MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid cp26

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017725	TAA	2	6	34	39	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854244
2	NC_017725	ACA	2	6	47	52	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854244
3	NC_017725	ATA	2	6	115	120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854244
4	NC_017725	ATT	2	6	215	220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854244
5	NC_017725	TAT	2	6	311	316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854245
6	NC_017725	TAA	2	6	335	340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854245
7	NC_017725	CAG	2	6	410	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854245
8	NC_017725	CTG	2	6	641	646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854245
9	NC_017725	ATT	2	6	855	860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854246
10	NC_017725	ATC	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854246
11	NC_017725	TTA	2	6	1042	1047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854246
12	NC_017725	TAA	2	6	1130	1135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854246
13	NC_017725	TCA	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854246
14	NC_017725	TAT	2	6	1177	1182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854246
15	NC_017725	TGT	2	6	1193	1198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386854246
16	NC_017725	AAT	2	6	1237	1242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854246
17	NC_017725	TTC	2	6	1316	1321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386854246
18	NC_017725	ATT	2	6	1334	1339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854246
19	NC_017725	TAT	2	6	1360	1365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854246
20	NC_017725	AAC	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854246
21	NC_017725	TAA	2	6	1492	1497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854246
22	NC_017725	TAT	2	6	1498	1503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854246
23	NC_017725	GAC	2	6	1588	1593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854246
24	NC_017725	TAA	2	6	1649	1654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854246
25	NC_017725	ATT	2	6	1662	1667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854246
26	NC_017725	TTA	2	6	1815	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854246
27	NC_017725	TAT	2	6	1921	1926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854246
28	NC_017725	ATT	2	6	1971	1976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854246
29	NC_017725	ATT	2	6	2001	2006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854246
30	NC_017725	ATT	2	6	2102	2107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854246
31	NC_017725	TAT	2	6	2116	2121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854246
32	NC_017725	AAT	3	9	2546	2554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854247
33	NC_017725	AAT	2	6	2650	2655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854247
34	NC_017725	ATA	2	6	2756	2761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854247
35	NC_017725	CAT	2	6	2836	2841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854247
36	NC_017725	CAC	2	6	2871	2876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386854247
37	NC_017725	CAA	2	6	2994	2999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854247
38	NC_017725	ATA	2	6	3030	3035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854247
39	NC_017725	ATT	2	6	3113	3118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854247
40	NC_017725	ATA	2	6	3308	3313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854247
41	NC_017725	AGC	2	6	3391	3396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854247
42	NC_017725	TCC	2	6	3400	3405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386854247
43	NC_017725	TCC	2	6	3463	3468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386854247
44	NC_017725	ACA	2	6	3521	3526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854247
45	NC_017725	TGT	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386854247
46	NC_017725	AGT	2	6	3763	3768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854247
47	NC_017725	AGA	2	6	4014	4019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854248
48	NC_017725	TGT	2	6	4044	4049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386854248
49	NC_017725	ATA	2	6	4186	4191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854248
50	NC_017725	GCC	2	6	4224	4229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386854248
51	NC_017725	GAA	2	6	4291	4296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854248
52	NC_017725	ATA	2	6	4315	4320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854248
53	NC_017725	AGG	2	6	4337	4342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386854248
54	NC_017725	GTT	2	6	4476	4481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386854249
55	NC_017725	TGT	2	6	4493	4498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386854249
56	NC_017725	CAC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386854249
57	NC_017725	GAA	2	6	4539	4544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854249
58	NC_017725	AAT	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854249
59	NC_017725	AAG	2	6	4664	4669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854249
60	NC_017725	TAT	2	6	4861	4866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854250
61	NC_017725	ATT	2	6	4938	4943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854250
62	NC_017725	ATA	2	6	4977	4982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854250
63	NC_017725	GAA	2	6	4997	5002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854250
64	NC_017725	AAT	2	6	5077	5082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854250
65	NC_017725	AAC	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854250
66	NC_017725	ATT	2	6	5193	5198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854250
67	NC_017725	TTA	2	6	5217	5222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854250
68	NC_017725	AGA	2	6	5236	5241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854250
69	NC_017725	AAG	2	6	5331	5336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854250
70	NC_017725	ATA	2	6	5468	5473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854250
71	NC_017725	TAC	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854250
72	NC_017725	AAT	2	6	5549	5554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854250
73	NC_017725	AAT	2	6	5669	5674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854250
74	NC_017725	TAG	2	6	5700	5705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854250
75	NC_017725	GAA	2	6	5708	5713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854250
76	NC_017725	ATA	2	6	5756	5761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854250
77	NC_017725	ATA	2	6	5827	5832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854251
78	NC_017725	TAG	2	6	5901	5906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854251
79	NC_017725	ATC	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854251
80	NC_017725	ATT	2	6	6022	6027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854251
81	NC_017725	TAA	2	6	6145	6150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854251
82	NC_017725	ATT	2	6	6190	6195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854251
83	NC_017725	AAT	2	6	6225	6230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854251
84	NC_017725	TAA	2	6	6348	6353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854251
85	NC_017725	GAA	2	6	6359	6364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854251
86	NC_017725	TTA	2	6	6597	6602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854252
87	NC_017725	AAG	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854252
88	NC_017725	TAA	2	6	6694	6699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854252
89	NC_017725	ATT	2	6	6844	6849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854252
90	NC_017725	TAA	2	6	6887	6892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854252
91	NC_017725	ATT	2	6	6897	6902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854252
92	NC_017725	TAA	2	6	7019	7024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854252
93	NC_017725	ATA	2	6	7102	7107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854252
94	NC_017725	ATT	2	6	7162	7167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854252
95	NC_017725	ATT	2	6	7193	7198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854252
96	NC_017725	TAT	2	6	7238	7243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854252
97	NC_017725	ATT	2	6	7249	7254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854252
98	NC_017725	ATG	2	6	7333	7338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854252
99	NC_017725	CTT	2	6	7533	7538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386854252
100	NC_017725	AAG	2	6	7552	7557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854252
101	NC_017725	TAA	2	6	7758	7763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854253
102	NC_017725	ACT	2	6	7817	7822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854253
103	NC_017725	TGT	2	6	7854	7859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386854253
104	NC_017725	TAA	2	6	8069	8074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854254
105	NC_017725	ATA	2	6	8124	8129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854254
106	NC_017725	GAA	2	6	8130	8135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854254
107	NC_017725	TAA	2	6	8183	8188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854254
108	NC_017725	ATT	2	6	8215	8220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854254
109	NC_017725	CTT	2	6	8255	8260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386854254
110	NC_017725	AGA	2	6	8300	8305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854254
111	NC_017725	ATA	2	6	8328	8333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854254
112	NC_017725	GAA	2	6	8373	8378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854254
113	NC_017725	GAA	2	6	8391	8396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854254
114	NC_017725	TTC	2	6	8412	8417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386854254
115	NC_017725	ATA	2	6	9164	9169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854255
116	NC_017725	CAT	2	6	9209	9214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854255
117	NC_017725	ATT	2	6	9255	9260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854256
118	NC_017725	TAA	3	9	9571	9579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854257
119	NC_017725	ACT	2	6	9583	9588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854257
120	NC_017725	TAA	2	6	9637	9642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854257
121	NC_017725	TAG	2	6	9644	9649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386854257
122	NC_017725	TAA	2	6	9691	9696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854257
123	NC_017725	AGA	2	6	9821	9826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854257
124	NC_017725	TAT	2	6	9846	9851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854257
125	NC_017725	TAA	2	6	10082	10087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854258
126	NC_017725	TAA	2	6	10101	10106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854258
127	NC_017725	ATA	2	6	10142	10147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854258
128	NC_017725	ACT	2	6	10213	10218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854258
129	NC_017725	AAT	2	6	10321	10326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854258
130	NC_017725	ACA	2	6	10454	10459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386854258
131	NC_017725	CAT	2	6	10895	10900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854259
132	NC_017725	AAG	2	6	10907	10912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386854259
133	NC_017725	TCT	3	9	10915	10923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386854259
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.