MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017408	ATTT	2	8	1141	1148	25 %	75 %	0 %	0 %	387826487
2	NC_017408	AACA	2	8	1190	1197	75 %	0 %	0 %	25 %	387826487
3	NC_017408	AATA	2	8	1205	1212	75 %	25 %	0 %	0 %	387826487
4	NC_017408	AGCC	2	8	1408	1415	25 %	0 %	25 %	50 %	387826488
5	NC_017408	GTTT	2	8	2466	2473	0 %	75 %	25 %	0 %	387826489
6	NC_017408	ATTT	2	8	2865	2872	25 %	75 %	0 %	0 %	387826489
7	NC_017408	AAGC	2	8	3111	3118	50 %	0 %	25 %	25 %	387826490
8	NC_017408	TATT	2	8	3209	3216	25 %	75 %	0 %	0 %	387826490
9	NC_017408	CTTT	2	8	3942	3949	0 %	75 %	0 %	25 %	387826491
10	NC_017408	AAAG	2	8	4597	4604	75 %	0 %	25 %	0 %	387826492
11	NC_017408	TCTT	2	8	4700	4707	0 %	75 %	0 %	25 %	387826492
12	NC_017408	TCTT	2	8	4721	4728	0 %	75 %	0 %	25 %	387826492
13	NC_017408	TTAA	2	8	4736	4743	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
14	NC_017408	ATCA	2	8	4771	4778	50 %	25 %	0 %	25 %	387826492
15	NC_017408	TTAA	2	8	4880	4887	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
16	NC_017408	TTTA	2	8	5062	5069	25 %	75 %	0 %	0 %	387826492
17	NC_017408	ATTT	2	8	5121	5128	25 %	75 %	0 %	0 %	387826492
18	NC_017408	CTAA	2	8	5464	5471	50 %	25 %	0 %	25 %	387826493
19	NC_017408	TTCG	2	8	5873	5880	0 %	50 %	25 %	25 %	387826493
20	NC_017408	GTTT	2	8	5897	5904	0 %	75 %	25 %	0 %	387826493
21	NC_017408	CAAA	2	8	6250	6257	75 %	0 %	0 %	25 %	387826493
22	NC_017408	CTTT	2	8	6670	6677	0 %	75 %	0 %	25 %	387826493
23	NC_017408	GATC	2	8	6751	6758	25 %	25 %	25 %	25 %	387826493
24	NC_017408	CTTT	2	8	6958	6965	0 %	75 %	0 %	25 %	387826493
25	NC_017408	TTTA	2	8	7836	7843	25 %	75 %	0 %	0 %	387826493
26	NC_017408	TCGC	2	8	7867	7874	0 %	25 %	25 %	50 %	387826493
27	NC_017408	TTTG	2	8	8370	8377	0 %	75 %	25 %	0 %	387826493
28	NC_017408	AATT	2	8	9027	9034	50 %	50 %	0 %	0 %	387826494
29	NC_017408	ATTA	2	8	9400	9407	50 %	50 %	0 %	0 %	387826494
30	NC_017408	AATC	2	8	10017	10024	50 %	25 %	0 %	25 %	387826495
31	NC_017408	AAGT	2	8	10617	10624	50 %	25 %	25 %	0 %	387826496
32	NC_017408	AATT	2	8	10899	10906	50 %	50 %	0 %	0 %	387826497
33	NC_017408	AAAG	2	8	11088	11095	75 %	0 %	25 %	0 %	387826498
34	NC_017408	TAAA	2	8	11197	11204	75 %	25 %	0 %	0 %	387826498
35	NC_017408	TTTG	2	8	11306	11313	0 %	75 %	25 %	0 %	387826498
36	NC_017408	AACA	2	8	11569	11576	75 %	0 %	0 %	25 %	387826499
37	NC_017408	GCTT	2	8	12232	12239	0 %	50 %	25 %	25 %	387826499
38	NC_017408	ATCT	2	8	12827	12834	25 %	50 %	0 %	25 %	387826501
39	NC_017408	ATTT	2	8	13335	13342	25 %	75 %	0 %	0 %	387826501
40	NC_017408	TTTC	2	8	13440	13447	0 %	75 %	0 %	25 %	387826502
41	NC_017408	CTTA	2	8	13450	13457	25 %	50 %	0 %	25 %	387826502
42	NC_017408	TGAA	2	8	13708	13715	50 %	25 %	25 %	0 %	387826502
43	NC_017408	GTTT	2	8	14567	14574	0 %	75 %	25 %	0 %	387826503
44	NC_017408	GCAA	2	8	14635	14642	50 %	0 %	25 %	25 %	387826503
45	NC_017408	AGAA	2	8	14883	14890	75 %	0 %	25 %	0 %	387826503
46	NC_017408	ATTG	2	8	15409	15416	25 %	50 %	25 %	0 %	387826503
47	NC_017408	TTTC	2	8	15475	15482	0 %	75 %	0 %	25 %	387826503
48	NC_017408	AAAG	2	8	15882	15889	75 %	0 %	25 %	0 %	387826504
49	NC_017408	AATA	2	8	16036	16043	75 %	25 %	0 %	0 %	387826505
50	NC_017408	AATT	2	8	16175	16182	50 %	50 %	0 %	0 %	387826505
51	NC_017408	TTTG	2	8	16386	16393	0 %	75 %	25 %	0 %	387826505
52	NC_017408	TACC	2	8	16755	16762	25 %	25 %	0 %	50 %	387826506
53	NC_017408	TTCC	2	8	17222	17229	0 %	50 %	0 %	50 %	387826506
54	NC_017408	ATTG	2	8	19266	19273	25 %	50 %	25 %	0 %	387826507
55	NC_017408	TGCT	2	8	19934	19941	0 %	50 %	25 %	25 %	387826507
56	NC_017408	AATT	2	8	20186	20193	50 %	50 %	0 %	0 %	387826507
57	NC_017408	TTAC	2	8	21358	21365	25 %	50 %	0 %	25 %	387826510
58	NC_017408	AATC	2	8	21383	21390	50 %	25 %	0 %	25 %	387826510
59	NC_017408	TTCT	2	8	21744	21751	0 %	75 %	0 %	25 %	387826511
60	NC_017408	TTTC	2	8	21909	21916	0 %	75 %	0 %	25 %	387826511
61	NC_017408	CTTT	2	8	22074	22081	0 %	75 %	0 %	25 %	387826511
62	NC_017408	CAAA	2	8	22957	22964	75 %	0 %	0 %	25 %	387826512
63	NC_017408	AGAT	2	8	23561	23568	50 %	25 %	25 %	0 %	387826512
64	NC_017408	TAAA	2	8	23581	23588	75 %	25 %	0 %	0 %	387826512
65	NC_017408	TATG	2	8	24774	24781	25 %	50 %	25 %	0 %	387826514
66	NC_017408	ACAA	2	8	25101	25108	75 %	0 %	0 %	25 %	387826515
67	NC_017408	ATTA	2	8	26003	26010	50 %	50 %	0 %	0 %	387826515
68	NC_017408	TTGA	2	8	26259	26266	25 %	50 %	25 %	0 %	387826516
69	NC_017408	GAAT	2	8	26407	26414	50 %	25 %	25 %	0 %	387826516
70	NC_017408	TAAT	2	8	26467	26474	50 %	50 %	0 %	0 %	387826516
71	NC_017408	ATAG	2	8	26488	26495	50 %	25 %	25 %	0 %	387826516
72	NC_017408	GAAT	2	8	26732	26739	50 %	25 %	25 %	0 %	387826516
73	NC_017408	GATT	2	8	26747	26754	25 %	50 %	25 %	0 %	387826516

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.