MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017787	TTTA	3	12	1	12	25 %	75 %	0 %	0 %	386858866
2	NC_017787	TAA	2	6	24	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858866
3	NC_017787	TAA	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858866
4	NC_017787	TAATTT	2	12	75	86	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858866
5	NC_017787	TTA	2	6	184	189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858866
6	NC_017787	TAG	2	6	203	208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858866
7	NC_017787	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858866
8	NC_017787	CTT	2	6	274	279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858866
9	NC_017787	TTA	2	6	292	297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858866
10	NC_017787	TAT	2	6	314	319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858866
11	NC_017787	CTA	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858866
12	NC_017787	TTC	2	6	336	341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858866
13	NC_017787	T	6	6	356	361	0 %	100 %	0 %	0 %	386858866
14	NC_017787	TAG	2	6	416	421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858866
15	NC_017787	ATC	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858866
16	NC_017787	TAC	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858866
17	NC_017787	CAT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858866
18	NC_017787	TTTA	2	8	696	703	25 %	75 %	0 %	0 %	386858867
19	NC_017787	AT	3	6	720	725	50 %	50 %	0 %	0 %	386858867
20	NC_017787	ATAA	2	8	736	743	75 %	25 %	0 %	0 %	386858867
21	NC_017787	TA	4	8	794	801	50 %	50 %	0 %	0 %	386858867
22	NC_017787	ATA	2	6	814	819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858867
23	NC_017787	GAT	2	6	1845	1850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858868
24	NC_017787	T	6	6	1864	1869	0 %	100 %	0 %	0 %	386858868
25	NC_017787	ATA	2	6	1891	1896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858868
26	NC_017787	ATT	2	6	1897	1902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858868
27	NC_017787	GAA	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858869
28	NC_017787	A	7	7	2541	2547	100 %	0 %	0 %	0 %	386858869
29	NC_017787	A	6	6	2605	2610	100 %	0 %	0 %	0 %	386858869
30	NC_017787	AT	3	6	2642	2647	50 %	50 %	0 %	0 %	386858869
31	NC_017787	ATA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858869
32	NC_017787	A	6	6	2689	2694	100 %	0 %	0 %	0 %	386858869
33	NC_017787	TGG	2	6	2697	2702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858869
34	NC_017787	A	8	8	2731	2738	100 %	0 %	0 %	0 %	386858869
35	NC_017787	TAA	2	6	2832	2837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858869
36	NC_017787	AT	3	6	2852	2857	50 %	50 %	0 %	0 %	386858869
37	NC_017787	A	6	6	4206	4211	100 %	0 %	0 %	0 %	386858870
38	NC_017787	TAAAAA	2	12	4212	4223	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386858870
39	NC_017787	A	8	8	4219	4226	100 %	0 %	0 %	0 %	386858870
40	NC_017787	TTA	2	6	4235	4240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858870
41	NC_017787	AAAT	2	8	4250	4257	75 %	25 %	0 %	0 %	386858870
42	NC_017787	A	6	6	4315	4320	100 %	0 %	0 %	0 %	386858870
43	NC_017787	A	7	7	4322	4328	100 %	0 %	0 %	0 %	386858870
44	NC_017787	GA	3	6	4347	4352	50 %	0 %	50 %	0 %	386858870
45	NC_017787	ATTT	2	8	4385	4392	25 %	75 %	0 %	0 %	386858870
46	NC_017787	GAT	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858870
47	NC_017787	TAT	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858870
48	NC_017787	AAT	2	6	4455	4460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858870
49	NC_017787	ATG	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858870
50	NC_017787	TA	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	386858870
51	NC_017787	A	7	7	4587	4593	100 %	0 %	0 %	0 %	386858870
52	NC_017787	A	9	9	4595	4603	100 %	0 %	0 %	0 %	386858870
53	NC_017787	A	8	8	4648	4655	100 %	0 %	0 %	0 %	386858871
54	NC_017787	GTA	2	6	4698	4703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858871
55	NC_017787	A	7	7	4714	4720	100 %	0 %	0 %	0 %	386858871
56	NC_017787	AAT	2	6	4726	4731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858871
57	NC_017787	GTG	2	6	4752	4757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858872
58	NC_017787	T	6	6	4781	4786	0 %	100 %	0 %	0 %	386858872
59	NC_017787	GAG	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858872
60	NC_017787	ATTG	2	8	4822	4829	25 %	50 %	25 %	0 %	386858872
61	NC_017787	T	6	6	4861	4866	0 %	100 %	0 %	0 %	386858872
62	NC_017787	ATTGCA	2	12	4867	4878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858872
63	NC_017787	A	6	6	4931	4936	100 %	0 %	0 %	0 %	386858872
64	NC_017787	TA	3	6	4937	4942	50 %	50 %	0 %	0 %	386858872
65	NC_017787	ATGA	2	8	4961	4968	50 %	25 %	25 %	0 %	386858872
66	NC_017787	ATA	2	6	5090	5095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858872
67	NC_017787	AAT	2	6	5126	5131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858872
68	NC_017787	ATT	2	6	5138	5143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858872
69	NC_017787	TAA	2	6	5202	5207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858872
70	NC_017787	A	7	7	5218	5224	100 %	0 %	0 %	0 %	386858872
71	NC_017787	AG	3	6	5272	5277	50 %	0 %	50 %	0 %	386858872
72	NC_017787	ATA	2	6	5297	5302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858872
73	NC_017787	ATT	2	6	5342	5347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858872
74	NC_017787	GAT	2	6	5357	5362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858872
75	NC_017787	T	6	6	5376	5381	0 %	100 %	0 %	0 %	386858872
76	NC_017787	TTTG	2	8	5394	5401	0 %	75 %	25 %	0 %	386858872
77	NC_017787	ATT	2	6	5409	5414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858872
78	NC_017787	AAT	2	6	5438	5443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858872
79	NC_017787	TAAAAA	2	12	5506	5517	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386858873
80	NC_017787	GAT	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858873
81	NC_017787	TTTG	2	8	5560	5567	0 %	75 %	25 %	0 %	386858873
82	NC_017787	GTA	2	6	5633	5638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858873
83	NC_017787	GAT	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858873
84	NC_017787	TAA	2	6	5650	5655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858873
85	NC_017787	TA	4	8	5700	5707	50 %	50 %	0 %	0 %	386858873
86	NC_017787	AT	3	6	5776	5781	50 %	50 %	0 %	0 %	386858873
87	NC_017787	TAT	2	6	5809	5814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858873
88	NC_017787	AAT	2	6	5834	5839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858873
89	NC_017787	A	7	7	5857	5863	100 %	0 %	0 %	0 %	386858873
90	NC_017787	A	7	7	5884	5890	100 %	0 %	0 %	0 %	386858873
91	NC_017787	AG	3	6	5958	5963	50 %	0 %	50 %	0 %	386858873
92	NC_017787	ATA	2	6	6006	6011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858873
93	NC_017787	A	6	6	6035	6040	100 %	0 %	0 %	0 %	386858873
94	NC_017787	AT	3	6	6613	6618	50 %	50 %	0 %	0 %	386858874
95	NC_017787	TCGT	2	8	6619	6626	0 %	50 %	25 %	25 %	386858874
96	NC_017787	AG	3	6	6656	6661	50 %	0 %	50 %	0 %	386858874
97	NC_017787	TAA	2	6	6708	6713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858874
98	NC_017787	TTAG	2	8	6923	6930	25 %	50 %	25 %	0 %	386858875
99	NC_017787	TGA	2	6	6937	6942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858875
100	NC_017787	TGA	2	6	6991	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858875
101	NC_017787	AAC	2	6	7075	7080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858875
102	NC_017787	TGA	2	6	7093	7098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858875
103	NC_017787	GAAAG	2	10	7102	7111	60 %	0 %	40 %	0 %	386858875
104	NC_017787	TTG	2	6	7113	7118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858875
105	NC_017787	A	7	7	7180	7186	100 %	0 %	0 %	0 %	386858875
106	NC_017787	TGA	3	9	7195	7203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858875
107	NC_017787	AAAG	2	8	7207	7214	75 %	0 %	25 %	0 %	386858875
108	NC_017787	TAGA	2	8	7218	7225	50 %	25 %	25 %	0 %	386858875
109	NC_017787	CGAT	2	8	7281	7288	25 %	25 %	25 %	25 %	386858875
110	NC_017787	CTG	2	6	7350	7355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858875
111	NC_017787	TTTTA	2	10	7441	7450	20 %	80 %	0 %	0 %	386858876
112	NC_017787	TGA	2	6	7451	7456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858876
113	NC_017787	ATGGTG	2	12	7465	7476	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386858876
114	NC_017787	GTG	2	6	7493	7498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858876
115	NC_017787	GAA	2	6	7617	7622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858876
116	NC_017787	CAA	2	6	7670	7675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858876
117	NC_017787	AAAAG	2	10	7725	7734	80 %	0 %	20 %	0 %	386858876
118	NC_017787	TGA	2	6	7737	7742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858876
119	NC_017787	CAA	2	6	7751	7756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858876
120	NC_017787	AAG	2	6	7781	7786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858876
121	NC_017787	TGC	2	6	7848	7853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858876
122	NC_017787	GTT	2	6	7867	7872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858876
123	NC_017787	TAT	2	6	7896	7901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858876
124	NC_017787	AAAG	2	8	7915	7922	75 %	0 %	25 %	0 %	386858876
125	NC_017787	CTA	2	6	7940	7945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858876
126	NC_017787	AAG	3	9	7963	7971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858876
127	NC_017787	ATTT	2	8	7979	7986	25 %	75 %	0 %	0 %	386858876
128	NC_017787	AGA	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858876
129	NC_017787	AT	3	6	8069	8074	50 %	50 %	0 %	0 %	386858876
130	NC_017787	AGA	2	6	8097	8102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858876
131	NC_017787	GCA	2	6	8146	8151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858876
132	NC_017787	ATA	2	6	8177	8182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858876
133	NC_017787	CAA	2	6	8201	8206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858876
134	NC_017787	AGG	2	6	8256	8261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858876
135	NC_017787	GAA	2	6	8281	8286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858876
136	NC_017787	ATAA	2	8	8392	8399	75 %	25 %	0 %	0 %	386858876
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