MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017780	ACC	2	6	356	361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859193
2	NC_017780	CTG	2	6	493	498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859193
3	NC_017780	ATC	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859193
4	NC_017780	AGC	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859193
5	NC_017780	ACC	2	6	552	557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859194
6	NC_017780	CTG	2	6	738	743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859194
7	NC_017780	CAG	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859194
8	NC_017780	ATT	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859194
9	NC_017780	ATC	2	6	853	858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859194
10	NC_017780	TTC	2	6	1517	1522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
11	NC_017780	TCT	2	6	1529	1534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
12	NC_017780	CTG	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
13	NC_017780	CTT	2	6	1581	1586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
14	NC_017780	CTG	2	6	1608	1613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
15	NC_017780	TGC	2	6	1675	1680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
16	NC_017780	GCT	2	6	1709	1714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
17	NC_017780	CCT	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859195
18	NC_017780	CTG	2	6	1860	1865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
19	NC_017780	ACC	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859195
20	NC_017780	TAG	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859195
21	NC_017780	TTA	2	6	1913	1918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859195
22	NC_017780	TAC	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
23	NC_017780	TAA	2	6	2010	2015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859195
24	NC_017780	CTG	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
25	NC_017780	GCA	3	9	2054	2062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859195
26	NC_017780	CTA	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
27	NC_017780	CTG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
28	NC_017780	TTC	2	6	2239	2244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
29	NC_017780	TAC	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
30	NC_017780	TTA	2	6	2273	2278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859195
31	NC_017780	CTT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
32	NC_017780	AGT	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859195
33	NC_017780	CAG	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859195
34	NC_017780	TCC	3	9	2431	2439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859195
35	NC_017780	TCC	2	6	2449	2454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859195
36	NC_017780	CAT	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
37	NC_017780	ATA	2	6	4518	4523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859196
38	NC_017780	TTA	2	6	4587	4592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859196
39	NC_017780	TAA	2	6	4624	4629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859196
40	NC_017780	TTC	2	6	4631	4636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859196
41	NC_017780	TCA	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859196
42	NC_017780	TTA	2	6	4764	4769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859196
43	NC_017780	TAA	2	6	4780	4785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859196
44	NC_017780	ATT	2	6	6975	6980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859197
45	NC_017780	AAC	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859197
46	NC_017780	TGA	2	6	7059	7064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859197
47	NC_017780	TCT	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
48	NC_017780	CTT	2	6	7236	7241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
49	NC_017780	CTT	2	6	7280	7285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
50	NC_017780	TAT	2	6	7347	7352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859197
51	NC_017780	TAA	2	6	7442	7447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859197
52	NC_017780	TTC	2	6	7456	7461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
53	NC_017780	TTG	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859197
54	NC_017780	TCA	3	9	7481	7489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859197
55	NC_017780	TCT	2	6	7493	7498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859197
56	NC_017780	AGT	2	6	7645	7650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859198
57	NC_017780	TAA	2	6	7776	7781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859198
58	NC_017780	ATT	2	6	7978	7983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859198
59	NC_017780	GTA	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859198
60	NC_017780	AAT	2	6	8248	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859198
61	NC_017780	TTA	2	6	8336	8341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859198
62	NC_017780	ATC	2	6	8368	8373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859199
63	NC_017780	TAA	2	6	8415	8420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859199
64	NC_017780	TCT	2	6	8438	8443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859199
65	NC_017780	AGT	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859199
66	NC_017780	ATC	2	6	13364	13369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859200
67	NC_017780	TAT	2	6	13430	13435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859200
68	NC_017780	TGA	2	6	13448	13453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859200
69	NC_017780	GGA	2	6	13568	13573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386859200
70	NC_017780	AGA	2	6	13643	13648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859200
71	NC_017780	ATT	2	6	13795	13800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859200
72	NC_017780	GAT	2	6	13932	13937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859200
73	NC_017780	ATA	2	6	13993	13998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859200
74	NC_017780	GTT	2	6	14012	14017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859200
75	NC_017780	AGA	2	6	14060	14065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859200
76	NC_017780	TGA	2	6	14177	14182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859200
77	NC_017780	ATT	2	6	14262	14267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859200
78	NC_017780	TAA	2	6	14417	14422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859200
79	NC_017780	AGA	2	6	14479	14484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859200
80	NC_017780	AAG	2	6	14568	14573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859200
81	NC_017780	TGT	2	6	14596	14601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859200
82	NC_017780	AAT	2	6	14640	14645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859200
83	NC_017780	TAA	2	6	14837	14842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859200
84	NC_017780	AAT	2	6	15039	15044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859200
85	NC_017780	TTA	2	6	15045	15050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859200
86	NC_017780	GTG	2	6	15109	15114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386859200
87	NC_017780	TAA	2	6	15257	15262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859200
88	NC_017780	AGA	2	6	15319	15324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859200
89	NC_017780	TAA	2	6	15458	15463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859200

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.