MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp36

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017414	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826907
2	NC_017414	TAA	2	6	312	317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826907
3	NC_017414	ATT	2	6	381	386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826907
4	NC_017414	CAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826907
5	NC_017414	TAT	2	6	542	547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826907
6	NC_017414	ATT	2	6	601	606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826907
7	NC_017414	TAC	3	9	640	648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826907
8	NC_017414	ATT	2	6	890	895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826908
9	NC_017414	TAA	2	6	928	933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826908
10	NC_017414	TTA	2	6	993	998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826908
11	NC_017414	TGT	2	6	1044	1049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826908
12	NC_017414	AAT	2	6	3925	3930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826909
13	NC_017414	CTG	2	6	4461	4466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826910
14	NC_017414	TAA	2	6	4837	4842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826911
15	NC_017414	TGA	2	6	4874	4879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826911
16	NC_017414	GAT	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826911
17	NC_017414	CTC	2	6	5098	5103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826911
18	NC_017414	TCA	2	6	5127	5132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826911
19	NC_017414	GAA	2	6	5207	5212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826911
20	NC_017414	CTT	2	6	5347	5352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826911
21	NC_017414	ATG	2	6	5461	5466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826911
22	NC_017414	AGC	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826911
23	NC_017414	CAA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826911
24	NC_017414	ATA	2	6	5643	5648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826912
25	NC_017414	GAA	2	6	5720	5725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826912
26	NC_017414	CTG	2	6	5933	5938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826912
27	NC_017414	ATT	2	6	6108	6113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826912
28	NC_017414	TTA	2	6	6118	6123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826912
29	NC_017414	AGA	2	6	6171	6176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826912
30	NC_017414	TGA	2	6	6270	6275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826912
31	NC_017414	TAA	2	6	7813	7818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826913
32	NC_017414	TGC	2	6	7902	7907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826913
33	NC_017414	TAG	2	6	7974	7979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826913
34	NC_017414	CTT	2	6	8106	8111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826913
35	NC_017414	TGA	2	6	8181	8186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826913
36	NC_017414	GAT	2	6	8192	8197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826913
37	NC_017414	TAA	2	6	8287	8292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826913
38	NC_017414	GTT	2	6	8294	8299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826913
39	NC_017414	AGA	2	6	8386	8391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826913
40	NC_017414	TGA	2	6	8524	8529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826913
41	NC_017414	GTT	2	6	8665	8670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826913
42	NC_017414	CTG	2	6	8685	8690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826913
43	NC_017414	ATG	2	6	8763	8768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826913
44	NC_017414	TAA	2	6	8787	8792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826913
45	NC_017414	GAT	2	6	8866	8871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826913
46	NC_017414	ATT	2	6	8900	8905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826913
47	NC_017414	TAA	2	6	8988	8993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826913
48	NC_017414	CAT	2	6	9094	9099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826913
49	NC_017414	TTG	2	6	9102	9107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826913
50	NC_017414	ATG	2	6	9114	9119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826913
51	NC_017414	ATC	2	6	9146	9151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826913
52	NC_017414	TAA	2	6	9195	9200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826913
53	NC_017414	TGA	2	6	9307	9312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826913
54	NC_017414	GGT	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826913
55	NC_017414	ATT	2	6	9411	9416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826913
56	NC_017414	TAT	2	6	9975	9980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826914
57	NC_017414	TAA	2	6	10182	10187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826914
58	NC_017414	AGA	2	6	10216	10221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826914
59	NC_017414	CTT	2	6	10243	10248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826914
60	NC_017414	AAT	3	9	10285	10293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826914
61	NC_017414	TTA	2	6	10333	10338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826914
62	NC_017414	ATA	2	6	10349	10354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826914
63	NC_017414	ATT	2	6	10416	10421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826914
64	NC_017414	GCG	2	6	10440	10445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387826914
65	NC_017414	GAT	2	6	10463	10468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826914
66	NC_017414	TAA	2	6	10977	10982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826915
67	NC_017414	AAG	2	6	10993	10998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826915
68	NC_017414	CTT	2	6	11086	11091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826915
69	NC_017414	TAA	2	6	11119	11124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826915
70	NC_017414	ATT	2	6	11177	11182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826915
71	NC_017414	CTA	2	6	11289	11294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826915
72	NC_017414	TAT	2	6	11306	11311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826915
73	NC_017414	AAT	2	6	11363	11368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826915
74	NC_017414	ATC	2	6	11384	11389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826915
75	NC_017414	TTA	2	6	11526	11531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826915
76	NC_017414	AAG	2	6	11536	11541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826915
77	NC_017414	CTC	2	6	11638	11643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826915
78	NC_017414	GGT	2	6	11788	11793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826916
79	NC_017414	TAT	2	6	11901	11906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826916
80	NC_017414	GAA	2	6	11998	12003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826916
81	NC_017414	TTA	2	6	12020	12025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826916
82	NC_017414	CTA	2	6	12116	12121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826916
83	NC_017414	TTC	2	6	12127	12132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826916
84	NC_017414	ATT	2	6	12239	12244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826917
85	NC_017414	TAG	2	6	12298	12303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826917
86	NC_017414	AAT	2	6	12451	12456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826917
87	NC_017414	TAA	2	6	12476	12481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826917
88	NC_017414	TGT	2	6	12585	12590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826917
89	NC_017414	TTA	2	6	12591	12596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826917
90	NC_017414	TGA	3	9	12924	12932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826917
91	NC_017414	ATA	2	6	13020	13025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826917
92	NC_017414	ATT	2	6	13032	13037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826917
93	NC_017414	TTA	2	6	13068	13073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826917
94	NC_017414	ATA	2	6	13728	13733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826918
95	NC_017414	TAA	2	6	13749	13754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826918
96	NC_017414	GAT	2	6	13796	13801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826918
97	NC_017414	ATG	2	6	13866	13871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826918
98	NC_017414	AAG	2	6	14052	14057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826918
99	NC_017414	TAA	2	6	14100	14105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826918
100	NC_017414	TTA	2	6	14760	14765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826919
101	NC_017414	TGT	2	6	14770	14775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826919
102	NC_017414	AGA	2	6	14851	14856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826919
103	NC_017414	TTC	2	6	15375	15380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826920
104	NC_017414	GAT	2	6	15385	15390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826920
105	NC_017414	GAA	2	6	15436	15441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826920
106	NC_017414	ATT	2	6	15446	15451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826920
107	NC_017414	AAC	2	6	15458	15463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826920
108	NC_017414	TAC	2	6	15506	15511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826920
109	NC_017414	TAA	2	6	15543	15548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826920
110	NC_017414	AGA	2	6	15555	15560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826920
111	NC_017414	AGA	2	6	15666	15671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826920
112	NC_017414	AAT	2	6	16340	16345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826921
113	NC_017414	GAA	2	6	16373	16378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826921
114	NC_017414	CTT	2	6	16396	16401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826921
115	NC_017414	GAA	2	6	16403	16408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826921
116	NC_017414	TAT	2	6	16528	16533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826921
117	NC_017414	TAA	2	6	18009	18014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826922
118	NC_017414	GAA	2	6	18049	18054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826922
119	NC_017414	ATT	2	6	18069	18074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826922
120	NC_017414	ACA	2	6	18114	18119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826922
121	NC_017414	GTG	2	6	18173	18178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826922
122	NC_017414	GGA	2	6	18183	18188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826922
123	NC_017414	TGA	2	6	18288	18293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826922
124	NC_017414	TAT	2	6	18319	18324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826922
125	NC_017414	GAT	2	6	18343	18348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826922
126	NC_017414	ATT	2	6	18465	18470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826922
127	NC_017414	CAA	2	6	18473	18478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826922
128	NC_017414	AGA	2	6	18534	18539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826922
129	NC_017414	AGA	2	6	18558	18563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826922
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.