MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 chromosome

Total Repeats: 12205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017403	CTT	2	6	836	841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825663
2	NC_017403	TCA	2	6	870	875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825663
3	NC_017403	ATA	2	6	977	982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825663
4	NC_017403	AGC	2	6	988	993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825663
5	NC_017403	ATT	2	6	1018	1023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825663
6	NC_017403	GTT	2	6	1082	1087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825663
7	NC_017403	ATT	2	6	1129	1134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825663
8	NC_017403	TCC	2	6	1189	1194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825663
9	NC_017403	TAA	2	6	1207	1212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825663
10	NC_017403	TCA	2	6	1415	1420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825663
11	NC_017403	ATC	2	6	1552	1557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825663
12	NC_017403	ACA	2	6	1884	1889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825664
13	NC_017403	TAA	2	6	1931	1936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825664
14	NC_017403	TCT	2	6	1956	1961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825664
15	NC_017403	TAT	2	6	2088	2093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825664
16	NC_017403	TCA	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825664
17	NC_017403	CAG	2	6	2151	2156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825664
18	NC_017403	GAA	2	6	2194	2199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825664
19	NC_017403	AGA	2	6	2301	2306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825664
20	NC_017403	TAT	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825664
21	NC_017403	TCT	2	6	2572	2577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825664
22	NC_017403	TTG	2	6	2918	2923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825664
23	NC_017403	ACC	2	6	2928	2933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825664
24	NC_017403	AAG	2	6	2993	2998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825664
25	NC_017403	TAA	2	6	3007	3012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825664
26	NC_017403	CTT	2	6	3017	3022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825664
27	NC_017403	TTG	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825664
28	NC_017403	TGA	2	6	3441	3446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
29	NC_017403	GAT	2	6	3447	3452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
30	NC_017403	TAA	2	6	3551	3556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
31	NC_017403	ATT	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
32	NC_017403	ATT	2	6	3637	3642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
33	NC_017403	TAA	2	6	3665	3670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
34	NC_017403	TGG	2	6	3822	3827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387825665
35	NC_017403	ATA	2	6	3856	3861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
36	NC_017403	TAA	2	6	3896	3901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
37	NC_017403	TGA	2	6	3930	3935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
38	NC_017403	TAA	2	6	3960	3965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
39	NC_017403	AAT	2	6	3966	3971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
40	NC_017403	AAT	2	6	4107	4112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
41	NC_017403	TAT	2	6	4224	4229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
42	NC_017403	ATC	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825665
43	NC_017403	TAT	2	6	4435	4440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
44	NC_017403	ATG	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
45	NC_017403	GAT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
46	NC_017403	TAC	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825665
47	NC_017403	ATT	2	6	4692	4697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825665
48	NC_017403	ACA	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825665
49	NC_017403	ATC	2	6	4812	4817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825665
50	NC_017403	TAA	2	6	4908	4913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
51	NC_017403	AGT	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825665
52	NC_017403	TTC	2	6	4995	5000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825665
53	NC_017403	GGA	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825665
54	NC_017403	TAA	2	6	5028	5033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
55	NC_017403	TTG	2	6	5039	5044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825665
56	NC_017403	CTA	2	6	5134	5139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825665
57	NC_017403	TAA	2	6	5156	5161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
58	NC_017403	TAA	2	6	5178	5183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825665
59	NC_017403	TTC	2	6	5253	5258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
60	NC_017403	TAC	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825666
61	NC_017403	TCA	2	6	5389	5394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825666
62	NC_017403	CTT	2	6	5425	5430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
63	NC_017403	CTT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
64	NC_017403	CTT	2	6	5537	5542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
65	NC_017403	TAA	2	6	5658	5663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825666
66	NC_017403	TCG	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825666
67	NC_017403	ATT	2	6	5691	5696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825666
68	NC_017403	CCA	2	6	5732	5737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825666
69	NC_017403	TAA	2	6	6185	6190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825666
70	NC_017403	CTT	2	6	6206	6211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825666
71	NC_017403	TAC	2	6	6228	6233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825666
72	NC_017403	ACC	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825667
73	NC_017403	TAT	2	6	6577	6582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825667
74	NC_017403	TTA	2	6	6637	6642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825667
75	NC_017403	ATT	2	6	6815	6820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825667
76	NC_017403	TAG	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825667
77	NC_017403	ACA	2	6	6919	6924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825667
78	NC_017403	CTA	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825667
79	NC_017403	AAT	2	6	6959	6964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825667
80	NC_017403	CAT	2	6	7015	7020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825667
81	NC_017403	TAA	2	6	7021	7026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825667
82	NC_017403	TAA	2	6	7125	7130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825667
83	NC_017403	ATA	2	6	7162	7167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825667
84	NC_017403	TAA	2	6	7177	7182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825667
85	NC_017403	ATT	2	6	7622	7627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825668
86	NC_017403	TCT	2	6	7726	7731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825668
87	NC_017403	ATC	2	6	7829	7834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825668
88	NC_017403	CTT	2	6	7985	7990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825668
89	NC_017403	TCA	2	6	8007	8012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825668
90	NC_017403	AAT	2	6	8061	8066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825668
91	NC_017403	TAT	2	6	8071	8076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825668
92	NC_017403	TCA	2	6	8226	8231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825668
93	NC_017403	TGC	2	6	8241	8246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825668
94	NC_017403	TAT	2	6	8266	8271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825668
95	NC_017403	TAC	2	6	8507	8512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825669
96	NC_017403	ATT	2	6	8595	8600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825669
97	NC_017403	TAA	2	6	8694	8699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825669
98	NC_017403	GAA	2	6	8747	8752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825669
99	NC_017403	ATA	2	6	8855	8860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825669
100	NC_017403	CTC	2	6	8928	8933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825669
101	NC_017403	TAA	2	6	8949	8954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825669
102	NC_017403	AAT	2	6	9197	9202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825670
103	NC_017403	TAA	2	6	9220	9225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825670
104	NC_017403	ATA	2	6	9228	9233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825670
105	NC_017403	TGA	2	6	9245	9250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825670
106	NC_017403	AAC	2	6	9329	9334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825670
107	NC_017403	CAA	2	6	9422	9427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825670
108	NC_017403	TAA	2	6	9452	9457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825670
109	NC_017403	AAT	2	6	9458	9463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825670
110	NC_017403	TTA	2	6	9699	9704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825670
111	NC_017403	AGT	2	6	9803	9808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825670
112	NC_017403	CCA	2	6	9810	9815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825670
113	NC_017403	ACA	2	6	9885	9890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825670
114	NC_017403	TAA	2	6	9914	9919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825670
115	NC_017403	TAA	2	6	9958	9963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825670
116	NC_017403	TGC	2	6	10097	10102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825670
117	NC_017403	AAT	2	6	10175	10180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825670
118	NC_017403	ATA	2	6	10223	10228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825671
119	NC_017403	GCA	2	6	10323	10328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825671
120	NC_017403	TAA	2	6	10434	10439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825671
121	NC_017403	TAG	2	6	10563	10568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825671
122	NC_017403	AGA	2	6	10648	10653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825672
123	NC_017403	AGT	2	6	10667	10672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825672
124	NC_017403	GCA	2	6	10790	10795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825672
125	NC_017403	ACA	2	6	10887	10892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825672
126	NC_017403	AAG	2	6	10923	10928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825672
127	NC_017403	AGA	2	6	11050	11055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825672
128	NC_017403	AAG	2	6	11373	11378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825672
129	NC_017403	CAA	2	6	11533	11538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825673
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131	NC_017403	ATA	2	6	11600	11605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825673
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