989
23	NC_017817	AT	3	6	16877	16882	50 %	50 %	0 %	0 %	386858989
24	NC_017817	CA	4	8	16927	16934	50 %	0 %	0 %	50 %	386858989
25	NC_017817	GA	3	6	17022	17027	50 %	0 %	50 %	0 %	386858989
26	NC_017817	AT	3	6	20463	20468	50 %	50 %	0 %	0 %	386858992
27	NC_017817	AT	3	6	20476	20481	50 %	50 %	0 %	0 %	386858992
28	NC_017817	AT	3	6	21279	21284	50 %	50 %	0 %	0 %	386858994
29	NC_017817	AT	3	6	21438	21443	50 %	50 %	0 %	0 %	386858994
30	NC_017817	TA	3	6	21534	21539	50 %	50 %	0 %	0 %	386858994
31	NC_017817	AT	3	6	22025	22030	50 %	50 %	0 %	0 %	386858995
32	NC_017817	AC	3	6	22132	22137	50 %	0 %	0 %	50 %	386858995
33	NC_017817	TA	4	8	23941	23948	50 %	50 %	0 %	0 %	386858996
34	NC_017817	TA	3	6	24003	24008	50 %	50 %	0 %	0 %	386858996
35	NC_017817	AT	3	6	26865	26870	50 %	50 %	0 %	0 %	386858999
36	NC_017817	AT	3	6	26941	26946	50 %	50 %	0 %	0 %	386859000
37	NC_017817	TC	3	6	28857	28862	0 %	50 %	0 %	50 %	386859002
38	NC_017817	AT	3	6	29641	29646	50 %	50 %	0 %	0 %	386859003
39	NC_017817	TA	3	6	29821	29826	50 %	50 %	0 %	0 %	386859003
40	NC_017817	AT	3	6	29848	29853	50 %	50 %	0 %	0 %	386859003
41	NC_017817	AG	3	6	30637	30642	50 %	0 %	50 %	0 %	386859004
42	NC_017817	GA	3	6	30658	30663	50 %	0 %	50 %	0 %	386859004
43	NC_017817	AT	4	8	30805	30812	50 %	50 %	0 %	0 %	386859004
44	NC_017817	AG	3	6	32868	32873	50 %	0 %	50 %	0 %	386859006
45	NC_017817	GA	3	6	33732	33737	50 %	0 %	50 %	0 %	386859007
46	NC_017817	CT	3	6	33765	33770	0 %	50 %	0 %	50 %	386859007
47	NC_017817	TA	3	6	33797	33802	50 %	50 %	0 %	0 %	386859007
48	NC_017817	TA	3	6	33812	33817	50 %	50 %	0 %	0 %	386859007
49	NC_017817	GA	3	6	33929	33934	50 %	0 %	50 %	0 %	386859008
50	NC_017817	AG	3	6	33955	33960	50 %	0 %	50 %	0 %	386859008
51	NC_017817	GA	4	8	33963	33970	50 %	0 %	50 %	0 %	386859008
52	NC_017817	GA	3	6	34052	34057	50 %	0 %	50 %	0 %	386859008
53	NC_017817	GA	3	6	35533	35538	50 %	0 %	50 %	0 %	386859009
54	NC_017817	AG	3	6	35559	35564	50 %	0 %	50 %	0 %	386859009
55	NC_017817	AG	3	6	35568	35573	50 %	0 %	50 %	0 %	386859009
56	NC_017817	AT	3	6	36208	36213	50 %	50 %	0 %	0 %	386859009

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.