MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 chromosome

Total Repeats: 584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017418	AAGAAA	2	12	6938	6949	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387826932
2	NC_017418	CAATAG	2	12	8440	8451	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387826934
3	NC_017418	CAATAA	2	12	8863	8874	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387826934
4	NC_017418	TCTATT	2	12	8895	8906	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826934
5	NC_017418	TTTAAT	2	12	9091	9102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826935
6	NC_017418	AATAAA	2	12	9303	9314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826935
7	NC_017418	TAAAGA	2	12	9729	9740	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826935
8	NC_017418	TAAAAA	2	12	9773	9784	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826935
9	NC_017418	TAAGCA	2	12	11614	11625	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387826938
10	NC_017418	AAAACA	2	12	13739	13750	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387826940
11	NC_017418	CTTGGG	2	12	16079	16090	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387826943
12	NC_017418	TTAAAA	2	12	16588	16599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826943
13	NC_017418	AAATTA	2	12	22250	22261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826948
14	NC_017418	TTCAAA	2	12	22288	22299	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387826948
15	NC_017418	GTAAAT	2	12	26000	26011	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826952
16	NC_017418	CAAATA	2	12	26761	26772	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387826953
17	NC_017418	TCAAAC	2	12	28353	28364	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387826956
18	NC_017418	ATTTAA	2	12	31788	31799	50 %	50 %	0 %	0 %	387826960
19	NC_017418	TCAATT	2	12	31865	31876	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387826960
20	NC_017418	TATCAA	2	12	32448	32459	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387826960
21	NC_017418	AGAAGC	2	12	33358	33369	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387826960
22	NC_017418	TAAATT	2	12	37468	37479	50 %	50 %	0 %	0 %	387826963
23	NC_017418	ATTTTT	2	12	38317	38328	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387826964
24	NC_017418	TAAATT	2	12	38581	38592	50 %	50 %	0 %	0 %	387826964
25	NC_017418	GAAAGA	2	12	38639	38650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826964
26	NC_017418	AATATA	2	12	39485	39496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826965
27	NC_017418	AAAATC	2	12	40708	40719	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387826966
28	NC_017418	TAAATT	2	12	43403	43414	50 %	50 %	0 %	0 %	387826969
29	NC_017418	AAATAA	2	12	48006	48017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826974
30	NC_017418	TAAAAA	2	12	49277	49288	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826976
31	NC_017418	TAAAAA	2	12	50076	50087	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826977
32	NC_017418	TCAAAT	2	12	51087	51098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387826979
33	NC_017418	TTTAAA	2	12	54094	54105	50 %	50 %	0 %	0 %	387826981
34	NC_017418	TTAAAA	2	12	56972	56983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826985
35	NC_017418	AAATTT	2	12	56993	57004	50 %	50 %	0 %	0 %	387826985
36	NC_017418	AAAAAT	2	12	57313	57324	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826985
37	NC_017418	AGAAAA	2	12	57475	57486	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387826985
38	NC_017418	ATTCAA	2	12	67418	67429	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387826994
39	NC_017418	AAAAAT	2	12	67505	67516	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826994
40	NC_017418	ACTATC	2	12	68162	68173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826994
41	NC_017418	ATTCAA	2	12	68512	68523	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387826994
42	NC_017418	ATAAAA	2	12	69266	69277	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826995
43	NC_017418	TAATTT	2	12	69408	69419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826995
44	NC_017418	ACCAAA	2	12	71159	71170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826997
45	NC_017418	AATTGA	2	12	71815	71826	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826997
46	NC_017418	TAGAAA	2	12	71913	71924	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826997
47	NC_017418	AATAGA	2	12	72949	72960	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826998
48	NC_017418	GAAAAC	2	12	73474	73485	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387826999
49	NC_017418	CAATGA	2	12	74037	74048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387826999
50	NC_017418	ATTTCC	2	12	75133	75144	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387827000
51	NC_017418	TTGCTA	2	12	75861	75872	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387827001
52	NC_017418	ATTCCA	2	12	76745	76756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827002
53	NC_017418	TGGAAT	2	12	77055	77066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827002
54	NC_017418	AAAAGA	2	12	77304	77315	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387827002
55	NC_017418	CCATAG	2	12	78042	78053	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387827003
56	NC_017418	TAAATC	2	12	78244	78255	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387827003
57	NC_017418	TTCTAT	2	12	78561	78572	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387827003
58	NC_017418	AGGAAT	2	12	79843	79854	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387827005
59	NC_017418	TTTTAT	2	12	80315	80326	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387827005
60	NC_017418	TACAAA	2	12	80930	80941	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387827006
61	NC_017418	ATTTTC	2	12	81183	81194	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387827007
62	NC_017418	AGATAA	2	12	87599	87610	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387827012
63	NC_017418	CAATTT	2	12	88307	88318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387827012
64	NC_017418	CAGAAA	2	12	90288	90299	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387827014
65	NC_017418	ACATCA	2	12	91709	91720	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387827015
66	NC_017418	TCTTTT	2	12	94982	94993	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387827019
67	NC_017418	CAAAAT	2	12	97581	97592	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387827021
68	NC_017418	AACATA	2	12	98161	98172	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387827021
69	NC_017418	TTAAAC	2	12	99651	99662	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387827022
70	NC_017418	TGGACT	2	12	99725	99736	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387827022
71	NC_017418	AAATTC	2	12	103390	103401	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387827026
72	NC_017418	AAAATC	2	12	111342	111353	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387827034
73	NC_017418	CAATAT	2	12	111543	111554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387827035
74	NC_017418	AAATAG	2	12	114145	114156	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387827037
75	NC_017418	CATTAA	2	12	116820	116831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387827040
76	NC_017418	AATTTT	2	12	117115	117126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827040
77	NC_017418	AAGATC	2	12	117463	117474	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387827041
78	NC_017418	AAATCA	2	12	117530	117541	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387827041
79	NC_017418	AATTTC	2	12	119469	119480	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387827044
80	NC_017418	ACACAA	2	12	122056	122067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827047
81	NC_017418	TTTCTC	2	12	122501	122512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827048
82	NC_017418	AATTCT	2	12	124528	124539	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387827050
83	NC_017418	CATCAA	2	12	124902	124913	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387827050
84	NC_017418	ATCCGA	2	12	127832	127843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387827053
85	NC_017418	TGATAT	2	12	131927	131938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387827055
86	NC_017418	ATTTTT	2	12	132289	132300	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387827056
87	NC_017418	TTAAAA	2	12	134996	135007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827057
88	NC_017418	AAAATA	2	12	135385	135396	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387827057
89	NC_017418	AAACTA	2	12	136757	136768	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387827058
90	NC_017418	ATTTTA	2	12	139535	139546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827060
91	NC_017418	AACTAA	2	12	142489	142500	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387827061
92	NC_017418	AAAAGA	2	12	143784	143795	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387827062
93	NC_017418	TTAATA	2	12	144097	144108	50 %	50 %	0 %	0 %	387827063
94	NC_017418	ACCCTT	2	12	144694	144705	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387827064
95	NC_017418	AAAAAT	2	12	145061	145072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387827064
96	NC_017418	AAATCA	2	12	146246	146257	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387827066
97	NC_017418	TTTCAT	2	12	146937	146948	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387827066
98	NC_017418	CATTGC	2	12	147325	147336	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387827067
99	NC_017418	CAAGAA	2	12	152282	152293	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387827069
100	NC_017418	TTGGAA	2	12	152381	152392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827069
101	NC_017418	AATTCA	2	12	153182	153193	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387827070
102	NC_017418	TTTGCT	2	12	153774	153785	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387827071
103	NC_017418	TTAAAT	2	12	154695	154706	50 %	50 %	0 %	0 %	387827071
104	NC_017418	AACTAC	2	12	154766	154777	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387827071
105	NC_017418	TAAAAA	2	12	156368	156379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387827072
106	NC_017418	AATACT	2	12	156501	156512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387827072
107	NC_017418	AATTAA	2	12	156846	156857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827072
108	NC_017418	ATTATA	2	12	157206	157217	50 %	50 %	0 %	0 %	387827072
109	NC_017418	CGAAAA	2	12	159065	159076	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387827076
110	NC_017418	CTAGAA	2	12	160181	160192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387827077
111	NC_017418	ATTTTT	2	12	160596	160607	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387827077
112	NC_017418	TCATAT	2	12	161064	161075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387827078
113	NC_017418	ATCTTT	2	12	161585	161596	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387827078
114	NC_017418	AAATAT	2	12	164655	164666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827081
115	NC_017418	ATAAAA	2	12	165060	165071	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387827081
116	NC_017418	AATCAA	2	12	167858	167869	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387827083
117	NC_017418	CTTTTT	2	12	168967	168978	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387827083
118	NC_017418	AAAGAC	2	12	170207	170218	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387827084
119	NC_017418	TTTTAT	2	12	171974	171985	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387827087
120	NC_017418	AACTTC	2	12	172806	172817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827087
121	NC_017418	ATTGGA	2	12	172956	172967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827087
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