MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus anthracis str. H9401 plasmid BAP1

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017726	CTAATG	2	12	1883	1894	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386733564
2	NC_017726	TTTCAT	2	12	4314	4325	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386733568
3	NC_017726	TCAATT	2	12	4334	4345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386733568
4	NC_017726	CTCTTT	2	12	9372	9383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386733572
5	NC_017726	CGTCTG	2	12	10655	10666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386733572
6	NC_017726	ACAAAA	2	12	15039	15050	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386733577
7	NC_017726	TTTCTT	2	12	15800	15811	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386733578
8	NC_017726	TTTTAA	2	12	16749	16760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386733578
9	NC_017726	TTAATT	2	12	16919	16930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386733578
10	NC_017726	ATGAAT	2	12	18587	18598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386733579
11	NC_017726	ACGCCA	2	12	19796	19807	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386733580
12	NC_017726	AGTGAT	2	12	25596	25607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386733585
13	NC_017726	GTCTAC	2	12	32604	32615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386733593
14	NC_017726	TTTTGA	2	12	36334	36345	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386733599
15	NC_017726	ATGTAA	2	12	41121	41132	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386733604
16	NC_017726	TTTTTC	2	12	50424	50435	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386733614
17	NC_017726	ATTCTA	2	12	50660	50671	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386733615
18	NC_017726	TTATTT	2	12	52224	52235	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386733618
19	NC_017726	GTTCCT	2	12	58708	58719	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386733621
20	NC_017726	TGAATT	2	12	64511	64522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386733626
21	NC_017726	ATTGAT	2	12	65485	65496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386733627
22	NC_017726	ACAGCA	2	12	67777	67788	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386733630
23	NC_017726	TTTGGT	2	12	67954	67965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386733630
24	NC_017726	TTTTGA	2	12	69319	69330	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386733631
25	NC_017726	ATCCAG	2	12	70101	70112	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386733631
26	NC_017726	TATAAA	2	12	70127	70138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386733631
27	NC_017726	TAAAGG	2	12	70633	70644	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386733631
28	NC_017726	AAAAAG	2	12	71569	71580	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386733632
29	NC_017726	ACGTGT	2	12	72967	72978	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386733634
30	NC_017726	GTTATT	2	12	77362	77373	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386733640
31	NC_017726	ACAGAT	2	12	78999	79010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386733644
32	NC_017726	ATTTGT	2	12	79682	79693	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386733644
33	NC_017726	AGAAAT	2	12	80342	80353	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386733645
34	NC_017726	CAGAAG	2	12	80779	80790	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386733645
35	NC_017726	AATGAA	2	12	83646	83657	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386733649
36	NC_017726	AATAAA	2	12	87427	87438	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386733653
37	NC_017726	TCAAAT	2	12	87499	87510	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386733653
38	NC_017726	CAAAAG	2	12	89749	89760	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386733657
39	NC_017726	AGCCAG	2	12	90790	90801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386733657
40	NC_017726	AAGAGA	2	12	93226	93237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386733658
41	NC_017726	AAGAGG	2	12	97912	97923	50 %	0 %	50 %	0 %	386733662
42	NC_017726	TATCAA	2	12	104927	104938	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386733671
43	NC_017726	ATTTTT	2	12	110354	110365	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386733675
44	NC_017726	ATCATT	2	12	111402	111413	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386733677
45	NC_017726	AAGTGC	2	12	111485	111496	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386733678
46	NC_017726	ATAAAT	2	12	118614	118625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386733687
47	NC_017726	ATTTTT	2	12	119063	119074	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386733688
48	NC_017726	TAACTT	2	12	120734	120745	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386733690
49	NC_017726	GAAAAA	2	12	122795	122806	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386733693
50	NC_017726	TTTTTG	2	12	126091	126102	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386733696
51	NC_017726	TTCCTT	2	12	129013	129024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386733699
52	NC_017726	AAATTA	2	12	130547	130558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386733701
53	NC_017726	TCTACT	2	12	134361	134372	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386733705
54	NC_017726	TACAAC	2	12	138395	138406	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386733708
55	NC_017726	GTTAGA	2	12	138554	138565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386733708
56	NC_017726	GAATCA	2	12	143920	143931	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386733715
57	NC_017726	TTCTAA	2	12	144189	144200	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386733715
58	NC_017726	CTTTTT	2	12	150592	150603	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386733720
59	NC_017726	TCTCTT	2	12	151666	151677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386733720
60	NC_017726	ATGCCC	2	12	156227	156238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386733727
61	NC_017726	AAAAGA	2	12	158370	158381	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386733731
62	NC_017726	TGTTAG	2	12	165433	165444	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386733743
63	NC_017726	AAGAAA	2	12	168025	168036	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386733745
64	NC_017726	TTCCGG	2	12	170144	170155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386733746
65	NC_017726	TAATTT	2	12	170436	170447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386733746
66	NC_017726	CACCTA	2	12	170787	170798	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386733746
67	NC_017726	TTTATG	2	12	180752	180763	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386733761

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.