MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp38

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017421	TAA	2	6	6034	6039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827770
2	NC_017421	TAC	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827770
3	NC_017421	ATC	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827770
4	NC_017421	AAT	2	6	6123	6128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827770
5	NC_017421	TTA	2	6	6210	6215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827770
6	NC_017421	AAG	2	6	6238	6243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827770
7	NC_017421	ACA	2	6	6252	6257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827770
8	NC_017421	CAA	2	6	6355	6360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827770
9	NC_017421	CAA	2	6	6513	6518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827770
10	NC_017421	AGC	2	6	6719	6724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827770
11	NC_017421	AAG	2	6	6769	6774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827770
12	NC_017421	AAG	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827771
13	NC_017421	AAT	2	6	7747	7752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827772
14	NC_017421	TAT	2	6	8949	8954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827773
15	NC_017421	CAA	2	6	8970	8975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827773
16	NC_017421	CAA	2	6	9058	9063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827773
17	NC_017421	AAT	2	6	10889	10894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827774
18	NC_017421	CTT	2	6	11059	11064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827774
19	NC_017421	ATA	2	6	11218	11223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827774
20	NC_017421	TAT	2	6	11242	11247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827774
21	NC_017421	ATC	2	6	11252	11257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827774
22	NC_017421	ATT	2	6	11288	11293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827774
23	NC_017421	TTC	2	6	11336	11341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827774
24	NC_017421	CTT	2	6	11374	11379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827774
25	NC_017421	CTT	2	6	11486	11491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827775
26	NC_017421	TAT	2	6	11549	11554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827775
27	NC_017421	AAT	2	6	11555	11560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827775
28	NC_017421	TAA	2	6	11636	11641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827775
29	NC_017421	ACA	2	6	11650	11655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827775
30	NC_017421	AAT	3	9	11739	11747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827775
31	NC_017421	GTA	2	6	11755	11760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827775
32	NC_017421	TCA	2	6	11899	11904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827775
33	NC_017421	TAA	2	6	11982	11987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827775
34	NC_017421	ATA	2	6	12374	12379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827776
35	NC_017421	TAT	2	6	12403	12408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827776
36	NC_017421	TTG	2	6	12468	12473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827776
37	NC_017421	CTT	2	6	12475	12480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827776
38	NC_017421	TAA	2	6	12504	12509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827776
39	NC_017421	ATT	2	6	12518	12523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827776
40	NC_017421	TTC	2	6	12626	12631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827776
41	NC_017421	TAT	2	6	12673	12678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827776
42	NC_017421	CTT	2	6	12691	12696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827776
43	NC_017421	TTA	2	6	12703	12708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827776
44	NC_017421	TGT	2	6	12785	12790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827777
45	NC_017421	TCT	2	6	12973	12978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827777
46	NC_017421	ATT	2	6	13125	13130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827777
47	NC_017421	GGT	2	6	13191	13196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827777
48	NC_017421	TTA	2	6	13210	13215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827777
49	NC_017421	TCT	2	6	13465	13470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827777
50	NC_017421	TTA	2	6	13481	13486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827777
51	NC_017421	CTT	2	6	13502	13507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827777
52	NC_017421	TGA	3	9	13546	13554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827777
53	NC_017421	AGT	2	6	13684	13689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827777
54	NC_017421	TTG	2	6	13690	13695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827777
55	NC_017421	TGT	2	6	13706	13711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827777
56	NC_017421	ATA	2	6	13967	13972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827778
57	NC_017421	TAT	2	6	13986	13991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827778
58	NC_017421	AAC	2	6	13993	13998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827778
59	NC_017421	GTT	2	6	14126	14131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827779
60	NC_017421	TTA	2	6	14168	14173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827779
61	NC_017421	TTA	2	6	15851	15856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827780
62	NC_017421	TAA	2	6	15873	15878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827780
63	NC_017421	GTT	3	9	16823	16831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827781
64	NC_017421	ATT	2	6	16836	16841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827781
65	NC_017421	GTT	2	6	16852	16857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827781
66	NC_017421	TTA	2	6	16911	16916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827781
67	NC_017421	TGA	2	6	16950	16955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827781
68	NC_017421	TTG	2	6	17039	17044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827781
69	NC_017421	CTT	2	6	17062	17067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827781
70	NC_017421	TTC	2	6	17091	17096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827781
71	NC_017421	CTT	2	6	17482	17487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827781
72	NC_017421	ATT	2	6	17898	17903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827782
73	NC_017421	AGA	2	6	18025	18030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827782
74	NC_017421	ATT	2	6	18048	18053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827782
75	NC_017421	AGA	2	6	18271	18276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827782
76	NC_017421	AGA	2	6	18347	18352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827782
77	NC_017421	ACT	2	6	18453	18458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827782
78	NC_017421	ATG	2	6	18562	18567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827783
79	NC_017421	AAT	2	6	18633	18638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827783
80	NC_017421	AAT	2	6	18645	18650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827783
81	NC_017421	ATT	2	6	18718	18723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827783
82	NC_017421	ATT	2	6	18868	18873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827783
83	NC_017421	TGA	2	6	18904	18909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827783
84	NC_017421	TGG	2	6	18941	18946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827783
85	NC_017421	TAT	2	6	19002	19007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827783
86	NC_017421	ATA	2	6	19063	19068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827783
87	NC_017421	TGT	2	6	19274	19279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827783
88	NC_017421	ATT	2	6	19448	19453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827783
89	NC_017421	AGG	2	6	19456	19461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827783
90	NC_017421	TTA	2	6	19518	19523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827783
91	NC_017421	AAT	2	6	19529	19534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827783
92	NC_017421	TAA	2	6	19635	19640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827784
93	NC_017421	ATT	2	6	19663	19668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827784
94	NC_017421	ACA	2	6	19919	19924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827784
95	NC_017421	GAA	2	6	19981	19986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827784
96	NC_017421	GGA	2	6	20044	20049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827784
97	NC_017421	TAA	2	6	20099	20104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827784
98	NC_017421	AGA	2	6	20183	20188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827784
99	NC_017421	TAA	2	6	20238	20243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827784
100	NC_017421	TAG	2	6	20407	20412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827785
101	NC_017421	ATT	2	6	20472	20477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827785
102	NC_017421	GAA	2	6	20519	20524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827785
103	NC_017421	ATG	2	6	20562	20567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827785
104	NC_017421	TTC	2	6	20617	20622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827785
105	NC_017421	AGC	2	6	20675	20680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827785
106	NC_017421	TTA	2	6	20687	20692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827785
107	NC_017421	GTA	2	6	20742	20747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827785
108	NC_017421	CAG	2	6	20883	20888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827785
109	NC_017421	ATA	2	6	20889	20894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827785
110	NC_017421	TAC	2	6	20905	20910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827785
111	NC_017421	AAC	2	6	21106	21111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827785
112	NC_017421	TCT	2	6	21139	21144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827785
113	NC_017421	TTA	2	6	21270	21275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827785
114	NC_017421	TGT	2	6	21280	21285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827785
115	NC_017421	TTG	2	6	21291	21296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827785
116	NC_017421	CTC	2	6	21357	21362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387827785
117	NC_017421	TAC	2	6	21380	21385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827785
118	NC_017421	TAT	2	6	21398	21403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827785
119	NC_017421	GTA	2	6	21494	21499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827785
120	NC_017421	TAA	2	6	21586	21591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827786
121	NC_017421	TAT	2	6	21609	21614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827786
122	NC_017421	AGA	2	6	21680	21685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827786
123	NC_017421	ATT	2	6	21702	21707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827786
124	NC_017421	ATA	2	6	21715	21720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827786
125	NC_017421	TTA	2	6	21909	21914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827786
126	NC_017421	TTA	2	6	21978	21983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827786
127	NC_017421	TAA	2	6	21989	21994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827786
128	NC_017421	AAG	2	6	22042	22047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827786
129	NC_017421	ATT	2	6	22152	22157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827786
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.