MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017408	TC	3	6	292	297	0 %	50 %	0 %	50 %	387826487
2	NC_017408	AT	3	6	1602	1607	50 %	50 %	0 %	0 %	387826488
3	NC_017408	AT	3	6	3461	3466	50 %	50 %	0 %	0 %	387826490
4	NC_017408	AC	3	6	3484	3489	50 %	0 %	0 %	50 %	387826490
5	NC_017408	TA	3	6	3763	3768	50 %	50 %	0 %	0 %	387826491
6	NC_017408	TA	4	8	4626	4633	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
7	NC_017408	TA	3	6	4636	4641	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
8	NC_017408	TA	3	6	4805	4810	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
9	NC_017408	TA	4	8	4941	4948	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
10	NC_017408	AT	3	6	5674	5679	50 %	50 %	0 %	0 %	387826493
11	NC_017408	AG	3	6	6559	6564	50 %	0 %	50 %	0 %	387826493
12	NC_017408	TA	3	6	7880	7885	50 %	50 %	0 %	0 %	387826493
13	NC_017408	TC	3	6	8067	8072	0 %	50 %	0 %	50 %	387826493
14	NC_017408	TA	3	6	9712	9717	50 %	50 %	0 %	0 %	387826495
15	NC_017408	GA	3	6	11133	11138	50 %	0 %	50 %	0 %	387826498
16	NC_017408	AT	3	6	12210	12215	50 %	50 %	0 %	0 %	387826499
17	NC_017408	TG	3	6	14124	14129	0 %	50 %	50 %	0 %	387826502
18	NC_017408	CA	4	8	14900	14907	50 %	0 %	0 %	50 %	387826503
19	NC_017408	AC	3	6	15075	15080	50 %	0 %	0 %	50 %	387826503
20	NC_017408	TA	3	6	15113	15118	50 %	50 %	0 %	0 %	387826503
21	NC_017408	TC	3	6	15172	15177	0 %	50 %	0 %	50 %	387826503
22	NC_017408	TA	3	6	15374	15379	50 %	50 %	0 %	0 %	387826503
23	NC_017408	AT	3	6	15974	15979	50 %	50 %	0 %	0 %	387826505
24	NC_017408	AG	3	6	16636	16641	50 %	0 %	50 %	0 %	387826505
25	NC_017408	GT	3	6	17639	17644	0 %	50 %	50 %	0 %	387826507
26	NC_017408	TG	3	6	17785	17790	0 %	50 %	50 %	0 %	387826507
27	NC_017408	AT	3	6	18242	18247	50 %	50 %	0 %	0 %	387826507
28	NC_017408	GT	3	6	18760	18765	0 %	50 %	50 %	0 %	387826507
29	NC_017408	AT	3	6	18940	18945	50 %	50 %	0 %	0 %	387826507
30	NC_017408	TC	3	6	19333	19338	0 %	50 %	0 %	50 %	387826507
31	NC_017408	TG	3	6	22606	22611	0 %	50 %	50 %	0 %	387826512
32	NC_017408	AG	4	8	23639	23646	50 %	0 %	50 %	0 %	387826512
33	NC_017408	AG	3	6	23667	23672	50 %	0 %	50 %	0 %	387826512
34	NC_017408	AG	3	6	23685	23690	50 %	0 %	50 %	0 %	387826512
35	NC_017408	AG	3	6	23696	23701	50 %	0 %	50 %	0 %	387826512
36	NC_017408	GA	3	6	23790	23795	50 %	0 %	50 %	0 %	387826512
37	NC_017408	AT	3	6	23823	23828	50 %	50 %	0 %	0 %	387826512
38	NC_017408	AT	3	6	24185	24190	50 %	50 %	0 %	0 %	387826513
39	NC_017408	AT	3	6	24256	24261	50 %	50 %	0 %	0 %	387826513
40	NC_017408	GT	3	6	24767	24772	0 %	50 %	50 %	0 %	387826514
41	NC_017408	AT	3	6	25128	25133	50 %	50 %	0 %	0 %	387826515
42	NC_017408	AG	3	6	25134	25139	50 %	0 %	50 %	0 %	387826515
43	NC_017408	AT	3	6	25306	25311	50 %	50 %	0 %	0 %	387826515
44	NC_017408	AT	3	6	25753	25758	50 %	50 %	0 %	0 %	387826515
45	NC_017408	AT	3	6	26290	26295	50 %	50 %	0 %	0 %	387826516

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.