MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 368

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017778	GTTT	2	8	1547	1554	0 %	75 %	25 %	0 %	386859045
2	NC_017778	TCTT	3	12	3623	3634	0 %	75 %	0 %	25 %	386859047
3	NC_017778	TTTC	2	8	3881	3888	0 %	75 %	0 %	25 %	386859047
4	NC_017778	AATT	2	8	4075	4082	50 %	50 %	0 %	0 %	386859047
5	NC_017778	CCCT	2	8	4306	4313	0 %	25 %	0 %	75 %	386859047
6	NC_017778	TTAA	2	8	4799	4806	50 %	50 %	0 %	0 %	386859048
7	NC_017778	ATCA	2	8	4915	4922	50 %	25 %	0 %	25 %	386859048
8	NC_017778	TAAA	2	8	5880	5887	75 %	25 %	0 %	0 %	386859049
9	NC_017778	AAAG	2	8	6954	6961	75 %	0 %	25 %	0 %	386859050
10	NC_017778	ACAA	2	8	7055	7062	75 %	0 %	0 %	25 %	386859050
11	NC_017778	GTTT	2	8	7129	7136	0 %	75 %	25 %	0 %	386859050
12	NC_017778	TAAT	2	8	7697	7704	50 %	50 %	0 %	0 %	386859050
13	NC_017778	TTTG	2	8	8948	8955	0 %	75 %	25 %	0 %	386859051
14	NC_017778	TAAT	2	8	9652	9659	50 %	50 %	0 %	0 %	386859051
15	NC_017778	TATG	2	8	9929	9936	25 %	50 %	25 %	0 %	386859051
16	NC_017778	ATTC	2	8	10741	10748	25 %	50 %	0 %	25 %	386859052
17	NC_017778	GTTT	2	8	10899	10906	0 %	75 %	25 %	0 %	386859052
18	NC_017778	AATT	2	8	11128	11135	50 %	50 %	0 %	0 %	386859052
19	NC_017778	ATTT	2	8	11146	11153	25 %	75 %	0 %	0 %	386859052
20	NC_017778	TTAA	2	8	13429	13436	50 %	50 %	0 %	0 %	386859053
21	NC_017778	ATTT	2	8	13503	13510	25 %	75 %	0 %	0 %	386859053
22	NC_017778	TTTA	2	8	13830	13837	25 %	75 %	0 %	0 %	386859053
23	NC_017778	TTTC	2	8	13859	13866	0 %	75 %	0 %	25 %	386859053
24	NC_017778	TTCT	2	8	14523	14530	0 %	75 %	0 %	25 %	386859054
25	NC_017778	TTTA	2	8	14654	14661	25 %	75 %	0 %	0 %	386859054
26	NC_017778	CTTT	2	8	15279	15286	0 %	75 %	0 %	25 %	386859055
27	NC_017778	TAAA	2	8	15757	15764	75 %	25 %	0 %	0 %	386859055
28	NC_017778	AAAT	2	8	16119	16126	75 %	25 %	0 %	0 %	386859055
29	NC_017778	CATA	2	8	16338	16345	50 %	25 %	0 %	25 %	386859056
30	NC_017778	AGTT	2	8	17068	17075	25 %	50 %	25 %	0 %	386859056
31	NC_017778	TCAC	2	8	17171	17178	25 %	25 %	0 %	50 %	386859056
32	NC_017778	TAAT	2	8	17788	17795	50 %	50 %	0 %	0 %	386859057
33	NC_017778	AGTA	2	8	17857	17864	50 %	25 %	25 %	0 %	386859057
34	NC_017778	TTCT	2	8	18551	18558	0 %	75 %	0 %	25 %	386859058
35	NC_017778	TTCT	2	8	19583	19590	0 %	75 %	0 %	25 %	386859059
36	NC_017778	AAGA	2	8	19915	19922	75 %	0 %	25 %	0 %	386859059
37	NC_017778	AAAT	2	8	20149	20156	75 %	25 %	0 %	0 %	386859059
38	NC_017778	TAAA	2	8	20167	20174	75 %	25 %	0 %	0 %	386859059
39	NC_017778	TTCA	2	8	20643	20650	25 %	50 %	0 %	25 %	386859060
40	NC_017778	TCTT	2	8	21162	21169	0 %	75 %	0 %	25 %	386859060
41	NC_017778	AAAT	2	8	21371	21378	75 %	25 %	0 %	0 %	386859060
42	NC_017778	AAAT	2	8	22694	22701	75 %	25 %	0 %	0 %	386859061
43	NC_017778	AAAT	2	8	23437	23444	75 %	25 %	0 %	0 %	386859062
44	NC_017778	TAAC	2	8	23477	23484	50 %	25 %	0 %	25 %	386859062
45	NC_017778	ACTT	2	8	23604	23611	25 %	50 %	0 %	25 %	386859062
46	NC_017778	AAAT	2	8	23754	23761	75 %	25 %	0 %	0 %	386859062
47	NC_017778	ATAA	2	8	23765	23772	75 %	25 %	0 %	0 %	386859062
48	NC_017778	TAAT	2	8	26248	26255	50 %	50 %	0 %	0 %	386859063
49	NC_017778	TCCA	2	8	26606	26613	25 %	25 %	0 %	50 %	386859063
50	NC_017778	ATTG	2	8	26641	26648	25 %	50 %	25 %	0 %	386859063
51	NC_017778	GCGT	2	8	29087	29094	0 %	25 %	50 %	25 %	386859064
52	NC_017778	TAAT	2	8	29200	29207	50 %	50 %	0 %	0 %	386859064
53	NC_017778	TTTC	2	8	31376	31383	0 %	75 %	0 %	25 %	386859065
54	NC_017778	TTTA	2	8	31832	31839	25 %	75 %	0 %	0 %	386859066
55	NC_017778	AGTA	2	8	32656	32663	50 %	25 %	25 %	0 %	386859067
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57	NC_017778	AATT	2	8	32902	32909	50 %	50 %	0 %	0 %	386859067
58	NC_017778	ATTT	2	8	34103	34110	25 %	75 %	0 %	0 %	386859068
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60	NC_017778	AATT	2	8	36176	36183	50 %	50 %	0 %	0 %	386859069
61	NC_017778	TTCT	2	8	36496	36503	0 %	75 %	0 %	25 %	386859069
62	NC_017778	TAAT	2	8	37668	37675	50 %	50 %	0 %	0 %	386859070
63	NC_017778	TTTA	2	8	37949	37956	25 %	75 %	0 %	0 %	386859070
64	NC_017778	CTTA	2	8	41846	41853	25 %	50 %	0 %	25 %	386859071
65	NC_017778	ATTC	2	8	41977	41984	25 %	50 %	0 %	25 %	386859071
66	NC_017778	TAAA	2	8	42275	42282	75 %	25 %	0 %	0 %	386859071
67	NC_017778	AAAT	2	8	42583	42590	75 %	25 %	0 %	0 %	386859071
68	NC_017778	TTTA	2	8	42845	42852	25 %	75 %	0 %	0 %	386859072
69	NC_017778	AATA	2	8	43211	43218	75 %	25 %	0 %	0 %	386859072
70	NC_017778	ACTT	2	8	43232	43239	25 %	50 %	0 %	25 %	386859072
71	NC_017778	AATT	2	8	43486	43493	50 %	50 %	0 %	0 %	386859072
72	NC_017778	TCTT	2	8	44374	44381	0 %	75 %	0 %	25 %	386859073
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75	NC_017778	GCAA	2	8	46543	46550	50 %	0 %	25 %	25 %	386859076
76	NC_017778	TTTA	2	8	46560	46567	25 %	75 %	0 %	0 %	386859076
77	NC_017778	CTAG	2	8	46819	46826	25 %	25 %	25 %	25 %	386859076
78	NC_017778	AATA	2	8	47470	47477	75 %	25 %	0 %	0 %	386859076
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80	NC_017778	ATTT	2	8	48696	48703	25 %	75 %	0 %	0 %	386859077
81	NC_017778	ATTT	2	8	48880	48887	25 %	75 %	0 %	0 %	386859077
82	NC_017778	ATTT	2	8	48981	48988	25 %	75 %	0 %	0 %	386859077
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84	NC_017778	TAAA	2	8	49818	49825	75 %	25 %	0 %	0 %	386859078
85	NC_017778	AATG	2	8	50321	50328	50 %	25 %	25 %	0 %	386859078
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91	NC_017778	ATTT	2	8	52982	52989	25 %	75 %	0 %	0 %	386859079
92	NC_017778	AAAC	2	8	53319	53326	75 %	0 %	0 %	25 %	386859079
93	NC_017778	GTTA	2	8	53724	53731	25 %	50 %	25 %	0 %	386859080
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101	NC_017778	AAAT	2	8	56375	56382	75 %	25 %	0 %	0 %	386859081
102	NC_017778	TGAA	2	8	56435	56442	50 %	25 %	25 %	0 %	386859081
103	NC_017778	AAAT	2	8	57568	57575	75 %	25 %	0 %	0 %	386859082
104	NC_017778	TCTA	2	8	57990	57997	25 %	50 %	0 %	25 %	386859083
105	NC_017778	AAAT	2	8	58218	58225	75 %	25 %	0 %	0 %	386859083
106	NC_017778	AATA	2	8	58325	58332	75 %	25 %	0 %	0 %	386859083
107	NC_017778	AATT	2	8	59779	59786	50 %	50 %	0 %	0 %	386859084
108	NC_017778	ATCA	2	8	59910	59917	50 %	25 %	0 %	25 %	386859084
109	NC_017778	TAGT	2	8	61545	61552	25 %	50 %	25 %	0 %	386859086
110	NC_017778	ACTC	2	8	61740	61747	25 %	25 %	0 %	50 %	386859086
111	NC_017778	TCAT	2	8	63242	63249	25 %	50 %	0 %	25 %	386859087
112	NC_017778	ATCA	2	8	64253	64260	50 %	25 %	0 %	25 %	386859088
113	NC_017778	TTCA	2	8	64274	64281	25 %	50 %	0 %	25 %	386859088
114	NC_017778	ATCA	2	8	64400	64407	50 %	25 %	0 %	25 %	386859088
115	NC_017778	CATA	2	8	64861	64868	50 %	25 %	0 %	25 %	386859089
116	NC_017778	ATTT	2	8	65703	65710	25 %	75 %	0 %	0 %	386859090
117	NC_017778	ATTT	2	8	65942	65949	25 %	75 %	0 %	0 %	386859090
118	NC_017778	ATTC	2	8	66302	66309	25 %	50 %	0 %	25 %	386859091
119	NC_017778	AAGC	2	8	66468	66475	50 %	0 %	25 %	25 %	386859091
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121	NC_017778	TCTT	3	12	68355	68366	0 %	75 %	0 %	25 %	386859092
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123	NC_017778	CAAA	2	8	69007	69014	75 %	0 %	0 %	25 %	386859093
124	NC_017778	CAAA	2	8	69342	69349	75 %	0 %	0 %	25 %	386859093
125	NC_017778	GAAA	2	8	70436	70443	75 %	0 %	25 %	0 %	386859094
126	NC_017778	AAAT	2	8	70807	70814	75 %	25 %	0 %	0 %	386859094
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130	NC_017778	ATTT	2	8	72714	72721	25 %	75 %	0 %	0 %	386859096
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136	NC_017778	AATT	2	8	73112	73119	50 %	50 %	0 %	0 %	386859096
137	NC_017778	TAAT	2	8	73307	73314	50 %	50 %	0 %	0 %	386859096
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.