MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-2

Total Repeats: 572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017419	A	6	6	25753	25758	100 %	0 %	0 %	0 %	387827763
502	NC_017419	A	6	6	25780	25785	100 %	0 %	0 %	0 %	387827763
503	NC_017419	AGAGAA	2	12	25804	25815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827763
504	NC_017419	GTA	2	6	25820	25825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827763
505	NC_017419	AAT	2	6	25894	25899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827763
506	NC_017419	CGC	2	6	25922	25927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387827763
507	NC_017419	GA	3	6	25930	25935	50 %	0 %	50 %	0 %	387827763
508	NC_017419	GAA	2	6	25970	25975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827763
509	NC_017419	CGT	2	6	25980	25985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827763
510	NC_017419	A	6	6	26047	26052	100 %	0 %	0 %	0 %	387827763
511	NC_017419	AGG	2	6	26076	26081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827764
512	NC_017419	AAG	2	6	26112	26117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827764
513	NC_017419	AAGCTA	2	12	26171	26182	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387827764
514	NC_017419	AGA	2	6	26220	26225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827764
515	NC_017419	TGA	2	6	26256	26261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827764
516	NC_017419	AGA	2	6	26270	26275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827764
517	NC_017419	AT	3	6	26325	26330	50 %	50 %	0 %	0 %	387827764
518	NC_017419	A	7	7	26416	26422	100 %	0 %	0 %	0 %	387827764
519	NC_017419	TGC	2	6	26427	26432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827764
520	NC_017419	CGG	2	6	26435	26440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387827764
521	NC_017419	TGA	2	6	26646	26651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827765
522	NC_017419	TTTAT	2	10	26694	26703	20 %	80 %	0 %	0 %	387827765
523	NC_017419	AG	3	6	26719	26724	50 %	0 %	50 %	0 %	387827765
524	NC_017419	TAT	2	6	26731	26736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827765
525	NC_017419	AGG	2	6	26751	26756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827765
526	NC_017419	AAT	2	6	26801	26806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827765
527	NC_017419	TAA	2	6	26866	26871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827765
528	NC_017419	GT	3	6	26907	26912	0 %	50 %	50 %	0 %	387827765
529	NC_017419	A	6	6	26975	26980	100 %	0 %	0 %	0 %	387827765
530	NC_017419	AAG	2	6	27009	27014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827765
531	NC_017419	GATA	2	8	27073	27080	50 %	25 %	25 %	0 %	387827765
532	NC_017419	ATCA	2	8	27083	27090	50 %	25 %	0 %	25 %	387827765
533	NC_017419	CTA	2	6	27134	27139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827765
534	NC_017419	GTA	2	6	27141	27146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827765
535	NC_017419	TGAAAA	2	12	27228	27239	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387827766
536	NC_017419	TAT	2	6	27276	27281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827766
537	NC_017419	GTA	2	6	27307	27312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827766
538	NC_017419	ATA	2	6	27470	27475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827766
539	NC_017419	TAAA	2	8	27500	27507	75 %	25 %	0 %	0 %	387827766
540	NC_017419	ACAT	2	8	27587	27594	50 %	25 %	0 %	25 %	387827766
541	NC_017419	AGA	2	6	27600	27605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827766
542	NC_017419	AAT	2	6	27685	27690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827766
543	NC_017419	AAT	2	6	27762	27767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827766
544	NC_017419	GCA	2	6	27835	27840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827766
545	NC_017419	T	7	7	27866	27872	0 %	100 %	0 %	0 %	387827766
546	NC_017419	AG	3	6	27879	27884	50 %	0 %	50 %	0 %	387827766
547	NC_017419	TAA	2	6	27918	27923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827766
548	NC_017419	ATC	2	6	28119	28124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827767
549	NC_017419	AGT	2	6	28125	28130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827767
550	NC_017419	ACA	2	6	28132	28137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827767
551	NC_017419	AT	3	6	28156	28161	50 %	50 %	0 %	0 %	387827767
552	NC_017419	AAC	2	6	28187	28192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827767
553	NC_017419	TAC	2	6	28326	28331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827767
554	NC_017419	AT	3	6	28367	28372	50 %	50 %	0 %	0 %	387827767
555	NC_017419	TAC	2	6	28413	28418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827767
556	NC_017419	CTT	2	6	28606	28611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827767
557	NC_017419	TTC	2	6	28707	28712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827767
558	NC_017419	TTA	2	6	28742	28747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827767
559	NC_017419	AGT	3	9	28752	28760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827767
560	NC_017419	ATTA	2	8	28803	28810	50 %	50 %	0 %	0 %	387827767
561	NC_017419	ATT	2	6	28814	28819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827767
562	NC_017419	CTTTA	2	10	28843	28852	20 %	60 %	0 %	20 %	387827768
563	NC_017419	A	8	8	28859	28866	100 %	0 %	0 %	0 %	387827768
564	NC_017419	T	7	7	28919	28925	0 %	100 %	0 %	0 %	387827768
565	NC_017419	TAG	2	6	29011	29016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827768
566	NC_017419	TAA	2	6	29043	29048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827768
567	NC_017419	TTGA	2	8	29060	29067	25 %	50 %	25 %	0 %	387827768
568	NC_017419	GTT	2	6	29224	29229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827768
569	NC_017419	TAG	2	6	29230	29235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827768
570	NC_017419	T	6	6	29256	29261	0 %	100 %	0 %	0 %	387827768
571	NC_017419	TAAT	2	8	29268	29275	50 %	50 %	0 %	0 %	387827768
572	NC_017419	TTA	2	6	29337	29342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827768

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