MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid lp54

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017804	TA	3	6	321	326	50 %	50 %	0 %	0 %	386853318
2	NC_017804	CT	3	6	457	462	0 %	50 %	0 %	50 %	386853318
3	NC_017804	AT	3	6	1020	1025	50 %	50 %	0 %	0 %	386853319
4	NC_017804	AT	3	6	4106	4111	50 %	50 %	0 %	0 %	386853322
5	NC_017804	AT	3	6	4686	4691	50 %	50 %	0 %	0 %	386853324
6	NC_017804	TA	3	6	6026	6031	50 %	50 %	0 %	0 %	386853325
7	NC_017804	AC	3	6	9209	9214	50 %	0 %	0 %	50 %	386853328
8	NC_017804	AC	3	6	10385	10390	50 %	0 %	0 %	50 %	386853329
9	NC_017804	AC	3	6	10512	10517	50 %	0 %	0 %	50 %	386853329
10	NC_017804	CT	3	6	11379	11384	0 %	50 %	0 %	50 %	386853331
11	NC_017804	AG	3	6	11547	11552	50 %	0 %	50 %	0 %	386853331
12	NC_017804	TA	3	6	11908	11913	50 %	50 %	0 %	0 %	386853331
13	NC_017804	AT	3	6	12197	12202	50 %	50 %	0 %	0 %	386853332
14	NC_017804	AG	3	6	16837	16842	50 %	0 %	50 %	0 %	386853337
15	NC_017804	TC	3	6	18180	18185	0 %	50 %	0 %	50 %	386853339
16	NC_017804	TA	3	6	18980	18985	50 %	50 %	0 %	0 %	386853342
17	NC_017804	AT	3	6	20096	20101	50 %	50 %	0 %	0 %	386853343
18	NC_017804	TC	3	6	21285	21290	0 %	50 %	0 %	50 %	386853347
19	NC_017804	CT	3	6	22647	22652	0 %	50 %	0 %	50 %	386853351
20	NC_017804	CT	4	8	23490	23497	0 %	50 %	0 %	50 %	386853353
21	NC_017804	CT	3	6	25957	25962	0 %	50 %	0 %	50 %	386853357
22	NC_017804	AT	3	6	26321	26326	50 %	50 %	0 %	0 %	386853358
23	NC_017804	TC	3	6	26441	26446	0 %	50 %	0 %	50 %	386853358
24	NC_017804	AT	3	6	27061	27066	50 %	50 %	0 %	0 %	386853358
25	NC_017804	TC	4	8	28480	28487	0 %	50 %	0 %	50 %	386853363
26	NC_017804	CT	3	6	29415	29420	0 %	50 %	0 %	50 %	386853363
27	NC_017804	TC	4	8	30106	30113	0 %	50 %	0 %	50 %	386853364
28	NC_017804	CA	3	6	30560	30565	50 %	0 %	0 %	50 %	386853364
29	NC_017804	AT	3	6	30579	30584	50 %	50 %	0 %	0 %	386853364
30	NC_017804	CA	3	6	32212	32217	50 %	0 %	0 %	50 %	386853366
31	NC_017804	CT	3	6	33567	33572	0 %	50 %	0 %	50 %	386853367
32	NC_017804	TA	3	6	34731	34736	50 %	50 %	0 %	0 %	386853368
33	NC_017804	AT	3	6	35709	35714	50 %	50 %	0 %	0 %	386853370
34	NC_017804	CT	3	6	37054	37059	0 %	50 %	0 %	50 %	386853372
35	NC_017804	AT	3	6	38748	38753	50 %	50 %	0 %	0 %	386853376
36	NC_017804	CT	3	6	41271	41276	0 %	50 %	0 %	50 %	386853380
37	NC_017804	TG	3	6	41333	41338	0 %	50 %	50 %	0 %	386853380
38	NC_017804	TA	3	6	41702	41707	50 %	50 %	0 %	0 %	386853380
39	NC_017804	AT	3	6	42088	42093	50 %	50 %	0 %	0 %	386853381
40	NC_017804	AG	3	6	42205	42210	50 %	0 %	50 %	0 %	386853381
41	NC_017804	GT	4	8	43362	43369	0 %	50 %	50 %	0 %	386853384
42	NC_017804	TC	4	8	46657	46664	0 %	50 %	0 %	50 %	386853390
43	NC_017804	TG	3	6	47338	47343	0 %	50 %	50 %	0 %	386853393
44	NC_017804	GT	3	6	47559	47564	0 %	50 %	50 %	0 %	386853393
45	NC_017804	TG	3	6	47774	47779	0 %	50 %	50 %	0 %	386853394
46	NC_017804	GT	3	6	48374	48379	0 %	50 %	50 %	0 %	386853395
47	NC_017804	AT	3	6	48665	48670	50 %	50 %	0 %	0 %	386853395
48	NC_017804	TA	3	6	52219	52224	50 %	50 %	0 %	0 %	386853400
49	NC_017804	CT	3	6	53020	53025	0 %	50 %	0 %	50 %	386853401
50	NC_017804	TA	3	6	56111	56116	50 %	50 %	0 %	0 %	386853404
51	NC_017804	TC	3	6	60199	60204	0 %	50 %	0 %	50 %	386853409

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.