MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. JF99 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 8342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017253	GTT	2	6	231	236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562367
2	NC_017253	AGC	2	6	260	265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562367
3	NC_017253	TCA	2	6	273	278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562367
4	NC_017253	ATT	2	6	296	301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562367
5	NC_017253	GGT	2	6	399	404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562367
6	NC_017253	ATG	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562367
7	NC_017253	CTG	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562367
8	NC_017253	CTA	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562367
9	NC_017253	AAT	2	6	546	551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562367
10	NC_017253	TGT	2	6	602	607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562367
11	NC_017253	AGC	2	6	659	664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562367
12	NC_017253	AGG	2	6	677	682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562367
13	NC_017253	CTG	2	6	712	717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562367
14	NC_017253	CGC	2	6	802	807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414562367
15	NC_017253	TTA	2	6	843	848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562367
16	NC_017253	CAT	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562367
17	NC_017253	ATA	2	6	960	965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562367
18	NC_017253	TAG	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562367
19	NC_017253	ACT	2	6	1320	1325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562367
20	NC_017253	GAA	2	6	1332	1337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562367
21	NC_017253	TTG	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562367
22	NC_017253	GCA	2	6	1371	1376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562367
23	NC_017253	GAT	2	6	1443	1448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562367
24	NC_017253	ACT	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562367
25	NC_017253	AGA	2	6	1520	1525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562367
26	NC_017253	TTA	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562367
27	NC_017253	TTG	2	6	1798	1803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562367
28	NC_017253	AGA	2	6	1868	1873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562367
29	NC_017253	ATC	2	6	1910	1915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562367
30	NC_017253	TCT	2	6	1947	1952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562367
31	NC_017253	GTT	2	6	1956	1961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562367
32	NC_017253	GCT	2	6	2028	2033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562367
33	NC_017253	TTA	2	6	2043	2048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562367
34	NC_017253	TCA	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562368
35	NC_017253	ATT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562368
36	NC_017253	TCT	2	6	2387	2392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562368
37	NC_017253	ATT	2	6	2394	2399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562368
38	NC_017253	CTG	2	6	2715	2720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562368
39	NC_017253	ATT	2	6	2914	2919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562368
40	NC_017253	TGC	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562368
41	NC_017253	TGG	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562368
42	NC_017253	TAA	2	6	3024	3029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562368
43	NC_017253	TGG	2	6	3189	3194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562369
44	NC_017253	ATT	2	6	3283	3288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562369
45	NC_017253	CCT	2	6	3579	3584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414562370
46	NC_017253	ATT	2	6	3585	3590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562370
47	NC_017253	ATT	2	6	3693	3698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562370
48	NC_017253	AGA	2	6	3761	3766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562370
49	NC_017253	AGA	2	6	3785	3790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562370
50	NC_017253	AGT	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562370
51	NC_017253	GAT	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562370
52	NC_017253	GTT	2	6	3941	3946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562370
53	NC_017253	CTT	2	6	3961	3966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562370
54	NC_017253	AAT	2	6	4049	4054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562371
55	NC_017253	TTA	2	6	4086	4091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562371
56	NC_017253	TGA	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562371
57	NC_017253	TAA	2	6	4212	4217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562371
58	NC_017253	ATT	2	6	4219	4224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562371
59	NC_017253	ATA	2	6	4254	4259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562371
60	NC_017253	CAT	2	6	4300	4305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562371
61	NC_017253	TTC	2	6	4379	4384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562371
62	NC_017253	AAT	2	6	4451	4456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562371
63	NC_017253	ATC	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562371
64	NC_017253	TAT	2	6	4623	4628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562372
65	NC_017253	TAT	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562372
66	NC_017253	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562372
67	NC_017253	AGT	2	6	4851	4856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562372
68	NC_017253	ATG	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562372
69	NC_017253	ATT	2	6	5080	5085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562372
70	NC_017253	ATT	2	6	5146	5151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562372
71	NC_017253	TGT	2	6	5154	5159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562372
72	NC_017253	AGA	2	6	5169	5174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562372
73	NC_017253	TAG	3	9	5201	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562372
74	NC_017253	ATT	2	6	5305	5310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562372
75	NC_017253	ATG	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562372
76	NC_017253	TAT	2	6	5357	5362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562372
77	NC_017253	ACC	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562372
78	NC_017253	TTA	2	6	5422	5427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562372
79	NC_017253	TAT	2	6	5517	5522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562372
80	NC_017253	CTA	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562372
81	NC_017253	CTG	2	6	5630	5635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562372
82	NC_017253	TGC	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562372
83	NC_017253	ATT	2	6	5686	5691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562372
84	NC_017253	TGC	2	6	5742	5747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562372
85	NC_017253	GAT	2	6	5773	5778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562372
86	NC_017253	ATT	2	6	5820	5825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562372
87	NC_017253	TTG	2	6	5879	5884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562372
88	NC_017253	AAT	2	6	5890	5895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562372
89	NC_017253	TGA	2	6	5901	5906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562372
90	NC_017253	ATT	3	9	5963	5971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562372
91	NC_017253	GAA	2	6	5983	5988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562372
92	NC_017253	TAA	2	6	5991	5996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562372
93	NC_017253	TGG	2	6	6181	6186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562373
94	NC_017253	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562373
95	NC_017253	ATT	2	6	6246	6251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562373
96	NC_017253	GAA	2	6	6309	6314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562373
97	NC_017253	TGG	2	6	6368	6373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562373
98	NC_017253	TAT	2	6	6400	6405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562373
99	NC_017253	ATT	2	6	6452	6457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562373
100	NC_017253	ATA	2	6	6631	6636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562373
101	NC_017253	ATT	2	6	6665	6670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562373
102	NC_017253	TAA	2	6	6707	6712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562373
103	NC_017253	ATT	2	6	6718	6723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562373
104	NC_017253	GCT	2	6	6825	6830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562373
105	NC_017253	ATA	2	6	6859	6864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562373
106	NC_017253	AAT	2	6	6997	7002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562374
107	NC_017253	ATC	2	6	7016	7021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562374
108	NC_017253	ATT	2	6	7025	7030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562374
109	NC_017253	GTC	2	6	7037	7042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562374
110	NC_017253	CAA	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562374
111	NC_017253	ATA	2	6	7290	7295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562374
112	NC_017253	GGT	2	6	7442	7447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562374
113	NC_017253	ATG	2	6	7493	7498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562374
114	NC_017253	ACC	2	6	7651	7656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414562374
115	NC_017253	TGA	2	6	7711	7716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562374
116	NC_017253	TAT	2	6	7731	7736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562374
117	NC_017253	ATA	2	6	7743	7748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562374
118	NC_017253	CAG	2	6	7806	7811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562374
119	NC_017253	AGA	2	6	7834	7839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562374
120	NC_017253	CAA	2	6	7869	7874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562374
121	NC_017253	CTG	2	6	7914	7919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562374
122	NC_017253	CAA	2	6	7944	7949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414562374
123	NC_017253	GTC	2	6	8040	8045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562374
124	NC_017253	ATT	2	6	8135	8140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562374
125	NC_017253	ATT	2	6	8179	8184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562374
126	NC_017253	TAT	2	6	8305	8310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562374
127	NC_017253	TGA	2	6	8323	8328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562374
128	NC_017253	GAA	2	6	8366	8371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562374
129	NC_017253	GTT	2	6	8541	8546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562375
130	NC_017253	GAA	2	6	8599	8604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562375
131	NC_017253	AGG	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562375
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