MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-6

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017425	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387826554
2	NC_017425	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	387826555
3	NC_017425	GT	3	6	2299	2304	0 %	50 %	50 %	0 %	387826556
4	NC_017425	CA	3	6	2498	2503	50 %	0 %	0 %	50 %	387826556
5	NC_017425	TA	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	387826557
6	NC_017425	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	387826557
7	NC_017425	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	387826559
8	NC_017425	TG	3	6	5380	5385	0 %	50 %	50 %	0 %	387826560
9	NC_017425	AG	3	6	5521	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	387826561
10	NC_017425	AT	3	6	5914	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	387826562
11	NC_017425	TA	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	387826562
12	NC_017425	AT	4	8	6406	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	387826563
13	NC_017425	AT	3	6	6543	6548	50 %	50 %	0 %	0 %	387826563
14	NC_017425	AC	3	6	7051	7056	50 %	0 %	0 %	50 %	387826564
15	NC_017425	TA	3	6	7499	7504	50 %	50 %	0 %	0 %	387826564
16	NC_017425	AG	3	6	9170	9175	50 %	0 %	50 %	0 %	387826568
17	NC_017425	AT	3	6	9801	9806	50 %	50 %	0 %	0 %	387826568
18	NC_017425	AT	3	6	9930	9935	50 %	50 %	0 %	0 %	387826568
19	NC_017425	TA	3	6	10179	10184	50 %	50 %	0 %	0 %	387826568
20	NC_017425	TA	3	6	10692	10697	50 %	50 %	0 %	0 %	387826569
21	NC_017425	AT	3	6	11222	11227	50 %	50 %	0 %	0 %	387826570
22	NC_017425	AT	4	8	11537	11544	50 %	50 %	0 %	0 %	387826570
23	NC_017425	AC	3	6	11730	11735	50 %	0 %	0 %	50 %	387826570
24	NC_017425	AC	3	6	11745	11750	50 %	0 %	0 %	50 %	387826570
25	NC_017425	CA	3	6	12113	12118	50 %	0 %	0 %	50 %	387826571
26	NC_017425	TA	3	6	12236	12241	50 %	50 %	0 %	0 %	387826571
27	NC_017425	AT	3	6	12557	12562	50 %	50 %	0 %	0 %	387826572
28	NC_017425	CA	3	6	12788	12793	50 %	0 %	0 %	50 %	387826572
29	NC_017425	AT	3	6	13185	13190	50 %	50 %	0 %	0 %	387826573
30	NC_017425	AT	3	6	13870	13875	50 %	50 %	0 %	0 %	387826574
31	NC_017425	TA	3	6	15092	15097	50 %	50 %	0 %	0 %	387826575
32	NC_017425	AT	3	6	15111	15116	50 %	50 %	0 %	0 %	387826575
33	NC_017425	AT	3	6	15494	15499	50 %	50 %	0 %	0 %	387826577
34	NC_017425	AT	3	6	15904	15909	50 %	50 %	0 %	0 %	387826578
35	NC_017425	AT	3	6	16072	16077	50 %	50 %	0 %	0 %	387826578
36	NC_017425	AT	3	6	16377	16382	50 %	50 %	0 %	0 %	387826579
37	NC_017425	AT	3	6	16604	16609	50 %	50 %	0 %	0 %	387826580
38	NC_017425	AT	3	6	16782	16787	50 %	50 %	0 %	0 %	387826580
39	NC_017425	AT	3	6	17010	17015	50 %	50 %	0 %	0 %	387826580
40	NC_017425	AT	4	8	21031	21038	50 %	50 %	0 %	0 %	387826585
41	NC_017425	TA	3	6	21528	21533	50 %	50 %	0 %	0 %	387826585
42	NC_017425	AT	3	6	22685	22690	50 %	50 %	0 %	0 %	387826587
43	NC_017425	AT	3	6	22739	22744	50 %	50 %	0 %	0 %	387826587
44	NC_017425	TA	3	6	24014	24019	50 %	50 %	0 %	0 %	387826588
45	NC_017425	AG	3	6	24203	24208	50 %	0 %	50 %	0 %	387826588
46	NC_017425	AG	3	6	25217	25222	50 %	0 %	50 %	0 %	387826590
47	NC_017425	GA	3	6	25337	25342	50 %	0 %	50 %	0 %	387826590
48	NC_017425	TA	3	6	26975	26980	50 %	50 %	0 %	0 %	387826591
49	NC_017425	AG	3	6	27731	27736	50 %	0 %	50 %	0 %	387826592
50	NC_017425	TA	3	6	28183	28188	50 %	50 %	0 %	0 %	387826593
51	NC_017425	GA	3	6	28505	28510	50 %	0 %	50 %	0 %	387826593
52	NC_017425	AT	3	6	28613	28618	50 %	50 %	0 %	0 %	387826593
53	NC_017425	TG	3	6	28993	28998	0 %	50 %	50 %	0 %	387826594
54	NC_017425	AT	3	6	29335	29340	50 %	50 %	0 %	0 %	387826594
55	NC_017425	AT	3	6	29859	29864	50 %	50 %	0 %	0 %	387826595
56	NC_017425	AG	3	6	30763	30768	50 %	0 %	50 %	0 %	387826595

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.