MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017782	AAG	2	6	7	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
2	NC_017782	GAT	2	6	25	30	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858668
3	NC_017782	ACA	2	6	58	63	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858668
4	NC_017782	GAA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
5	NC_017782	AGA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
6	NC_017782	AGA	2	6	112	117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
7	NC_017782	AGA	2	6	180	185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
8	NC_017782	AAG	2	6	206	211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
9	NC_017782	TAT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858668
10	NC_017782	ATA	2	6	319	324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858668
11	NC_017782	AAG	2	6	352	357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
12	NC_017782	GAA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858668
13	NC_017782	TAA	2	6	510	515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858668
14	NC_017782	TAT	2	6	520	525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858668
15	NC_017782	TAG	2	6	542	547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858668
16	NC_017782	TTG	2	6	587	592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858668
17	NC_017782	ATA	2	6	695	700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858669
18	NC_017782	TAA	2	6	753	758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858669
19	NC_017782	AGA	2	6	843	848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858669
20	NC_017782	TAT	2	6	955	960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858669
21	NC_017782	TAA	3	9	1070	1078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858669
22	NC_017782	TTA	2	6	1117	1122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858669
23	NC_017782	AGG	2	6	1125	1130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858669
24	NC_017782	AAT	2	6	1163	1168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858669
25	NC_017782	AGG	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858670
26	NC_017782	TTG	2	6	1230	1235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858670
27	NC_017782	TCT	2	6	1281	1286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858670
28	NC_017782	TGT	2	6	1328	1333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858670
29	NC_017782	TAA	2	6	1354	1359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858670
30	NC_017782	ATT	2	6	1496	1501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858670
31	NC_017782	GTT	2	6	1572	1577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858670
32	NC_017782	AGT	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858670
33	NC_017782	ATT	2	6	1634	1639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858670
34	NC_017782	TTG	2	6	1725	1730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858670
35	NC_017782	TAA	2	6	1823	1828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858670
36	NC_017782	TAA	2	6	1859	1864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858670
37	NC_017782	TTA	2	6	2092	2097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858671
38	NC_017782	ATT	2	6	2169	2174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858671
39	NC_017782	TTG	2	6	2252	2257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858671
40	NC_017782	GAA	2	6	2423	2428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858671
41	NC_017782	AGA	2	6	2510	2515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858672
42	NC_017782	TAA	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858672
43	NC_017782	TAT	2	6	2595	2600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858672
44	NC_017782	TAT	2	6	2602	2607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858672
45	NC_017782	ATA	2	6	2949	2954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858673
46	NC_017782	ACA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858673
47	NC_017782	TAA	3	9	2989	2997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858673
48	NC_017782	ACA	2	6	3002	3007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858673
49	NC_017782	TTA	2	6	3144	3149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858673
50	NC_017782	TGT	2	6	3220	3225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858673
51	NC_017782	ACA	3	9	3227	3235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858673
52	NC_017782	AGA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858673
53	NC_017782	ATA	2	6	3468	3473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858673
54	NC_017782	AGA	2	6	4759	4764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858674
55	NC_017782	ATT	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858674
56	NC_017782	AAT	2	6	7085	7090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858675
57	NC_017782	AAT	2	6	7158	7163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858675
58	NC_017782	AGA	2	6	7169	7174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858675
59	NC_017782	TTA	3	9	7298	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858675
60	NC_017782	AAT	2	6	7357	7362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858676
61	NC_017782	AGA	2	6	7455	7460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858676
62	NC_017782	TAA	2	6	7480	7485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858676
63	NC_017782	AAG	2	6	7493	7498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858676
64	NC_017782	TAG	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858676
65	NC_017782	GCA	2	6	7682	7687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858676
66	NC_017782	TGC	2	6	7693	7698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858676
67	NC_017782	CAG	3	9	7707	7715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858676
68	NC_017782	ATG	3	9	7716	7724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858676
69	NC_017782	ATA	2	6	7833	7838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858676
70	NC_017782	GCA	3	9	7874	7882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858676
71	NC_017782	AGC	2	6	7897	7902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858676
72	NC_017782	GTG	2	6	7923	7928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858676
73	NC_017782	AAG	2	6	7959	7964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858676
74	NC_017782	GCT	2	6	7982	7987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858676
75	NC_017782	AGG	2	6	8023	8028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858676
76	NC_017782	AGC	3	9	8065	8073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858676
77	NC_017782	AGC	2	6	8122	8127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858676
78	NC_017782	AGG	2	6	8128	8133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858676
79	NC_017782	AGG	2	6	8149	8154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858676
80	NC_017782	AGA	2	6	8158	8163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858676
81	NC_017782	GTA	3	9	8204	8212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858676
82	NC_017782	GAA	2	6	8236	8241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858676
83	NC_017782	AGA	2	6	8305	8310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858676
84	NC_017782	TAA	3	9	8318	8326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858676
85	NC_017782	GAA	2	6	10034	10039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858677
86	NC_017782	TGA	2	6	10049	10054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858677
87	NC_017782	TGG	2	6	10055	10060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858677
88	NC_017782	TGA	2	6	10061	10066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858677
89	NC_017782	TGG	2	6	10067	10072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858677
90	NC_017782	TGA	2	6	10073	10078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858677
91	NC_017782	AGA	2	6	10133	10138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858677
92	NC_017782	ACA	2	6	10300	10305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858677
93	NC_017782	ATG	2	6	10406	10411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858677
94	NC_017782	CTG	2	6	10481	10486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858677
95	NC_017782	TGC	3	9	10491	10499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858677
96	NC_017782	TAA	2	6	10512	10517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858677
97	NC_017782	ATT	2	6	10534	10539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858677
98	NC_017782	TTA	2	6	10556	10561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858677
99	NC_017782	GTG	2	6	10622	10627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858677
100	NC_017782	CTA	2	6	10643	10648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858677
101	NC_017782	GAA	2	6	10696	10701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858677
102	NC_017782	TAA	4	12	10776	10787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858677
103	NC_017782	CTA	2	6	10847	10852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858677
104	NC_017782	AGG	2	6	10896	10901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858677
105	NC_017782	TAA	2	6	10923	10928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858677
106	NC_017782	AGC	3	9	10947	10955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858677
107	NC_017782	AAC	2	6	10956	10961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858677
108	NC_017782	TAA	2	6	10994	10999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858677
109	NC_017782	CTA	2	6	11084	11089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858677

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.