MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 chromosome

Total Repeats: 23522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_017403	ATC	2	6	18774	18779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825681
503	NC_017403	CAA	2	6	18922	18927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825681
504	NC_017403	TTTC	2	8	18931	18938	0 %	75 %	0 %	25 %	387825681
505	NC_017403	T	6	6	18940	18945	0 %	100 %	0 %	0 %	387825681
506	NC_017403	ACT	2	6	19056	19061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825681
507	NC_017403	TCT	2	6	19132	19137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825681
508	NC_017403	T	6	6	19250	19255	0 %	100 %	0 %	0 %	387825681
509	NC_017403	AGC	2	6	19430	19435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825681
510	NC_017403	ATC	2	6	19448	19453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825681
511	NC_017403	CCA	2	6	19455	19460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825681
512	NC_017403	ATA	3	9	19461	19469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825681
513	NC_017403	CAA	2	6	19495	19500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825681
514	NC_017403	TTC	2	6	19520	19525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825681
515	NC_017403	TTC	2	6	19540	19545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825681
516	NC_017403	AGA	2	6	19547	19552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825681
517	NC_017403	TTA	2	6	19588	19593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825681
518	NC_017403	T	7	7	19679	19685	0 %	100 %	0 %	0 %	387825681
519	NC_017403	TCC	2	6	19733	19738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825681
520	NC_017403	AGAA	2	8	19739	19746	75 %	0 %	25 %	0 %	387825681
521	NC_017403	A	6	6	19832	19837	100 %	0 %	0 %	0 %	387825681
522	NC_017403	GCCT	2	8	19848	19855	0 %	25 %	25 %	50 %	387825681
523	NC_017403	TAAAC	2	10	19884	19893	60 %	20 %	0 %	20 %	387825681
524	NC_017403	ATT	2	6	19898	19903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825681
525	NC_017403	T	7	7	19910	19916	0 %	100 %	0 %	0 %	387825681
526	NC_017403	TTTA	2	8	20104	20111	25 %	75 %	0 %	0 %	387825682
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531	NC_017403	TTC	2	6	20274	20279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825682
532	NC_017403	GAA	2	6	20300	20305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825682
533	NC_017403	AATA	2	8	20432	20439	75 %	25 %	0 %	0 %	387825682
534	NC_017403	ATCT	2	8	20457	20464	25 %	50 %	0 %	25 %	387825682
535	NC_017403	AAT	2	6	20519	20524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825682
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537	NC_017403	AAC	2	6	20553	20558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825682
538	NC_017403	ACT	2	6	20562	20567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825682
539	NC_017403	T	6	6	20569	20574	0 %	100 %	0 %	0 %	387825682
540	NC_017403	AAT	2	6	20622	20627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825682
541	NC_017403	T	6	6	20632	20637	0 %	100 %	0 %	0 %	387825682
542	NC_017403	AT	3	6	20724	20729	50 %	50 %	0 %	0 %	387825682
543	NC_017403	TTA	2	6	20752	20757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825682
544	NC_017403	TA	3	6	20772	20777	50 %	50 %	0 %	0 %	387825682
545	NC_017403	T	6	6	20813	20818	0 %	100 %	0 %	0 %	387825682
546	NC_017403	T	6	6	20858	20863	0 %	100 %	0 %	0 %	387825682
547	NC_017403	CTG	2	6	21054	21059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825683
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552	NC_017403	GAG	2	6	21276	21281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387825683
553	NC_017403	CTT	2	6	21293	21298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825683
554	NC_017403	AAG	2	6	21301	21306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825683
555	NC_017403	AGC	2	6	21310	21315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825683
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557	NC_017403	CAA	2	6	21366	21371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825683
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560	NC_017403	TCT	2	6	21566	21571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825683
561	NC_017403	ATT	2	6	21572	21577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825683
562	NC_017403	TCA	2	6	21596	21601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825683
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564	NC_017403	TCA	2	6	21620	21625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825683
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601	NC_017403	A	7	7	23223	23229	100 %	0 %	0 %	0 %	387825685
602	NC_017403	GAA	2	6	23230	23235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825685
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