MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-9

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017402	AGCA	2	8	1425	1432	50 %	0 %	25 %	25 %	387827868
2	NC_017402	TTGC	2	8	1613	1620	0 %	50 %	25 %	25 %	387827868
3	NC_017402	GTTC	2	8	1678	1685	0 %	50 %	25 %	25 %	387827868
4	NC_017402	TGCT	2	8	2531	2538	0 %	50 %	25 %	25 %	387827869
5	NC_017402	ATGT	2	8	3017	3024	25 %	50 %	25 %	0 %	387827870
6	NC_017402	GTAT	2	8	3042	3049	25 %	50 %	25 %	0 %	387827870
7	NC_017402	ATAA	2	8	3124	3131	75 %	25 %	0 %	0 %	387827870
8	NC_017402	TAAT	2	8	3173	3180	50 %	50 %	0 %	0 %	387827870
9	NC_017402	CAAT	2	8	3206	3213	50 %	25 %	0 %	25 %	387827870
10	NC_017402	AGTA	2	8	4788	4795	50 %	25 %	25 %	0 %	387827871
11	NC_017402	CTAC	2	8	4800	4807	25 %	25 %	0 %	50 %	387827871
12	NC_017402	TCAT	2	8	4847	4854	25 %	50 %	0 %	25 %	387827871
13	NC_017402	TTAC	2	8	5155	5162	25 %	50 %	0 %	25 %	387827872
14	NC_017402	AATG	2	8	5402	5409	50 %	25 %	25 %	0 %	387827872
15	NC_017402	AAGT	2	8	6067	6074	50 %	25 %	25 %	0 %	387827874
16	NC_017402	GTTT	2	8	7858	7865	0 %	75 %	25 %	0 %	387827876
17	NC_017402	CTTG	2	8	8801	8808	0 %	50 %	25 %	25 %	387827877
18	NC_017402	AATT	2	8	8947	8954	50 %	50 %	0 %	0 %	387827877
19	NC_017402	GTAA	2	8	9427	9434	50 %	25 %	25 %	0 %	387827878
20	NC_017402	GGTA	2	8	9828	9835	25 %	25 %	50 %	0 %	387827878
21	NC_017402	TTGA	2	8	10263	10270	25 %	50 %	25 %	0 %	387827878
22	NC_017402	CAAT	2	8	11013	11020	50 %	25 %	0 %	25 %	387827880
23	NC_017402	GGCA	2	8	11215	11222	25 %	0 %	50 %	25 %	387827880
24	NC_017402	ACAA	2	8	11562	11569	75 %	0 %	0 %	25 %	387827880
25	NC_017402	TTTC	2	8	11724	11731	0 %	75 %	0 %	25 %	387827880
26	NC_017402	TCAA	2	8	12122	12129	50 %	25 %	0 %	25 %	387827881
27	NC_017402	AATT	2	8	12395	12402	50 %	50 %	0 %	0 %	387827881
28	NC_017402	GTTT	2	8	12415	12422	0 %	75 %	25 %	0 %	387827881
29	NC_017402	TAAT	2	8	12957	12964	50 %	50 %	0 %	0 %	387827882
30	NC_017402	TATC	2	8	13848	13855	25 %	50 %	0 %	25 %	387827883
31	NC_017402	AAAC	2	8	14040	14047	75 %	0 %	0 %	25 %	387827883
32	NC_017402	ATTT	2	8	14056	14063	25 %	75 %	0 %	0 %	387827883
33	NC_017402	TAAA	2	8	14349	14356	75 %	25 %	0 %	0 %	387827884
34	NC_017402	GAAT	2	8	14584	14591	50 %	25 %	25 %	0 %	387827884
35	NC_017402	TATT	2	8	14974	14981	25 %	75 %	0 %	0 %	387827884
36	NC_017402	TCAA	2	8	15613	15620	50 %	25 %	0 %	25 %	387827886
37	NC_017402	AGGA	2	8	15685	15692	50 %	0 %	50 %	0 %	387827886
38	NC_017402	CTAT	2	8	15697	15704	25 %	50 %	0 %	25 %	387827886
39	NC_017402	AACA	2	8	15713	15720	75 %	0 %	0 %	25 %	387827886
40	NC_017402	TAAC	2	8	15767	15774	50 %	25 %	0 %	25 %	387827887
41	NC_017402	ATAG	2	8	16798	16805	50 %	25 %	25 %	0 %	387827889
42	NC_017402	AGAT	2	8	16817	16824	50 %	25 %	25 %	0 %	387827889
43	NC_017402	ATAG	2	8	16852	16859	50 %	25 %	25 %	0 %	387827889
44	NC_017402	TCTT	2	8	17841	17848	0 %	75 %	0 %	25 %	387827891
45	NC_017402	CTTG	2	8	18245	18252	0 %	50 %	25 %	25 %	387827891
46	NC_017402	AAGA	3	12	19602	19613	75 %	0 %	25 %	0 %	387827892
47	NC_017402	AATA	2	8	19729	19736	75 %	25 %	0 %	0 %	387827892
48	NC_017402	GAAA	2	8	19795	19802	75 %	0 %	25 %	0 %	387827892
49	NC_017402	AAAT	2	8	19881	19888	75 %	25 %	0 %	0 %	387827892
50	NC_017402	GAAA	2	8	19994	20001	75 %	0 %	25 %	0 %	387827892
51	NC_017402	AAAT	2	8	20569	20576	75 %	25 %	0 %	0 %	387827893
52	NC_017402	TTTA	2	8	20714	20721	25 %	75 %	0 %	0 %	387827893
53	NC_017402	TCAA	2	8	20834	20841	50 %	25 %	0 %	25 %	387827894
54	NC_017402	AAAG	2	8	20894	20901	75 %	0 %	25 %	0 %	387827894
55	NC_017402	AATT	2	8	21256	21263	50 %	50 %	0 %	0 %	387827894
56	NC_017402	AATA	2	8	21307	21314	75 %	25 %	0 %	0 %	387827894
57	NC_017402	AGAT	2	8	22355	22362	50 %	25 %	25 %	0 %	387827896
58	NC_017402	AGAT	2	8	22388	22395	50 %	25 %	25 %	0 %	387827896
59	NC_017402	ATAG	2	8	22456	22463	50 %	25 %	25 %	0 %	387827896
60	NC_017402	ATAG	2	8	22489	22496	50 %	25 %	25 %	0 %	387827896
61	NC_017402	AGAT	2	8	22508	22515	50 %	25 %	25 %	0 %	387827896
62	NC_017402	ATAG	2	8	22564	22571	50 %	25 %	25 %	0 %	387827896
63	NC_017402	AAAT	2	8	22616	22623	75 %	25 %	0 %	0 %	387827896
64	NC_017402	AATC	2	8	24224	24231	50 %	25 %	0 %	25 %	387827897
65	NC_017402	AGAT	2	8	24448	24455	50 %	25 %	25 %	0 %	387827897
66	NC_017402	AAAT	3	12	25171	25182	75 %	25 %	0 %	0 %	387827899
67	NC_017402	TTTA	2	8	25202	25209	25 %	75 %	0 %	0 %	387827899
68	NC_017402	ACCA	2	8	25555	25562	50 %	0 %	0 %	50 %	387827899
69	NC_017402	AATT	2	8	25604	25611	50 %	50 %	0 %	0 %	387827899
70	NC_017402	TTTA	2	8	25727	25734	25 %	75 %	0 %	0 %	387827899
71	NC_017402	TTGT	2	8	26266	26273	0 %	75 %	25 %	0 %	387827900
72	NC_017402	TATG	2	8	26318	26325	25 %	50 %	25 %	0 %	387827900
73	NC_017402	AAAG	2	8	27368	27375	75 %	0 %	25 %	0 %	387827901
74	NC_017402	TAAA	2	8	29113	29120	75 %	25 %	0 %	0 %	387827902
75	NC_017402	AATT	2	8	29159	29166	50 %	50 %	0 %	0 %	387827902

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.