MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017786	CA	4	8	107	114	50 %	0 %	0 %	50 %	386858707
2	NC_017786	AT	3	6	1277	1282	50 %	50 %	0 %	0 %	386858708
3	NC_017786	CT	3	6	1503	1508	0 %	50 %	0 %	50 %	386858708
4	NC_017786	TC	4	8	2963	2970	0 %	50 %	0 %	50 %	386858710
5	NC_017786	CT	3	6	2973	2978	0 %	50 %	0 %	50 %	386858710
6	NC_017786	TC	3	6	2979	2984	0 %	50 %	0 %	50 %	386858710
7	NC_017786	CT	3	6	2985	2990	0 %	50 %	0 %	50 %	386858710
8	NC_017786	TC	3	6	2999	3004	0 %	50 %	0 %	50 %	386858710
9	NC_017786	TC	3	6	3267	3272	0 %	50 %	0 %	50 %	386858711
10	NC_017786	AT	3	6	3604	3609	50 %	50 %	0 %	0 %	386858712
11	NC_017786	TC	3	6	3994	3999	0 %	50 %	0 %	50 %	386858712
12	NC_017786	TC	3	6	4517	4522	0 %	50 %	0 %	50 %	386858714
13	NC_017786	AT	3	6	4860	4865	50 %	50 %	0 %	0 %	386858715
14	NC_017786	AT	3	6	5914	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	386858717
15	NC_017786	AT	3	6	7023	7028	50 %	50 %	0 %	0 %	386858719
16	NC_017786	GA	4	8	11000	11007	50 %	0 %	50 %	0 %	386858721
17	NC_017786	TA	5	10	15203	15212	50 %	50 %	0 %	0 %	386858727
18	NC_017786	AT	3	6	15492	15497	50 %	50 %	0 %	0 %	386858727
19	NC_017786	AT	4	8	15599	15606	50 %	50 %	0 %	0 %	386858727
20	NC_017786	AG	3	6	17700	17705	50 %	0 %	50 %	0 %	386858729
21	NC_017786	TC	3	6	17943	17948	0 %	50 %	0 %	50 %	386858729
22	NC_017786	AT	3	6	18442	18447	50 %	50 %	0 %	0 %	386858730
23	NC_017786	TC	3	6	21593	21598	0 %	50 %	0 %	50 %	386858731
24	NC_017786	GA	3	6	23151	23156	50 %	0 %	50 %	0 %	386858732
25	NC_017786	AG	3	6	24731	24736	50 %	0 %	50 %	0 %	386858735
26	NC_017786	AT	3	6	24943	24948	50 %	50 %	0 %	0 %	386858735
27	NC_017786	GA	3	6	25294	25299	50 %	0 %	50 %	0 %	386858735
28	NC_017786	GA	3	6	26087	26092	50 %	0 %	50 %	0 %	386858736
29	NC_017786	AG	3	6	27247	27252	50 %	0 %	50 %	0 %	386858737
30	NC_017786	GA	3	6	27323	27328	50 %	0 %	50 %	0 %	386858737
31	NC_017786	AG	3	6	27490	27495	50 %	0 %	50 %	0 %	386858737
32	NC_017786	AT	3	6	27647	27652	50 %	50 %	0 %	0 %	386858737
33	NC_017786	AG	3	6	27994	27999	50 %	0 %	50 %	0 %	386858737
34	NC_017786	AG	3	6	28294	28299	50 %	0 %	50 %	0 %	386858738
35	NC_017786	TG	3	6	28502	28507	0 %	50 %	50 %	0 %	386858739
36	NC_017786	CT	3	6	29539	29544	0 %	50 %	0 %	50 %	386858740
37	NC_017786	AG	3	6	32846	32851	50 %	0 %	50 %	0 %	386858742
38	NC_017786	AG	4	8	33126	33133	50 %	0 %	50 %	0 %	386858743
39	NC_017786	AG	4	8	33138	33145	50 %	0 %	50 %	0 %	386858743
40	NC_017786	AT	3	6	34963	34968	50 %	50 %	0 %	0 %	386858745
41	NC_017786	AG	3	6	35274	35279	50 %	0 %	50 %	0 %	386858745
42	NC_017786	GA	3	6	35296	35301	50 %	0 %	50 %	0 %	386858745
43	NC_017786	AG	3	6	35595	35600	50 %	0 %	50 %	0 %	386858746
44	NC_017786	AT	3	6	39737	39742	50 %	50 %	0 %	0 %	386858750
45	NC_017786	GA	3	6	40085	40090	50 %	0 %	50 %	0 %	386858750

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.