MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017787	TAA	2	6	24	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858866
2	NC_017787	TAA	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858866
3	NC_017787	TTA	2	6	184	189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858866
4	NC_017787	TAG	2	6	203	208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858866
5	NC_017787	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858866
6	NC_017787	CTT	2	6	274	279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858866
7	NC_017787	TTA	2	6	292	297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858866
8	NC_017787	TAT	2	6	314	319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858866
9	NC_017787	CTA	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858866
10	NC_017787	TTC	2	6	336	341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858866
11	NC_017787	TAG	2	6	416	421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858866
12	NC_017787	ATC	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858866
13	NC_017787	TAC	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858866
14	NC_017787	CAT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858866
15	NC_017787	ATA	2	6	814	819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858867
16	NC_017787	GAT	2	6	1845	1850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858868
17	NC_017787	ATA	2	6	1891	1896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858868
18	NC_017787	ATT	2	6	1897	1902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858868
19	NC_017787	GAA	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858869
20	NC_017787	ATA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858869
21	NC_017787	TGG	2	6	2697	2702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858869
22	NC_017787	TAA	2	6	2832	2837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858869
23	NC_017787	TTA	2	6	4235	4240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858870
24	NC_017787	GAT	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858870
25	NC_017787	TAT	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858870
26	NC_017787	AAT	2	6	4455	4460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858870
27	NC_017787	ATG	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858870
28	NC_017787	GTA	2	6	4698	4703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858871
29	NC_017787	AAT	2	6	4726	4731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858871
30	NC_017787	GTG	2	6	4752	4757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858872
31	NC_017787	GAG	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858872
32	NC_017787	ATA	2	6	5090	5095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858872
33	NC_017787	AAT	2	6	5126	5131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858872
34	NC_017787	ATT	2	6	5138	5143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858872
35	NC_017787	TAA	2	6	5202	5207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858872
36	NC_017787	ATA	2	6	5297	5302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858872
37	NC_017787	ATT	2	6	5342	5347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858872
38	NC_017787	GAT	2	6	5357	5362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858872
39	NC_017787	ATT	2	6	5409	5414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858872
40	NC_017787	AAT	2	6	5438	5443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858872
41	NC_017787	GAT	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858873
42	NC_017787	GTA	2	6	5633	5638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858873
43	NC_017787	GAT	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858873
44	NC_017787	TAA	2	6	5650	5655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858873
45	NC_017787	TAT	2	6	5809	5814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858873
46	NC_017787	AAT	2	6	5834	5839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858873
47	NC_017787	ATA	2	6	6006	6011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858873
48	NC_017787	TAA	2	6	6708	6713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858874
49	NC_017787	TGA	2	6	6937	6942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858875
50	NC_017787	TGA	2	6	6991	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858875
51	NC_017787	AAC	2	6	7075	7080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858875
52	NC_017787	TGA	2	6	7093	7098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858875
53	NC_017787	TTG	2	6	7113	7118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858875
54	NC_017787	TGA	3	9	7195	7203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858875
55	NC_017787	CTG	2	6	7350	7355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858875
56	NC_017787	TGA	2	6	7451	7456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858876
57	NC_017787	GTG	2	6	7493	7498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858876
58	NC_017787	GAA	2	6	7617	7622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858876
59	NC_017787	CAA	2	6	7670	7675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858876
60	NC_017787	TGA	2	6	7737	7742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858876
61	NC_017787	CAA	2	6	7751	7756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858876
62	NC_017787	AAG	2	6	7781	7786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858876
63	NC_017787	TGC	2	6	7848	7853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858876
64	NC_017787	GTT	2	6	7867	7872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858876
65	NC_017787	TAT	2	6	7896	7901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858876
66	NC_017787	CTA	2	6	7940	7945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858876
67	NC_017787	AAG	3	9	7963	7971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858876
68	NC_017787	AGA	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858876
69	NC_017787	AGA	2	6	8097	8102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858876
70	NC_017787	GCA	2	6	8146	8151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858876
71	NC_017787	ATA	2	6	8177	8182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858876
72	NC_017787	CAA	2	6	8201	8206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858876
73	NC_017787	AGG	2	6	8256	8261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858876
74	NC_017787	GAA	2	6	8281	8286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858876
75	NC_017787	AGG	2	6	8631	8636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858877
76	NC_017787	GAA	2	6	8638	8643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858877
77	NC_017787	GAA	2	6	8715	8720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858877
78	NC_017787	TGA	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858877
79	NC_017787	TGG	2	6	8736	8741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858877
80	NC_017787	TGA	2	6	8742	8747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858877
81	NC_017787	AGG	2	6	8791	8796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858877
82	NC_017787	CTG	2	6	8831	8836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858877
83	NC_017787	CAA	2	6	8930	8935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858877
84	NC_017787	GGT	2	6	8960	8965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858877
85	NC_017787	GTA	2	6	9140	9145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858877
86	NC_017787	TGC	2	6	9160	9165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858877
87	NC_017787	AAC	2	6	9175	9180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858877
88	NC_017787	GAA	2	6	9188	9193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858877
89	NC_017787	AAT	2	6	9293	9298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858877
90	NC_017787	ATA	2	6	9303	9308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858877
91	NC_017787	GTG	2	6	9336	9341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858877
92	NC_017787	AGC	3	9	9451	9459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858877
93	NC_017787	AGG	2	6	9496	9501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858877
94	NC_017787	AGC	3	9	9538	9546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858877
95	NC_017787	AGC	2	6	9595	9600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858877
96	NC_017787	AGC	3	9	9604	9612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858877
97	NC_017787	AGG	2	6	9622	9627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858877
98	NC_017787	AGA	2	6	9631	9636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858877
99	NC_017787	CAG	2	6	9657	9662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858877
100	NC_017787	TTA	2	6	9671	9676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858877
101	NC_017787	AGA	2	6	9685	9690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858877
102	NC_017787	AGA	2	6	9709	9714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858877
103	NC_017787	CAG	2	6	9765	9770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858877
104	NC_017787	AGC	2	6	9771	9776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858877
105	NC_017787	AGG	2	6	10026	10031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858878
106	NC_017787	GAA	2	6	10033	10038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858878
107	NC_017787	GAA	2	6	10074	10079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858878
108	NC_017787	AGA	2	6	10109	10114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858878
109	NC_017787	TGA	4	12	10125	10136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858878
110	NC_017787	TGA	2	6	10140	10145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858878
111	NC_017787	GAG	2	6	10179	10184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858878
112	NC_017787	AGA	2	6	10206	10211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858878
113	NC_017787	TAG	2	6	10324	10329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858878
114	NC_017787	AAG	2	6	10352	10357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858878
115	NC_017787	TGC	2	6	10501	10506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858878
116	NC_017787	ATG	2	6	10533	10538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858878
117	NC_017787	TGC	2	6	10570	10575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858878
118	NC_017787	GCT	2	6	10580	10585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858878
119	NC_017787	TAA	2	6	10605	10610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858878
120	NC_017787	TGC	2	6	10681	10686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858878
121	NC_017787	GCT	2	6	10691	10696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858878
122	NC_017787	TGG	2	6	10702	10707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858878
123	NC_017787	TGC	3	9	10729	10737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858878
124	NC_017787	TGC	2	6	10837	10842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858878
125	NC_017787	AAT	3	9	10847	10855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858878
126	NC_017787	CTA	2	6	10872	10877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858878
127	NC_017787	TAA	2	6	10888	10893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858878
128	NC_017787	GCA	2	6	10922	10927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858878
129	NC_017787	TGC	2	6	10969	10974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858878
130	NC_017787	GAA	2	6	10982	10987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858878
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