MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp26

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017395	CTTT	2	8	182	189	0 %	75 %	0 %	25 %	387825555
2	NC_017395	AAAT	2	8	624	631	75 %	25 %	0 %	0 %	387825556
3	NC_017395	AGAC	2	8	1313	1320	50 %	0 %	25 %	25 %	387825557
4	NC_017395	AATT	2	8	1448	1455	50 %	50 %	0 %	0 %	387825557
5	NC_017395	AATT	2	8	1688	1695	50 %	50 %	0 %	0 %	387825557
6	NC_017395	ACAA	2	8	1780	1787	75 %	0 %	0 %	25 %	387825557
7	NC_017395	TTTC	2	8	2078	2085	0 %	75 %	0 %	25 %	387825557
8	NC_017395	ATCA	2	8	4289	4296	50 %	25 %	0 %	25 %	387825559
9	NC_017395	AATG	2	8	4697	4704	50 %	25 %	25 %	0 %	387825560
10	NC_017395	CAAT	2	8	4726	4733	50 %	25 %	0 %	25 %	387825560
11	NC_017395	AAGG	2	8	4759	4766	50 %	0 %	50 %	0 %	387825560
12	NC_017395	GAAA	2	8	4774	4781	75 %	0 %	25 %	0 %	387825561
13	NC_017395	ATAA	2	8	5153	5160	75 %	25 %	0 %	0 %	387825561
14	NC_017395	GAAA	2	8	5350	5357	75 %	0 %	25 %	0 %	387825561
15	NC_017395	ATAA	2	8	5862	5869	75 %	25 %	0 %	0 %	387825561
16	NC_017395	GCTT	2	8	6242	6249	0 %	50 %	25 %	25 %	387825562
17	NC_017395	ATCC	2	8	6730	6737	25 %	25 %	0 %	50 %	387825563
18	NC_017395	ACTA	2	8	7024	7031	50 %	25 %	0 %	25 %	387825563
19	NC_017395	ATTA	2	8	8066	8073	50 %	50 %	0 %	0 %	387825564
20	NC_017395	TACT	2	8	8114	8121	25 %	50 %	0 %	25 %	387825564
21	NC_017395	AATA	2	8	8126	8133	75 %	25 %	0 %	0 %	387825564
22	NC_017395	ATAC	2	8	8679	8686	50 %	25 %	0 %	25 %	387825564
23	NC_017395	ATAA	2	8	8874	8881	75 %	25 %	0 %	0 %	387825565
24	NC_017395	ATTT	2	8	8962	8969	25 %	75 %	0 %	0 %	387825565
25	NC_017395	AGAA	2	8	9200	9207	75 %	0 %	25 %	0 %	387825565
26	NC_017395	CAAG	2	8	9413	9420	50 %	0 %	25 %	25 %	387825566
27	NC_017395	TAAA	2	8	10114	10121	75 %	25 %	0 %	0 %	387825567
28	NC_017395	GAAA	2	8	10199	10206	75 %	0 %	25 %	0 %	387825567
29	NC_017395	ATTA	2	8	10401	10408	50 %	50 %	0 %	0 %	387825567
30	NC_017395	AATT	2	8	10411	10418	50 %	50 %	0 %	0 %	387825567
31	NC_017395	AAAT	2	8	10622	10629	75 %	25 %	0 %	0 %	387825567
32	NC_017395	AATT	2	8	10924	10931	50 %	50 %	0 %	0 %	387825568
33	NC_017395	TTTA	2	8	11292	11299	25 %	75 %	0 %	0 %	387825568
34	NC_017395	ATTT	2	8	13971	13978	25 %	75 %	0 %	0 %	387825570
35	NC_017395	TGCA	2	8	14708	14715	25 %	25 %	25 %	25 %	387825570
36	NC_017395	ATTA	2	8	15210	15217	50 %	50 %	0 %	0 %	387825571
37	NC_017395	TTCA	2	8	15582	15589	25 %	50 %	0 %	25 %	387825571
38	NC_017395	AATT	2	8	16088	16095	50 %	50 %	0 %	0 %	387825571
39	NC_017395	TGGA	2	8	16164	16171	25 %	25 %	50 %	0 %	387825571
40	NC_017395	TTTG	2	8	16299	16306	0 %	75 %	25 %	0 %	387825571
41	NC_017395	TTAA	2	8	17538	17545	50 %	50 %	0 %	0 %	387825572
42	NC_017395	ATAA	2	8	18002	18009	75 %	25 %	0 %	0 %	387825573
43	NC_017395	AATT	2	8	18205	18212	50 %	50 %	0 %	0 %	387825573
44	NC_017395	AATA	2	8	18284	18291	75 %	25 %	0 %	0 %	387825573
45	NC_017395	GAAA	2	8	18297	18304	75 %	0 %	25 %	0 %	387825573
46	NC_017395	AAAT	2	8	18539	18546	75 %	25 %	0 %	0 %	387825573
47	NC_017395	TAAA	2	8	18814	18821	75 %	25 %	0 %	0 %	387825573
48	NC_017395	CCAA	2	8	18849	18856	50 %	0 %	0 %	50 %	387825573
49	NC_017395	ATTC	2	8	19055	19062	25 %	50 %	0 %	25 %	387825573
50	NC_017395	GATT	2	8	19338	19345	25 %	50 %	25 %	0 %	387825573
51	NC_017395	ATAA	2	8	19467	19474	75 %	25 %	0 %	0 %	387825574
52	NC_017395	AAAT	2	8	20004	20011	75 %	25 %	0 %	0 %	387825574
53	NC_017395	TAAA	2	8	20279	20286	75 %	25 %	0 %	0 %	387825574
54	NC_017395	CCAA	2	8	20314	20321	50 %	0 %	0 %	50 %	387825574
55	NC_017395	AATT	2	8	21218	21225	50 %	50 %	0 %	0 %	387825575
56	NC_017395	TAAA	2	8	21488	21495	75 %	25 %	0 %	0 %	387825576
57	NC_017395	ACTA	2	8	21588	21595	50 %	25 %	0 %	25 %	387825576
58	NC_017395	AATT	2	8	21636	21643	50 %	50 %	0 %	0 %	387825576
59	NC_017395	ATGA	2	8	21925	21932	50 %	25 %	25 %	0 %	387825577
60	NC_017395	TAAA	2	8	22109	22116	75 %	25 %	0 %	0 %	387825577
61	NC_017395	TCTA	2	8	22218	22225	25 %	50 %	0 %	25 %	387825577
62	NC_017395	ATTT	2	8	22402	22409	25 %	75 %	0 %	0 %	387825577
63	NC_017395	TAAT	2	8	22421	22428	50 %	50 %	0 %	0 %	387825577
64	NC_017395	ATTT	2	8	22774	22781	25 %	75 %	0 %	0 %	387825578
65	NC_017395	TAAA	2	8	22898	22905	75 %	25 %	0 %	0 %	387825578
66	NC_017395	ATTT	2	8	23089	23096	25 %	75 %	0 %	0 %	387825578
67	NC_017395	CAAA	2	8	23684	23691	75 %	0 %	0 %	25 %	387825579
68	NC_017395	ATAG	2	8	24449	24456	50 %	25 %	25 %	0 %	387825579
69	NC_017395	TCTT	2	8	25375	25382	0 %	75 %	0 %	25 %	387825580
70	NC_017395	ATTT	2	8	25496	25503	25 %	75 %	0 %	0 %	387825580
71	NC_017395	AAAT	2	8	25669	25676	75 %	25 %	0 %	0 %	387825580
72	NC_017395	TACA	2	8	26297	26304	50 %	25 %	0 %	25 %	387825580

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.