MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 316

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017796	ATG	2	6	1523	1528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858762
2	NC_017796	TAG	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858763
3	NC_017796	AGT	2	6	1750	1755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858763
4	NC_017796	ATT	2	6	1924	1929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858763
5	NC_017796	CTA	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858763
6	NC_017796	ACC	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858763
7	NC_017796	CAT	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858763
8	NC_017796	CCT	2	6	2139	2144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858763
9	NC_017796	AGC	4	12	2167	2178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
10	NC_017796	CAG	2	6	2193	2198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
11	NC_017796	CAG	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
12	NC_017796	CAG	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
13	NC_017796	GCA	2	6	2336	2341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
14	NC_017796	CAG	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
15	NC_017796	TAA	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858763
16	NC_017796	CAA	2	6	2628	2633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858764
17	NC_017796	TAT	2	6	2731	2736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858764
18	NC_017796	CAG	3	9	2740	2748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858764
19	NC_017796	CAC	2	6	2878	2883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858764
20	NC_017796	CTT	2	6	2921	2926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858764
21	NC_017796	AGC	2	6	2951	2956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858764
22	NC_017796	AAC	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858764
23	NC_017796	CAG	3	9	2983	2991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858764
24	NC_017796	ATC	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858764
25	NC_017796	CAT	2	6	3037	3042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858764
26	NC_017796	CTT	2	6	3049	3054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858764
27	NC_017796	CTA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
28	NC_017796	CAA	2	6	3109	3114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858765
29	NC_017796	ATC	2	6	3152	3157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
30	NC_017796	TAT	2	6	3199	3204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858765
31	NC_017796	ATC	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
32	NC_017796	TTA	2	6	3296	3301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858765
33	NC_017796	ATG	2	6	3414	3419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858765
34	NC_017796	CCA	2	6	3450	3455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858765
35	NC_017796	TCC	2	6	3487	3492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858765
36	NC_017796	CTC	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858765
37	NC_017796	CAC	4	12	3520	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858765
38	NC_017796	CAT	3	9	3532	3540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
39	NC_017796	ATC	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
40	NC_017796	ATC	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
41	NC_017796	TTC	2	6	3587	3592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858765
42	NC_017796	TAC	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858766
43	NC_017796	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858766
44	NC_017796	CTT	2	6	5315	5320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858766
45	NC_017796	TCA	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858766
46	NC_017796	ATT	2	6	5386	5391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858766
47	NC_017796	CTG	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858766
48	NC_017796	GCA	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858766
49	NC_017796	CAT	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858766
50	NC_017796	GCA	2	6	5437	5442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858766
51	NC_017796	CTC	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858766
52	NC_017796	TTG	2	6	5501	5506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858766
53	NC_017796	CAC	2	6	5558	5563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858766
54	NC_017796	TGC	2	6	5619	5624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858766
55	NC_017796	TAT	2	6	5927	5932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858767
56	NC_017796	CAA	2	6	6016	6021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858767
57	NC_017796	TTA	2	6	6024	6029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858767
58	NC_017796	TTC	2	6	6846	6851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
59	NC_017796	AGC	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858768
60	NC_017796	CCT	2	6	6904	6909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858768
61	NC_017796	AGC	2	6	6954	6959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858768
62	NC_017796	CAC	2	6	7064	7069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858768
63	NC_017796	ACT	2	6	7072	7077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858768
64	NC_017796	TGC	2	6	7092	7097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
65	NC_017796	CAG	2	6	7121	7126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858768
66	NC_017796	TAG	2	6	7178	7183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858768
67	NC_017796	CTG	2	6	7268	7273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
68	NC_017796	TGC	2	6	7275	7280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
69	NC_017796	CAG	2	6	7289	7294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858768
70	NC_017796	CAT	2	6	7313	7318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858768
71	NC_017796	TGC	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
72	NC_017796	CTG	2	6	7352	7357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
73	NC_017796	TAA	2	6	7379	7384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858768
74	NC_017796	TTC	2	6	7423	7428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
75	NC_017796	AGT	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858768
76	NC_017796	CTT	2	6	7506	7511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
77	NC_017796	CAT	2	6	7653	7658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858768
78	NC_017796	TAC	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858768
79	NC_017796	CTT	2	6	7700	7705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
80	NC_017796	TTC	2	6	7718	7723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
81	NC_017796	CCT	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858768
82	NC_017796	TTC	2	6	8092	8097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858769
83	NC_017796	TCC	2	6	8116	8121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858769
84	NC_017796	CCT	2	6	8147	8152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858769
85	NC_017796	CTT	2	6	8194	8199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858769
86	NC_017796	ATC	2	6	8200	8205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858769
87	NC_017796	ATT	2	6	8263	8268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858769
88	NC_017796	TCT	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858769
89	NC_017796	TGC	4	12	8344	8355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858769
90	NC_017796	CTT	2	6	8361	8366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858769
91	NC_017796	CAT	2	6	8370	8375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858769
92	NC_017796	CCA	2	6	8384	8389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858769
93	NC_017796	ACA	2	6	8465	8470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858769
94	NC_017796	CAA	2	6	8472	8477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858769
95	NC_017796	CAC	2	6	8553	8558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858769
96	NC_017796	GCT	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858769
97	NC_017796	CTC	2	6	8601	8606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858769
98	NC_017796	TAT	2	6	9238	9243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858770
99	NC_017796	TTA	2	6	9255	9260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858770
100	NC_017796	TTA	2	6	9288	9293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858770
101	NC_017796	CTT	2	6	9304	9309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858770
102	NC_017796	ACA	2	6	9316	9321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858770
103	NC_017796	TAC	2	6	9406	9411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858771
104	NC_017796	GCT	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858771
105	NC_017796	TCT	2	6	9493	9498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858771
106	NC_017796	TAA	2	6	9507	9512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858771
107	NC_017796	CTT	3	9	9545	9553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858771
108	NC_017796	TCC	2	6	9555	9560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858771
109	NC_017796	CTG	2	6	9572	9577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858771
110	NC_017796	CTG	2	6	9581	9586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858771
111	NC_017796	CTG	3	9	9635	9643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858771
112	NC_017796	CCT	2	6	9679	9684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858771
113	NC_017796	TCT	2	6	9745	9750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858771
114	NC_017796	TGT	2	6	9792	9797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858771
115	NC_017796	GCC	2	6	9805	9810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858771
116	NC_017796	TTA	2	6	9871	9876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858771
117	NC_017796	CTG	2	6	9899	9904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858771
118	NC_017796	CTT	2	6	9932	9937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858771
119	NC_017796	CTA	2	6	9950	9955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858771
120	NC_017796	GCC	2	6	10024	10029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858771
121	NC_017796	ACA	2	6	10036	10041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858771
122	NC_017796	TCA	2	6	10045	10050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858771
123	NC_017796	AGT	2	6	10095	10100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858771
124	NC_017796	CTT	2	6	10145	10150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858771
125	NC_017796	CTG	2	6	10160	10165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858771
126	NC_017796	AAT	2	6	10232	10237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858771
127	NC_017796	TTC	2	6	10249	10254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858771
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.