MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-6

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017425	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	387826554
2	NC_017425	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	387826555
3	NC_017425	TAAAT	2	10	2415	2424	60 %	40 %	0 %	0 %	387826556
4	NC_017425	ATTTA	2	10	5695	5704	40 %	60 %	0 %	0 %	387826561
5	NC_017425	GAAAA	2	10	6918	6927	80 %	0 %	20 %	0 %	387826564
6	NC_017425	GAAAA	2	10	10355	10364	80 %	0 %	20 %	0 %	387826569
7	NC_017425	TTAAA	2	10	11868	11877	60 %	40 %	0 %	0 %	387826570
8	NC_017425	AACTT	2	10	12737	12746	40 %	40 %	0 %	20 %	387826572
9	NC_017425	TACTT	2	10	13295	13304	20 %	60 %	0 %	20 %	387826573
10	NC_017425	GAAAA	2	10	13373	13382	80 %	0 %	20 %	0 %	387826573
11	NC_017425	AAAGT	2	10	13395	13404	60 %	20 %	20 %	0 %	387826573
12	NC_017425	ATTCA	2	10	14203	14212	40 %	40 %	0 %	20 %	387826574
13	NC_017425	AGACA	2	10	14503	14512	60 %	0 %	20 %	20 %	387826575
14	NC_017425	ATTAA	2	10	15238	15247	60 %	40 %	0 %	0 %	387826576
15	NC_017425	AGTAA	2	10	15875	15884	60 %	20 %	20 %	0 %	387826578
16	NC_017425	TCACT	2	10	16032	16041	20 %	40 %	0 %	40 %	387826578
17	NC_017425	TTGCT	2	10	16129	16138	0 %	60 %	20 %	20 %	387826579
18	NC_017425	TATGT	2	10	16239	16248	20 %	60 %	20 %	0 %	387826579
19	NC_017425	GAGTT	2	10	24297	24306	20 %	40 %	40 %	0 %	387826588
20	NC_017425	ATAAA	2	10	24742	24751	80 %	20 %	0 %	0 %	387826589
21	NC_017425	ACTTG	2	10	25091	25100	20 %	40 %	20 %	20 %	387826589
22	NC_017425	ATTTT	2	10	25842	25851	20 %	80 %	0 %	0 %	387826590
23	NC_017425	TAAAT	2	10	27713	27722	60 %	40 %	0 %	0 %	387826592
24	NC_017425	TTACA	2	10	30636	30645	40 %	40 %	0 %	20 %	387826595

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.