MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017809	AAG	3	9	68	76	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858948
2	NC_017809	AAG	2	6	106	111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858948
3	NC_017809	GAG	2	6	118	123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858948
4	NC_017809	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858948
5	NC_017809	GTG	2	6	185	190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858948
6	NC_017809	CAG	2	6	239	244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858948
7	NC_017809	TAA	2	6	258	263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858948
8	NC_017809	GTT	2	6	366	371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858948
9	NC_017809	TAC	3	9	372	380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858948
10	NC_017809	AGC	4	12	414	425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858948
11	NC_017809	GCA	2	6	529	534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858948
12	NC_017809	GGA	2	6	613	618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858948
13	NC_017809	AGG	2	6	642	647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858948
14	NC_017809	AAT	2	6	664	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858948
15	NC_017809	ATG	2	6	674	679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858948
16	NC_017809	GCT	3	9	1991	1999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858949
17	NC_017809	TGG	2	6	2005	2010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858949
18	NC_017809	TAG	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858949
19	NC_017809	AGT	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858949
20	NC_017809	TAA	2	6	2107	2112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858949
21	NC_017809	TGC	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858949
22	NC_017809	ATT	2	6	2167	2172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858949
23	NC_017809	CTG	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858949
24	NC_017809	GCA	2	6	2231	2236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858949
25	NC_017809	AGG	2	6	2245	2250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858949
26	NC_017809	CTA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858949
27	NC_017809	GTT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858949
28	NC_017809	GGT	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858949
29	NC_017809	CTG	2	6	2421	2426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858949
30	NC_017809	ATG	2	6	2430	2435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858949
31	NC_017809	AGC	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858949
32	NC_017809	TGT	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858949
33	NC_017809	AAT	2	6	2835	2840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858950
34	NC_017809	TGA	4	12	2843	2854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858950
35	NC_017809	AGG	4	12	2901	2912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858950
36	NC_017809	ATG	2	6	2938	2943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858950
37	NC_017809	GAG	2	6	2952	2957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858950
38	NC_017809	AGA	2	6	3032	3037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
39	NC_017809	ATT	2	6	3050	3055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858950
40	NC_017809	AAG	2	6	3070	3075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
41	NC_017809	AGA	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
42	NC_017809	TAA	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858950
43	NC_017809	TAG	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858950
44	NC_017809	GCA	2	6	3259	3264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858950
45	NC_017809	GAT	2	6	3289	3294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858950
46	NC_017809	AAG	2	6	3350	3355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
47	NC_017809	ATA	2	6	3407	3412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858950
48	NC_017809	TGC	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858950
49	NC_017809	CAG	3	9	3455	3463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858950
50	NC_017809	AGC	3	9	3477	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858950
51	NC_017809	AAC	2	6	3492	3497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858950
52	NC_017809	GCT	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858950
53	NC_017809	AAC	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858950
54	NC_017809	AGC	3	9	3642	3650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858950
55	NC_017809	AGG	2	6	3705	3710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858950
56	NC_017809	AGG	2	6	3726	3731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858950
57	NC_017809	AGA	2	6	3735	3740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
58	NC_017809	TAG	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858950
59	NC_017809	AGA	2	6	3789	3794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
60	NC_017809	AAG	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
61	NC_017809	CAG	2	6	3869	3874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858950
62	NC_017809	ATG	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858951
63	NC_017809	GTG	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858951
64	NC_017809	TAA	2	6	4243	4248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858951
65	NC_017809	TGG	2	6	4308	4313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858951
66	NC_017809	AGT	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858951
67	NC_017809	TAA	2	6	4463	4468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858952
68	NC_017809	TTG	2	6	4471	4476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858952
69	NC_017809	TTG	2	6	4579	4584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858952
70	NC_017809	TGG	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858952
71	NC_017809	TGT	2	6	4649	4654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858952
72	NC_017809	TAG	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858952
73	NC_017809	AAG	2	6	4714	4719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858952
74	NC_017809	ATG	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858952
75	NC_017809	AAG	2	6	4743	4748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858952
76	NC_017809	TGG	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858952
77	NC_017809	TGA	2	6	4790	4795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858952
78	NC_017809	GTT	2	6	4805	4810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858952
79	NC_017809	TAC	2	6	4814	4819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858952
80	NC_017809	TGC	2	6	4838	4843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858952
81	NC_017809	GTG	2	6	4933	4938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858952
82	NC_017809	TGC	3	9	4940	4948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858952
83	NC_017809	GCT	3	9	5037	5045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858952
84	NC_017809	AGC	2	6	5078	5083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858952
85	NC_017809	AAG	2	6	5129	5134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858952
86	NC_017809	TGA	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858952
87	NC_017809	AAG	2	6	5164	5169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858952
88	NC_017809	TAT	2	6	5561	5566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858953
89	NC_017809	ATT	2	6	5604	5609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858953
90	NC_017809	ATA	2	6	5612	5617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858953
91	NC_017809	TGT	2	6	5646	5651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858953
92	NC_017809	AAT	2	6	5653	5658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858953
93	NC_017809	TGA	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858953
94	NC_017809	AGA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858953
95	NC_017809	TGT	2	6	5688	5693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858953
96	NC_017809	TAA	2	6	5694	5699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858953
97	NC_017809	TTG	2	6	5705	5710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858953
98	NC_017809	AGT	2	6	5715	5720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858953
99	NC_017809	ATT	2	6	5799	5804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858953

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.