MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp17

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017410	TCA	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826737
2	NC_017410	ATA	2	6	6459	6464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826737
3	NC_017410	TTA	2	6	6487	6492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826737
4	NC_017410	GAT	2	6	6503	6508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826737
5	NC_017410	GAA	2	6	6545	6550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826737
6	NC_017410	TTA	2	6	6612	6617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826737
7	NC_017410	CCA	2	6	6777	6782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826738
8	NC_017410	ATC	2	6	6806	6811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826738
9	NC_017410	TTA	2	6	6834	6839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826738
10	NC_017410	CAT	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826738
11	NC_017410	TGC	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826738
12	NC_017410	TAT	2	6	6889	6894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826738
13	NC_017410	CAA	2	6	6907	6912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826738
14	NC_017410	ATA	2	6	6936	6941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826738
15	NC_017410	TGT	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826738
16	NC_017410	TAA	2	6	7026	7031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826738
17	NC_017410	ACA	2	6	7032	7037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826738
18	NC_017410	TTA	2	6	7090	7095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826738
19	NC_017410	AAT	2	6	7219	7224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826738
20	NC_017410	ATT	2	6	7596	7601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826739
21	NC_017410	ATT	2	6	7734	7739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826739
22	NC_017410	GAA	2	6	7827	7832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826739
23	NC_017410	ATG	2	6	7854	7859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826739
24	NC_017410	TAT	2	6	7979	7984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826739
25	NC_017410	AAC	2	6	8022	8027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826739
26	NC_017410	AAC	2	6	8165	8170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826739
27	NC_017410	GAA	2	6	8208	8213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826739
28	NC_017410	CAA	2	6	8249	8254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826739
29	NC_017410	TCT	2	6	8329	8334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826739
30	NC_017410	TTA	2	6	8445	8450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826739
31	NC_017410	ATT	2	6	8519	8524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826739
32	NC_017410	AGA	2	6	8737	8742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826740
33	NC_017410	AGA	2	6	8836	8841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826740
34	NC_017410	AGA	2	6	8870	8875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826740
35	NC_017410	ATA	2	6	9166	9171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826741
36	NC_017410	TAA	2	6	9201	9206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826741
37	NC_017410	AGA	2	6	9219	9224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826741
38	NC_017410	TAA	2	6	9426	9431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826741
39	NC_017410	ATA	2	6	9446	9451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826741
40	NC_017410	ATT	2	6	9486	9491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826741
41	NC_017410	TAA	2	6	9509	9514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826741
42	NC_017410	ATT	2	6	9601	9606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826741
43	NC_017410	TAA	2	6	9618	9623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826741
44	NC_017410	CAA	2	6	9681	9686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826741
45	NC_017410	CAA	2	6	9918	9923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826741
46	NC_017410	AGA	2	6	9981	9986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826741
47	NC_017410	GAT	2	6	10056	10061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826741
48	NC_017410	ATT	2	6	10186	10191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826741
49	NC_017410	GAA	2	6	10551	10556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826742
50	NC_017410	TAT	3	9	10570	10578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826742
51	NC_017410	TAA	2	6	10730	10735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826742
52	NC_017410	ATA	2	6	10753	10758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826742
53	NC_017410	ATT	2	6	10806	10811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826742
54	NC_017410	ATT	2	6	10875	10880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826742
55	NC_017410	TAG	2	6	11696	11701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826743
56	NC_017410	TGT	2	6	11704	11709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826743
57	NC_017410	TTG	2	6	11728	11733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826743
58	NC_017410	TTA	2	6	11761	11766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826743
59	NC_017410	ATT	2	6	11815	11820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826743
60	NC_017410	TCT	2	6	11836	11841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826743
61	NC_017410	ATA	2	6	11895	11900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826743
62	NC_017410	TCG	2	6	11929	11934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826743
63	NC_017410	ATT	2	6	11956	11961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826743
64	NC_017410	TAA	2	6	12002	12007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826743
65	NC_017410	GGT	2	6	14026	14031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826744
66	NC_017410	TTC	2	6	14124	14129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826744
67	NC_017410	GAA	2	6	14184	14189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826744
68	NC_017410	AGT	2	6	14205	14210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826744
69	NC_017410	AGA	2	6	14266	14271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826744
70	NC_017410	GAT	2	6	14311	14316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826744
71	NC_017410	GAA	2	6	14393	14398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826744
72	NC_017410	TTA	2	6	14420	14425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826744
73	NC_017410	AGA	2	6	14475	14480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826744
74	NC_017410	ATT	2	6	14530	14535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826744
75	NC_017410	TAA	2	6	14547	14552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826744
76	NC_017410	ATT	2	6	14672	14677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826744
77	NC_017410	AGA	2	6	14753	14758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826745
78	NC_017410	ATT	2	6	14760	14765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826745
79	NC_017410	ATG	2	6	14806	14811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826745
80	NC_017410	TTA	2	6	14812	14817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826745
81	NC_017410	AAT	2	6	14995	15000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826745
82	NC_017410	TAA	2	6	16417	16422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826746
83	NC_017410	TAG	2	6	16491	16496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826746
84	NC_017410	TTG	2	6	16502	16507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826746
85	NC_017410	TAA	2	6	16584	16589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826747
86	NC_017410	TTA	3	9	16601	16609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826747
87	NC_017410	TAA	3	9	16648	16656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826747
88	NC_017410	ATT	2	6	16760	16765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826747

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.