MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017801	A	7	7	108	114	100 %	0 %	0 %	0 %	386858846
2	NC_017801	TTA	2	6	129	134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858846
3	NC_017801	AAT	2	6	149	154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858846
4	NC_017801	AC	3	6	218	223	50 %	0 %	0 %	50 %	386858846
5	NC_017801	T	6	6	227	232	0 %	100 %	0 %	0 %	386858846
6	NC_017801	ATT	2	6	247	252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858846
7	NC_017801	T	6	6	272	277	0 %	100 %	0 %	0 %	386858846
8	NC_017801	T	6	6	318	323	0 %	100 %	0 %	0 %	386858846
9	NC_017801	GAA	2	6	365	370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858846
10	NC_017801	A	6	6	428	433	100 %	0 %	0 %	0 %	386858846
11	NC_017801	TATT	2	8	439	446	25 %	75 %	0 %	0 %	386858846
12	NC_017801	AT	3	6	461	466	50 %	50 %	0 %	0 %	386858846
13	NC_017801	CTA	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858846
14	NC_017801	A	6	6	475	480	100 %	0 %	0 %	0 %	386858846
15	NC_017801	TA	3	6	489	494	50 %	50 %	0 %	0 %	386858846
16	NC_017801	A	7	7	603	609	100 %	0 %	0 %	0 %	386858846
17	NC_017801	ATA	2	6	616	621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858846
18	NC_017801	TAC	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858847
19	NC_017801	A	7	7	690	696	100 %	0 %	0 %	0 %	386858847
20	NC_017801	TTA	2	6	744	749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858847
21	NC_017801	TAA	2	6	753	758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858847
22	NC_017801	AAAAGA	2	12	762	773	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386858847
23	NC_017801	AT	3	6	794	799	50 %	50 %	0 %	0 %	386858847
24	NC_017801	GAG	2	6	960	965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858847
25	NC_017801	AAAT	2	8	971	978	75 %	25 %	0 %	0 %	386858847
26	NC_017801	TA	3	6	985	990	50 %	50 %	0 %	0 %	386858847
27	NC_017801	TA	3	6	1051	1056	50 %	50 %	0 %	0 %	386858847
28	NC_017801	T	6	6	1111	1116	0 %	100 %	0 %	0 %	386858847
29	NC_017801	A	6	6	1120	1125	100 %	0 %	0 %	0 %	386858847
30	NC_017801	T	8	8	1145	1152	0 %	100 %	0 %	0 %	386858847
31	NC_017801	ATA	2	6	1175	1180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858847
32	NC_017801	A	6	6	1186	1191	100 %	0 %	0 %	0 %	386858847
33	NC_017801	AAT	2	6	1200	1205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858847
34	NC_017801	A	7	7	1258	1264	100 %	0 %	0 %	0 %	386858847
35	NC_017801	AAT	2	6	1327	1332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858847
36	NC_017801	TTA	2	6	1333	1338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858847
37	NC_017801	ATA	2	6	1361	1366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858847
38	NC_017801	GAC	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858848
39	NC_017801	ATA	2	6	1465	1470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858848
40	NC_017801	AAT	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858848
41	NC_017801	TGA	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858848
42	NC_017801	GAT	2	6	1537	1542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858848
43	NC_017801	A	6	6	1547	1552	100 %	0 %	0 %	0 %	386858848
44	NC_017801	AAGT	2	8	1569	1576	50 %	25 %	25 %	0 %	386858848
45	NC_017801	ATA	2	6	1583	1588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858848
46	NC_017801	GAT	2	6	1594	1599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858848
47	NC_017801	TAA	2	6	1605	1610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858848
48	NC_017801	AG	3	6	1633	1638	50 %	0 %	50 %	0 %	386858848
49	NC_017801	T	6	6	1815	1820	0 %	100 %	0 %	0 %	386858848
50	NC_017801	AAAG	2	8	1828	1835	75 %	0 %	25 %	0 %	386858848
51	NC_017801	A	6	6	1845	1850	100 %	0 %	0 %	0 %	386858848
52	NC_017801	AAAT	2	8	1856	1863	75 %	25 %	0 %	0 %	386858848
53	NC_017801	ATT	2	6	1910	1915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858848
54	NC_017801	T	7	7	1958	1964	0 %	100 %	0 %	0 %	386858848
55	NC_017801	A	7	7	2013	2019	100 %	0 %	0 %	0 %	386858848
56	NC_017801	A	6	6	2021	2026	100 %	0 %	0 %	0 %	386858848

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.