MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-6

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017425	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826554
2	NC_017425	CTGATA	2	12	2984	2995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826557
3	NC_017425	GATAAA	2	12	4479	4490	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826559
4	NC_017425	GAATTT	2	12	5203	5214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826560
5	NC_017425	TGAACT	2	12	5241	5252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826560
6	NC_017425	AAATCT	2	12	7672	7683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387826564
7	NC_017425	AAATAA	2	12	10255	10266	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826568
8	NC_017425	TTGATA	2	12	14946	14957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826575
9	NC_017425	AGTTAA	2	12	16277	16288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826579
10	NC_017425	AATTTA	2	12	16877	16888	50 %	50 %	0 %	0 %	387826580
11	NC_017425	TAATGA	2	12	17353	17364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826581
12	NC_017425	CTAAAT	2	12	17445	17456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387826581
13	NC_017425	TTTTCG	2	12	18296	18307	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387826582
14	NC_017425	ATAGAT	2	12	20949	20960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826585
15	NC_017425	ATAATT	2	12	21578	21589	50 %	50 %	0 %	0 %	387826585
16	NC_017425	AATTTA	2	12	22423	22434	50 %	50 %	0 %	0 %	387826587
17	NC_017425	TAGTGT	2	12	24658	24669	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387826588
18	NC_017425	AAAGCA	2	12	29415	29426	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387826594

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.