MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-2

Total Repeats: 320

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017419	ATT	2	6	285	290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827739
2	NC_017419	GGA	2	6	295	300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827739
3	NC_017419	AAT	2	6	358	363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827739
4	NC_017419	AAG	2	6	368	373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827739
5	NC_017419	AAG	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827739
6	NC_017419	AGG	2	6	578	583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827739
7	NC_017419	CTA	2	6	596	601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827739
8	NC_017419	GAA	2	6	604	609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827739
9	NC_017419	TGA	2	6	618	623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827739
10	NC_017419	AGA	2	6	639	644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827739
11	NC_017419	TTC	2	6	650	655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827739
12	NC_017419	AAG	2	6	683	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827739
13	NC_017419	TAA	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827739
14	NC_017419	ATG	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827739
15	NC_017419	CAT	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827739
16	NC_017419	AAT	2	6	829	834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827739
17	NC_017419	AGC	2	6	857	862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827739
18	NC_017419	TAT	2	6	948	953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827739
19	NC_017419	ATA	2	6	974	979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827739
20	NC_017419	TTA	2	6	984	989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827739
21	NC_017419	AAG	2	6	1026	1031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827739
22	NC_017419	TTA	2	6	1106	1111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827739
23	NC_017419	AAT	2	6	1229	1234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827740
24	NC_017419	CTA	2	6	1275	1280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827740
25	NC_017419	ATA	2	6	1290	1295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827740
26	NC_017419	AAT	2	6	1348	1353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827740
27	NC_017419	ATA	2	6	1377	1382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827740
28	NC_017419	TAA	2	6	1389	1394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827740
29	NC_017419	CAA	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827740
30	NC_017419	ATT	2	6	1463	1468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827740
31	NC_017419	AAG	2	6	1500	1505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827740
32	NC_017419	AGA	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827740
33	NC_017419	ATT	2	6	1688	1693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827740
34	NC_017419	GTT	2	6	1769	1774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827740
35	NC_017419	CAA	2	6	1776	1781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827740
36	NC_017419	TTA	2	6	1905	1910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827740
37	NC_017419	AAG	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827740
38	NC_017419	TCA	2	6	2028	2033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827740
39	NC_017419	GTG	3	9	2446	2454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827741
40	NC_017419	ACT	2	6	2456	2461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827741
41	NC_017419	GGA	2	6	2478	2483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827741
42	NC_017419	AGG	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827741
43	NC_017419	TAA	2	6	2551	2556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827741
44	NC_017419	GGA	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827741
45	NC_017419	TAT	2	6	2566	2571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827741
46	NC_017419	AGG	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827741
47	NC_017419	GCA	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827741
48	NC_017419	ATT	3	9	2616	2624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827741
49	NC_017419	TAA	3	9	3095	3103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827742
50	NC_017419	ACT	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827742
51	NC_017419	ACT	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827742
52	NC_017419	TAA	2	6	3407	3412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827742
53	NC_017419	GAT	2	6	3573	3578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827742
54	NC_017419	ACT	2	6	3595	3600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827742
55	NC_017419	ATA	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827742
56	NC_017419	ATC	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827742
57	NC_017419	CTA	3	9	3732	3740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827742
58	NC_017419	ATT	2	6	3850	3855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827742
59	NC_017419	TTC	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827742
60	NC_017419	TAA	2	6	4041	4046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827742
61	NC_017419	ATT	2	6	4057	4062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827742
62	NC_017419	TAA	2	6	4067	4072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827742
63	NC_017419	TTA	2	6	4181	4186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827742
64	NC_017419	ATT	2	6	4193	4198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827742
65	NC_017419	CAA	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827743
66	NC_017419	TAA	2	6	4423	4428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
67	NC_017419	CAA	2	6	4450	4455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827743
68	NC_017419	ACA	2	6	4459	4464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827743
69	NC_017419	TTC	2	6	4476	4481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827743
70	NC_017419	ATA	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
71	NC_017419	AAC	2	6	4639	4644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827743
72	NC_017419	ACT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827743
73	NC_017419	ATT	2	6	4701	4706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827743
74	NC_017419	TAA	2	6	4804	4809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
75	NC_017419	TAA	2	6	4843	4848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
76	NC_017419	ATA	3	9	4851	4859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
77	NC_017419	AGA	2	6	4864	4869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827743
78	NC_017419	TTA	2	6	4934	4939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827743
79	NC_017419	TTC	2	6	4947	4952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827743
80	NC_017419	TAA	2	6	4972	4977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
81	NC_017419	CAA	3	9	5111	5119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827743
82	NC_017419	AAC	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827743
83	NC_017419	ATA	2	6	5418	5423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
84	NC_017419	TAA	3	9	5431	5439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
85	NC_017419	TTA	3	9	5440	5448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827743
86	NC_017419	ATA	2	6	5462	5467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
87	NC_017419	AAG	2	6	5493	5498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827743
88	NC_017419	TTA	2	6	5586	5591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827744
89	NC_017419	ATG	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827744
90	NC_017419	TAA	2	6	5662	5667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827744
91	NC_017419	ATT	2	6	5701	5706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827744
92	NC_017419	GAA	2	6	5723	5728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827744
93	NC_017419	GAT	2	6	5753	5758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827744
94	NC_017419	TTA	2	6	5773	5778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827744
95	NC_017419	ACC	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827744
96	NC_017419	ATT	2	6	5965	5970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827744
97	NC_017419	TAT	2	6	6081	6086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827744
98	NC_017419	GAG	2	6	6107	6112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827745
99	NC_017419	CTT	2	6	6125	6130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827745
100	NC_017419	CAA	2	6	6143	6148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827745
101	NC_017419	TAA	2	6	6162	6167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827745
102	NC_017419	ATC	2	6	6227	6232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827745
103	NC_017419	TAA	2	6	6272	6277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827745
104	NC_017419	TGT	2	6	6300	6305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827745
105	NC_017419	AAG	2	6	6368	6373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827745
106	NC_017419	ATT	2	6	6416	6421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827745
107	NC_017419	AGA	2	6	6423	6428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827745
108	NC_017419	TAA	2	6	6440	6445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827745
109	NC_017419	TAA	2	6	6557	6562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827745
110	NC_017419	AAT	2	6	6583	6588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827745
111	NC_017419	ATT	2	6	6610	6615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827745
112	NC_017419	TTA	2	6	6673	6678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827745
113	NC_017419	AAT	2	6	6694	6699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827745
114	NC_017419	ATA	2	6	6739	6744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827745
115	NC_017419	TAC	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827745
116	NC_017419	TAA	3	9	6892	6900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827746
117	NC_017419	GAA	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827746
118	NC_017419	GAT	2	6	6999	7004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827746
119	NC_017419	GAA	2	6	7176	7181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827746
120	NC_017419	TAA	2	6	7261	7266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827746
121	NC_017419	CAC	2	6	7267	7272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827746
122	NC_017419	TCT	2	6	7340	7345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827746
123	NC_017419	AGA	2	6	7391	7396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827746
124	NC_017419	ATT	2	6	7719	7724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827747
125	NC_017419	TCT	2	6	7765	7770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827747
126	NC_017419	AAT	2	6	7773	7778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827747
127	NC_017419	CCA	2	6	8031	8036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827747
128	NC_017419	GGT	2	6	8157	8162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827747
129	NC_017419	TTC	2	6	8220	8225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827747
130	NC_017419	TCA	2	6	8284	8289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827747
131	NC_017419	TCA	2	6	8329	8334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827747
132	NC_017419	TTC	2	6	8382	8387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827747
133	NC_017419	CAG	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827747
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.