MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. LL01 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 16099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017255	CGC	2	6	42029	42034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384226906
1003	NC_017255	TCT	2	6	42124	42129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226906
1004	NC_017255	TCT	2	6	42193	42198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226906
1005	NC_017255	AAC	2	6	42201	42206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384226906
1006	NC_017255	TCCAT	2	10	42243	42252	20 %	40 %	0 %	40 %	384226906
1007	NC_017255	T	6	6	42333	42338	0 %	100 %	0 %	0 %	384226906
1008	NC_017255	T	6	6	42341	42346	0 %	100 %	0 %	0 %	384226906
1009	NC_017255	TTA	2	6	42467	42472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226906
1010	NC_017255	AAC	2	6	42498	42503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384226906
1011	NC_017255	CTT	2	6	42508	42513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226906
1012	NC_017255	CTG	2	6	42521	42526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226906
1013	NC_017255	CTACTG	2	12	42539	42550	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384226906
1014	NC_017255	GGTA	2	8	42594	42601	25 %	25 %	50 %	0 %	384226906
1015	NC_017255	CAT	3	9	42644	42652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226906
1016	NC_017255	TTG	2	6	42693	42698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226906
1017	NC_017255	A	7	7	42783	42789	100 %	0 %	0 %	0 %	384226906
1018	NC_017255	AAT	2	6	42822	42827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226906
1019	NC_017255	CTT	2	6	42836	42841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226906
1020	NC_017255	GATA	2	8	42850	42857	50 %	25 %	25 %	0 %	384226906
1021	NC_017255	ACTA	2	8	42870	42877	50 %	25 %	0 %	25 %	384226906
1022	NC_017255	TTTG	2	8	42925	42932	0 %	75 %	25 %	0 %	384226906
1023	NC_017255	AATT	2	8	42950	42957	50 %	50 %	0 %	0 %	384226906
1024	NC_017255	ACC	2	6	43059	43064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384226906
1025	NC_017255	TTC	2	6	43082	43087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226906
1026	NC_017255	ATT	2	6	43113	43118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226906
1027	NC_017255	A	6	6	43152	43157	100 %	0 %	0 %	0 %	384226906
1028	NC_017255	TCTT	2	8	43236	43243	0 %	75 %	0 %	25 %	384226906
1029	NC_017255	GAT	2	6	43328	43333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226906
1030	NC_017255	ATC	2	6	43338	43343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226906
1031	NC_017255	T	8	8	43376	43383	0 %	100 %	0 %	0 %	384226906
1032	NC_017255	ATG	2	6	43393	43398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226906
1033	NC_017255	TCT	2	6	43399	43404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226906
1034	NC_017255	TTC	2	6	43431	43436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226906
1035	NC_017255	CTAC	2	8	43465	43472	25 %	25 %	0 %	50 %	384226906
1036	NC_017255	A	7	7	43499	43505	100 %	0 %	0 %	0 %	384226906
1037	NC_017255	TAG	2	6	43538	43543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226906
1038	NC_017255	AT	4	8	43628	43635	50 %	50 %	0 %	0 %	384226906
1039	NC_017255	T	7	7	43689	43695	0 %	100 %	0 %	0 %	384226906
1040	NC_017255	AGA	2	6	43731	43736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226906
1041	NC_017255	AAT	2	6	43737	43742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226906
1042	NC_017255	T	7	7	43754	43760	0 %	100 %	0 %	0 %	384226906
1043	NC_017255	TTC	2	6	43784	43789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226906
1044	NC_017255	AT	3	6	43795	43800	50 %	50 %	0 %	0 %	384226906
1045	NC_017255	ATTTT	2	10	43820	43829	20 %	80 %	0 %	0 %	384226906
1046	NC_017255	ATT	2	6	43830	43835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226906
1047	NC_017255	T	6	6	43834	43839	0 %	100 %	0 %	0 %	384226906
1048	NC_017255	ACG	2	6	43866	43871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384226906
1049	NC_017255	AT	3	6	43884	43889	50 %	50 %	0 %	0 %	384226906
1050	NC_017255	T	8	8	43897	43904	0 %	100 %	0 %	0 %	384226906
1051	NC_017255	ATG	2	6	43913	43918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226906
1052	NC_017255	A	6	6	43995	44000	100 %	0 %	0 %	0 %	384226906
1053	NC_017255	TCT	2	6	44014	44019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226906
1054	NC_017255	TAT	2	6	44021	44026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226906
1055	NC_017255	AAT	2	6	44043	44048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226906
1056	NC_017255	AAAT	2	8	44085	44092	75 %	25 %	0 %	0 %	384226906
1057	NC_017255	AAT	2	6	44139	44144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226906
1058	NC_017255	TA	3	6	44153	44158	50 %	50 %	0 %	0 %	384226906
1059	NC_017255	GAG	2	6	44170	44175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384226906
1060	NC_017255	A	6	6	44199	44204	100 %	0 %	0 %	0 %	384226906
1061	NC_017255	ACT	2	6	44236	44241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226906
1062	NC_017255	TAT	2	6	44256	44261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226906
1063	NC_017255	AT	3	6	44299	44304	50 %	50 %	0 %	0 %	384226906
1064	NC_017255	CTT	2	6	44306	44311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226906
1065	NC_017255	TAAC	2	8	44452	44459	50 %	25 %	0 %	25 %	384226906
1066	NC_017255	TGC	2	6	44514	44519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226906
1067	NC_017255	T	6	6	44559	44564	0 %	100 %	0 %	0 %	384226906
1068	NC_017255	AGA	2	6	44587	44592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226906
1069	NC_017255	T	8	8	44643	44650	0 %	100 %	0 %	0 %	384226906
1070	NC_017255	ATTTCG	2	12	44897	44908	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384226907
1071	NC_017255	T	7	7	44928	44934	0 %	100 %	0 %	0 %	384226907
1072	NC_017255	TCT	2	6	44948	44953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226907
1073	NC_017255	CTA	2	6	44991	44996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226907
1074	NC_017255	CTT	2	6	45006	45011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226907
1075	NC_017255	A	7	7	45080	45086	100 %	0 %	0 %	0 %	384226907
1076	NC_017255	T	6	6	45099	45104	0 %	100 %	0 %	0 %	384226907
1077	NC_017255	GTT	2	6	45130	45135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226907
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1082	NC_017255	CTT	2	6	45420	45425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226908
1083	NC_017255	AG	3	6	45466	45471	50 %	0 %	50 %	0 %	384226908
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1085	NC_017255	TG	3	6	45509	45514	0 %	50 %	50 %	0 %	384226908
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1088	NC_017255	CAC	2	6	45546	45551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384226908
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1090	NC_017255	TTTAT	2	10	45707	45716	20 %	80 %	0 %	0 %	384226908
1091	NC_017255	AC	5	10	45719	45728	50 %	0 %	0 %	50 %	384226908
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1093	NC_017255	ATT	2	6	45791	45796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226908
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1096	NC_017255	AT	4	8	46158	46165	50 %	50 %	0 %	0 %	384226909
1097	NC_017255	GCG	2	6	46177	46182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384226909
1098	NC_017255	T	6	6	46190	46195	0 %	100 %	0 %	0 %	384226909
1099	NC_017255	AATT	2	8	46246	46253	50 %	50 %	0 %	0 %	384226909
1100	NC_017255	AAT	2	6	46271	46276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226909
1101	NC_017255	TGT	2	6	46343	46348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226909
1102	NC_017255	AAC	2	6	46442	46447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384226909
1103	NC_017255	CTT	2	6	46462	46467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226909
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1105	NC_017255	T	6	6	46474	46479	0 %	100 %	0 %	0 %	384226909
1106	NC_017255	TCC	2	6	46488	46493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384226909
1107	NC_017255	T	6	6	46622	46627	0 %	100 %	0 %	0 %	384226909
1108	NC_017255	AATT	2	8	46642	46649	50 %	50 %	0 %	0 %	384226909
1109	NC_017255	GAT	2	6	46683	46688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226909
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1111	NC_017255	T	7	7	46753	46759	0 %	100 %	0 %	0 %	384226909
1112	NC_017255	T	7	7	46771	46777	0 %	100 %	0 %	0 %	384226909
1113	NC_017255	ATT	2	6	46782	46787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226909
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1115	NC_017255	CAT	2	6	46837	46842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226910
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1118	NC_017255	ATTT	2	8	46909	46916	25 %	75 %	0 %	0 %	384226910
1119	NC_017255	T	6	6	46923	46928	0 %	100 %	0 %	0 %	384226910
1120	NC_017255	ATTT	2	8	46932	46939	25 %	75 %	0 %	0 %	384226910
1121	NC_017255	T	6	6	46951	46956	0 %	100 %	0 %	0 %	384226910
1122	NC_017255	T	7	7	46969	46975	0 %	100 %	0 %	0 %	384226910
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1127	NC_017255	T	7	7	47079	47085	0 %	100 %	0 %	0 %	384226910
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