MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017412	TATCTA	2	12	588	599	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387826749
2	NC_017412	TAAAAA	2	12	622	633	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826749
3	NC_017412	TTATAC	2	12	1394	1405	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387826751
4	NC_017412	TTTTCT	2	12	1556	1567	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826751
5	NC_017412	TAATAT	2	12	4739	4750	50 %	50 %	0 %	0 %	387826752
6	NC_017412	ATTAAT	2	12	4766	4777	50 %	50 %	0 %	0 %	387826752
7	NC_017412	ATTTTA	2	12	5516	5527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826753
8	NC_017412	TTGAGC	2	12	10195	10206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387826757
9	NC_017412	TGATCT	2	12	12024	12035	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387826759
10	NC_017412	ATTTTC	2	12	14989	15000	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826764
11	NC_017412	GTTGCA	2	12	15059	15070	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387826764
12	NC_017412	CTCAGC	2	12	15619	15630	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387826765
13	NC_017412	TCTTTA	2	12	19838	19849	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826770
14	NC_017412	CATTAA	2	12	20352	20363	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387826771
15	NC_017412	TTTCTA	2	12	20772	20783	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826771
16	NC_017412	CTCGTA	2	12	21052	21063	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387826771
17	NC_017412	TTTCAT	2	12	22741	22752	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826772
18	NC_017412	AAGGAA	2	12	25243	25254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826776
19	NC_017412	AGAGAA	2	12	26058	26069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826776
20	NC_017412	GCAAAC	2	12	26123	26134	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387826776
21	NC_017412	TGAAAA	2	12	27505	27516	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826779

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.