MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-12

Total Repeats: 13

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017396	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387825582
2	NC_017396	CTGATA	2	12	2984	2995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825585
3	NC_017396	ACAAGC	2	12	4962	4973	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387825588
4	NC_017396	GAATTT	2	12	5203	5214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825588
5	NC_017396	TGAACT	2	12	5241	5252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387825588
6	NC_017396	AATGGA	2	12	6890	6901	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387825592
7	NC_017396	AAACCT	2	12	10237	10248	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387825596
8	NC_017396	TAAAAA	2	12	10350	10361	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387825597
9	NC_017396	TTGATA	2	12	14972	14983	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825603
10	NC_017396	ATAGAT	2	12	20901	20912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387825613
11	NC_017396	GATTAT	2	12	21150	21161	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387825613
12	NC_017396	GCTTAT	2	12	21845	21856	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387825614
13	NC_017396	AAAGAG	2	12	26747	26758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825618

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.