MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp25

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017409	TTAT	2	8	81	88	25 %	75 %	0 %	0 %	387826518
2	NC_017409	CTTT	2	8	105	112	0 %	75 %	0 %	25 %	387826518
3	NC_017409	TCCT	2	8	974	981	0 %	50 %	0 %	50 %	387826518
4	NC_017409	TTAA	2	8	1170	1177	50 %	50 %	0 %	0 %	387826518
5	NC_017409	TAAA	2	8	1336	1343	75 %	25 %	0 %	0 %	387826518
6	NC_017409	CTTT	2	8	1602	1609	0 %	75 %	0 %	25 %	387826518
7	NC_017409	TAAA	3	12	2640	2651	75 %	25 %	0 %	0 %	387826518
8	NC_017409	TAAG	2	8	2890	2897	50 %	25 %	25 %	0 %	387826518
9	NC_017409	AGAA	2	8	5552	5559	75 %	0 %	25 %	0 %	387826519
10	NC_017409	CCAA	2	8	5825	5832	50 %	0 %	0 %	50 %	387826519
11	NC_017409	ATTG	2	8	8849	8856	25 %	50 %	25 %	0 %	387826522
12	NC_017409	TTAT	2	8	8913	8920	25 %	75 %	0 %	0 %	387826522
13	NC_017409	CTTT	2	8	10117	10124	0 %	75 %	0 %	25 %	387826523
14	NC_017409	AATT	2	8	10160	10167	50 %	50 %	0 %	0 %	387826523
15	NC_017409	TTTA	2	8	10333	10340	25 %	75 %	0 %	0 %	387826524
16	NC_017409	ATTT	2	8	11018	11025	25 %	75 %	0 %	0 %	387826524
17	NC_017409	TTGA	2	8	11355	11362	25 %	50 %	25 %	0 %	387826525
18	NC_017409	TGTT	2	8	11683	11690	0 %	75 %	25 %	0 %	387826526
19	NC_017409	TATT	2	8	11857	11864	25 %	75 %	0 %	0 %	387826526
20	NC_017409	TCTT	2	8	12210	12217	0 %	75 %	0 %	25 %	387826526
21	NC_017409	ATTT	2	8	12276	12283	25 %	75 %	0 %	0 %	387826526
22	NC_017409	ATTG	2	8	13435	13442	25 %	50 %	25 %	0 %	387826527
23	NC_017409	GTTT	2	8	13472	13479	0 %	75 %	25 %	0 %	387826527
24	NC_017409	GTTG	2	8	13713	13720	0 %	50 %	50 %	0 %	387826527
25	NC_017409	CAGT	2	8	18197	18204	25 %	25 %	25 %	25 %	387826528
26	NC_017409	TTGA	2	8	18302	18309	25 %	50 %	25 %	0 %	387826528
27	NC_017409	TGTT	3	12	18560	18571	0 %	75 %	25 %	0 %	387826528
28	NC_017409	AAAT	2	8	18659	18666	75 %	25 %	0 %	0 %	387826528
29	NC_017409	TAGA	2	8	20178	20185	50 %	25 %	25 %	0 %	387826529
30	NC_017409	CTAT	2	8	21349	21356	25 %	50 %	0 %	25 %	387826531
31	NC_017409	ATCT	2	8	21769	21776	25 %	50 %	0 %	25 %	387826531
32	NC_017409	GATA	2	8	21778	21785	50 %	25 %	25 %	0 %	387826531
33	NC_017409	ATTT	2	8	21871	21878	25 %	75 %	0 %	0 %	387826531
34	NC_017409	ATTT	2	8	22223	22230	25 %	75 %	0 %	0 %	387826531

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.