MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-10

Total Repeats: 395

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017424	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827799
2	NC_017424	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827799
3	NC_017424	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827799
4	NC_017424	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827799
5	NC_017424	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827799
6	NC_017424	AAT	2	6	459	464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827799
7	NC_017424	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827799
8	NC_017424	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827799
9	NC_017424	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827799
10	NC_017424	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827799
11	NC_017424	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827799
12	NC_017424	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827799
13	NC_017424	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827799
14	NC_017424	AGG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827799
15	NC_017424	ATG	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827799
16	NC_017424	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827799
17	NC_017424	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827799
18	NC_017424	AGT	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827799
19	NC_017424	TAA	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827799
20	NC_017424	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827799
21	NC_017424	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827799
22	NC_017424	ATA	2	6	2025	2030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827800
23	NC_017424	TAG	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827800
24	NC_017424	AAC	2	6	2255	2260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827800
25	NC_017424	TGG	3	9	2279	2287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827800
26	NC_017424	TAA	2	6	2571	2576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827800
27	NC_017424	GCT	2	6	2661	2666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827801
28	NC_017424	TGA	2	6	2744	2749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827801
29	NC_017424	GTT	2	6	2824	2829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827801
30	NC_017424	TTA	2	6	3142	3147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827801
31	NC_017424	CCA	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827801
32	NC_017424	GGT	2	6	3336	3341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827801
33	NC_017424	ATT	2	6	3391	3396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827802
34	NC_017424	AAG	2	6	3415	3420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827802
35	NC_017424	TGA	2	6	3478	3483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827802
36	NC_017424	ATC	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827802
37	NC_017424	TGG	2	6	3652	3657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827802
38	NC_017424	CTA	2	6	3711	3716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827802
39	NC_017424	AAT	2	6	3731	3736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827802
40	NC_017424	TAA	2	6	3796	3801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827802
41	NC_017424	TAA	2	6	3944	3949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827802
42	NC_017424	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
43	NC_017424	TGA	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827803
44	NC_017424	ATT	2	6	3987	3992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
45	NC_017424	TAT	2	6	4036	4041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
46	NC_017424	ACA	2	6	4139	4144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827803
47	NC_017424	ATT	2	6	4206	4211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
48	NC_017424	TAA	3	9	4291	4299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827803
49	NC_017424	AGT	2	6	4334	4339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827803
50	NC_017424	TTA	2	6	4353	4358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
51	NC_017424	ACT	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827803
52	NC_017424	AGA	2	6	4465	4470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827803
53	NC_017424	CGA	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827803
54	NC_017424	GAT	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827803
55	NC_017424	GCA	3	9	4619	4627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827803
56	NC_017424	AGT	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827803
57	NC_017424	TAA	2	6	4690	4695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827803
58	NC_017424	AGA	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827803
59	NC_017424	TTA	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827803
60	NC_017424	GGT	2	6	4871	4876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827803
61	NC_017424	CTA	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827803
62	NC_017424	GAA	2	6	4986	4991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827804
63	NC_017424	GTT	2	6	5199	5204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827804
64	NC_017424	ATT	2	6	5260	5265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827804
65	NC_017424	TAG	2	6	5270	5275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827804
66	NC_017424	GAA	2	6	5286	5291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827804
67	NC_017424	GGC	2	6	5292	5297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387827804
68	NC_017424	TGT	2	6	5494	5499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827805
69	NC_017424	TTC	2	6	5515	5520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827805
70	NC_017424	TTA	2	6	5568	5573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827805
71	NC_017424	TGG	2	6	5817	5822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827806
72	NC_017424	AAT	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827806
73	NC_017424	TAT	2	6	6020	6025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827806
74	NC_017424	GTA	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827806
75	NC_017424	GCA	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827806
76	NC_017424	TTG	2	6	6107	6112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827806
77	NC_017424	AAT	2	6	6234	6239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827807
78	NC_017424	GCT	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827807
79	NC_017424	ATA	2	6	6309	6314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827807
80	NC_017424	ATA	2	6	6502	6507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827807
81	NC_017424	AGG	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827807
82	NC_017424	TAG	2	6	6759	6764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827808
83	NC_017424	ATT	2	6	6770	6775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827808
84	NC_017424	TAA	2	6	6816	6821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827808
85	NC_017424	TGC	2	6	6825	6830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827808
86	NC_017424	TAA	2	6	6858	6863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827808
87	NC_017424	ACT	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827808
88	NC_017424	GAA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827808
89	NC_017424	TGT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827808
90	NC_017424	TTA	2	6	7073	7078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827808
91	NC_017424	GAT	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827808
92	NC_017424	GAT	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827808
93	NC_017424	AAT	2	6	7249	7254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827808
94	NC_017424	TTG	2	6	7355	7360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827808
95	NC_017424	CTT	2	6	7411	7416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827808
96	NC_017424	AAG	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827808
97	NC_017424	ATT	2	6	7522	7527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827808
98	NC_017424	TTA	2	6	7532	7537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827808
99	NC_017424	TTA	2	6	7661	7666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827808
100	NC_017424	TAC	2	6	7776	7781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827808
101	NC_017424	TGG	2	6	7874	7879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827809
102	NC_017424	CAA	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827809
103	NC_017424	TAG	2	6	7940	7945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827809
104	NC_017424	TAA	2	6	7966	7971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827809
105	NC_017424	TGA	2	6	8060	8065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827809
106	NC_017424	ACA	2	6	8074	8079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827809
107	NC_017424	ATT	2	6	8142	8147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827809
108	NC_017424	AAG	2	6	8180	8185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827809
109	NC_017424	CTG	2	6	8191	8196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827809
110	NC_017424	AAC	2	6	8253	8258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827809
111	NC_017424	TTA	2	6	8275	8280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827810
112	NC_017424	TTA	2	6	8510	8515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827810
113	NC_017424	TTG	2	6	8527	8532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827810
114	NC_017424	AAT	2	6	8534	8539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827810
115	NC_017424	AAT	2	6	8619	8624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827810
116	NC_017424	TCA	2	6	8694	8699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827810
117	NC_017424	TGC	2	6	9020	9025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827812
118	NC_017424	AAT	2	6	9120	9125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827812
119	NC_017424	GAC	2	6	9298	9303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827812
120	NC_017424	AGC	2	6	9353	9358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827812
121	NC_017424	TTG	2	6	9376	9381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827812
122	NC_017424	TGG	2	6	9440	9445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827812
123	NC_017424	AGA	2	6	9503	9508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827812
124	NC_017424	TAA	2	6	9524	9529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827812
125	NC_017424	AAC	2	6	9607	9612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827812
126	NC_017424	ATG	2	6	9670	9675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827812
127	NC_017424	CAA	2	6	9700	9705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827812
128	NC_017424	AGC	2	6	9710	9715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827812
129	NC_017424	TTG	2	6	9736	9741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827812
130	NC_017424	GTT	2	6	9765	9770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827812
131	NC_017424	TAA	2	6	9928	9933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827812
132	NC_017424	TAA	2	6	10031	10036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827812
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383	NC_017424	TGA	2	6	29617	29622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827838
384	NC_017424	TGA	2	6	29710	29715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827838
385	NC_017424	TAT	2	6	29720	29725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827838
386	NC_017424	TAT	2	6	29767	29772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827838
387	NC_017424	ATA	2	6	29835	29840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827838
388	NC_017424	TGG	2	6	29851	29856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827838
389	NC_017424	AAG	2	6	29881	29886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827838
390	NC_017424	TAA	2	6	29932	29937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827838
391	NC_017424	CAG	2	6	30001	30006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827838
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395	NC_017424	TGT	2	6	30096	30101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827838

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.