MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Brucella suis 1330 chromosome I

Total Repeats: 1302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017251	CGGGG	2	10	4059	4068	0 %	0 %	80 %	20 %	384223701
2	NC_017251	GGTCG	2	10	7635	7644	0 %	20 %	60 %	20 %	384223704
3	NC_017251	TCGGC	2	10	7664	7673	0 %	20 %	40 %	40 %	384223704
4	NC_017251	CTGAC	2	10	8101	8110	20 %	20 %	20 %	40 %	384223704
5	NC_017251	AAGAG	2	10	8857	8866	60 %	0 %	40 %	0 %	384223705
6	NC_017251	GCACC	2	10	9007	9016	20 %	0 %	20 %	60 %	384223705
7	NC_017251	TTTCA	2	10	11488	11497	20 %	60 %	0 %	20 %	384223707
8	NC_017251	ATCCG	2	10	11527	11536	20 %	20 %	20 %	40 %	384223707
9	NC_017251	AGCTT	2	10	12699	12708	20 %	40 %	20 %	20 %	384223708
10	NC_017251	CCAGT	2	10	15679	15688	20 %	20 %	20 %	40 %	384223711
11	NC_017251	CTCCG	2	10	17515	17524	0 %	20 %	20 %	60 %	384223713
12	NC_017251	CGTCA	2	10	19521	19530	20 %	20 %	20 %	40 %	384223715
13	NC_017251	AAAGC	2	10	19624	19633	60 %	0 %	20 %	20 %	384223715
14	NC_017251	GCAGG	2	10	22448	22457	20 %	0 %	60 %	20 %	384223716
15	NC_017251	TGCGC	2	10	22826	22835	0 %	20 %	40 %	40 %	384223716
16	NC_017251	GCGTC	2	10	24575	24584	0 %	20 %	40 %	40 %	384223718
17	NC_017251	GATGC	2	10	26759	26768	20 %	20 %	40 %	20 %	384223719
18	NC_017251	GATCG	2	10	28920	28929	20 %	20 %	40 %	20 %	384223721
19	NC_017251	TATGA	2	10	29721	29730	40 %	40 %	20 %	0 %	384223722
20	NC_017251	ACCCG	2	10	30196	30205	20 %	0 %	20 %	60 %	384223722
21	NC_017251	AGCGC	2	10	31045	31054	20 %	0 %	40 %	40 %	384223723
22	NC_017251	CTGTC	2	10	31871	31880	0 %	40 %	20 %	40 %	384223724
23	NC_017251	CATGG	2	10	32292	32301	20 %	20 %	40 %	20 %	384223724
24	NC_017251	AAAGG	2	10	34186	34195	60 %	0 %	40 %	0 %	384223725
25	NC_017251	AAAGC	2	10	36232	36241	60 %	0 %	20 %	20 %	384223727
26	NC_017251	GCGAT	2	10	36583	36592	20 %	20 %	40 %	20 %	384223728
27	NC_017251	GCCGC	2	10	40945	40954	0 %	0 %	40 %	60 %	384223732
28	NC_017251	GACCA	2	10	40991	41000	40 %	0 %	20 %	40 %	384223732
29	NC_017251	GCATG	2	10	41682	41691	20 %	20 %	40 %	20 %	384223733
30	NC_017251	GTGCG	2	10	41768	41777	0 %	20 %	60 %	20 %	384223733
31	NC_017251	TCTTG	2	10	41877	41886	0 %	60 %	20 %	20 %	384223733
32	NC_017251	GCCGC	2	10	42512	42521	0 %	0 %	40 %	60 %	384223734
33	NC_017251	GCGTC	2	10	44986	44995	0 %	20 %	40 %	40 %	384223737
34	NC_017251	TCGTT	2	10	46477	46486	0 %	60 %	20 %	20 %	384223739
35	NC_017251	GGCAT	2	10	49011	49020	20 %	20 %	40 %	20 %	384223740
36	NC_017251	GCCGC	2	10	53079	53088	0 %	0 %	40 %	60 %	384223745
37	NC_017251	CGGGC	2	10	54695	54704	0 %	0 %	60 %	40 %	384223746
38	NC_017251	TGCGC	2	10	54713	54722	0 %	20 %	40 %	40 %	384223746
39	NC_017251	TGGTC	2	10	56843	56852	0 %	40 %	40 %	20 %	384223746
40	NC_017251	GGTGC	2	10	57159	57168	0 %	20 %	60 %	20 %	384223746
41	NC_017251	GAAAG	2	10	60266	60275	60 %	0 %	40 %	0 %	384223749
42	NC_017251	GCCTT	2	10	61918	61927	0 %	40 %	20 %	40 %	384223751
43	NC_017251	TGTCG	2	10	63519	63528	0 %	40 %	40 %	20 %	384223754
44	NC_017251	AGAAA	2	10	63690	63699	80 %	0 %	20 %	0 %	384223754
45	NC_017251	CAAGA	2	10	66509	66518	60 %	0 %	20 %	20 %	384223756
46	NC_017251	CCCAT	2	10	67784	67793	20 %	20 %	0 %	60 %	384223758
47	NC_017251	GCATC	2	10	69111	69120	20 %	20 %	20 %	40 %	384223759
48	NC_017251	ATCTT	2	10	70058	70067	20 %	60 %	0 %	20 %	384223760
49	NC_017251	GGCGC	2	10	72676	72685	0 %	0 %	60 %	40 %	384223765
50	NC_017251	GGCGC	2	10	74025	74034	0 %	0 %	60 %	40 %	384223766
51	NC_017251	GATGC	2	10	76037	76046	20 %	20 %	40 %	20 %	384223766
52	NC_017251	CGCGC	2	10	76969	76978	0 %	0 %	40 %	60 %	384223767
53	NC_017251	CATCA	2	10	77045	77054	40 %	20 %	0 %	40 %	384223767
54	NC_017251	GCGCA	2	10	77522	77531	20 %	0 %	40 %	40 %	384223767
55	NC_017251	CGGCG	2	10	77587	77596	0 %	0 %	60 %	40 %	384223768
56	NC_017251	TTCCA	2	10	77689	77698	20 %	40 %	0 %	40 %	384223768
57	NC_017251	ACGTT	2	10	79827	79836	20 %	40 %	20 %	20 %	384223769
58	NC_017251	TGGCG	2	10	81047	81056	0 %	20 %	60 %	20 %	384223769
59	NC_017251	GAGGT	2	10	85366	85375	20 %	20 %	60 %	0 %	384223773
60	NC_017251	AACGC	2	10	92707	92716	40 %	0 %	20 %	40 %	384223783
61	NC_017251	GGGCG	2	10	93150	93159	0 %	0 %	80 %	20 %	384223783
62	NC_017251	CGCTG	2	10	93919	93928	0 %	20 %	40 %	40 %	384223784
63	NC_017251	CGGCA	2	10	93995	94004	20 %	0 %	40 %	40 %	384223784
64	NC_017251	GGGCA	2	10	94842	94851	20 %	0 %	60 %	20 %	384223785
65	NC_017251	ATAGA	2	10	96334	96343	60 %	20 %	20 %	0 %	384223787
66	NC_017251	AAAAG	2	10	97029	97038	80 %	0 %	20 %	0 %	384223788
67	NC_017251	CCCAG	2	10	99087	99096	20 %	0 %	20 %	60 %	384223789
68	NC_017251	GACCG	2	10	100213	100222	20 %	0 %	40 %	40 %	384223790
69	NC_017251	CGGCC	2	10	100902	100911	0 %	0 %	40 %	60 %	384223791
70	NC_017251	CGGCG	2	10	103422	103431	0 %	0 %	60 %	40 %	384223795
71	NC_017251	CGGGC	2	10	103775	103784	0 %	0 %	60 %	40 %	384223795
72	NC_017251	CATCG	2	10	104785	104794	20 %	20 %	20 %	40 %	384223795
73	NC_017251	GGGAG	2	10	104844	104853	20 %	0 %	80 %	0 %	384223795
74	NC_017251	GCCAT	2	10	108074	108083	20 %	20 %	20 %	40 %	384223801
75	NC_017251	CGCTG	2	10	111152	111161	0 %	20 %	40 %	40 %	384223804
76	NC_017251	GCCTG	2	10	111515	111524	0 %	20 %	40 %	40 %	384223804
77	NC_017251	TGCCG	2	10	111999	112008	0 %	20 %	40 %	40 %	384223805
78	NC_017251	TGCCG	2	10	112206	112215	0 %	20 %	40 %	40 %	384223805
79	NC_017251	CCTTT	2	10	112244	112253	0 %	60 %	0 %	40 %	384223805
80	NC_017251	CTGGC	2	10	114624	114633	0 %	20 %	40 %	40 %	384223807
81	NC_017251	GCGCA	2	10	117327	117336	20 %	0 %	40 %	40 %	384223807
82	NC_017251	GCTCG	2	10	118292	118301	0 %	20 %	40 %	40 %	384223807
83	NC_017251	GACCA	2	10	118308	118317	40 %	0 %	20 %	40 %	384223807
84	NC_017251	CGCGG	2	10	120345	120354	0 %	0 %	60 %	40 %	384223807
85	NC_017251	GGCGA	2	10	120633	120642	20 %	0 %	60 %	20 %	384223807
86	NC_017251	TGGCT	2	10	121908	121917	0 %	40 %	40 %	20 %	384223807
87	NC_017251	GCTCG	2	10	122087	122096	0 %	20 %	40 %	40 %	384223807
88	NC_017251	GCGCG	2	10	122912	122921	0 %	0 %	60 %	40 %	384223808
89	NC_017251	CGCGG	2	10	124702	124711	0 %	0 %	60 %	40 %	384223809
90	NC_017251	GATAG	2	10	127159	127168	40 %	20 %	40 %	0 %	384223812
91	NC_017251	TGGAA	2	10	133496	133505	40 %	20 %	40 %	0 %	384223817
92	NC_017251	ACCGC	2	10	135197	135206	20 %	0 %	20 %	60 %	384223819
93	NC_017251	GCCAT	2	10	135849	135858	20 %	20 %	20 %	40 %	384223819
94	NC_017251	GCCGA	2	10	140359	140368	20 %	0 %	40 %	40 %	384223821
95	NC_017251	CCGGC	2	10	140666	140675	0 %	0 %	40 %	60 %	384223821
96	NC_017251	AGCAC	2	10	141599	141608	40 %	0 %	20 %	40 %	384223821
97	NC_017251	CCTTG	2	10	149270	149279	0 %	40 %	20 %	40 %	384223827
98	NC_017251	TGCGA	2	10	150880	150889	20 %	20 %	40 %	20 %	384223829
99	NC_017251	CGGCA	2	10	154018	154027	20 %	0 %	40 %	40 %	384223834
100	NC_017251	CAGTG	2	10	154534	154543	20 %	20 %	40 %	20 %	384223835
101	NC_017251	TCAAC	2	10	155715	155724	40 %	20 %	0 %	40 %	384223836
102	NC_017251	AGGGC	2	10	158314	158323	20 %	0 %	60 %	20 %	384223838
103	NC_017251	GCACC	2	10	159518	159527	20 %	0 %	20 %	60 %	384223838
104	NC_017251	GTTCG	2	10	159686	159695	0 %	40 %	40 %	20 %	384223838
105	NC_017251	GCCGG	2	10	163010	163019	0 %	0 %	60 %	40 %	384223840
106	NC_017251	GCCGC	2	10	168866	168875	0 %	0 %	40 %	60 %	384223844
107	NC_017251	GACGT	2	10	173889	173898	20 %	20 %	40 %	20 %	384223850
108	NC_017251	TGGCG	2	10	175827	175836	0 %	20 %	60 %	20 %	384223851
109	NC_017251	CGCTT	2	10	175968	175977	0 %	40 %	20 %	40 %	384223851
110	NC_017251	TGACC	2	10	177419	177428	20 %	20 %	20 %	40 %	384223853
111	NC_017251	AAATC	2	10	179865	179874	60 %	20 %	0 %	20 %	384223859
112	NC_017251	AGCGA	2	10	180967	180976	40 %	0 %	40 %	20 %	384223860
113	NC_017251	TGAAT	2	10	185301	185310	40 %	40 %	20 %	0 %	384223865
114	NC_017251	CGGGC	2	10	186613	186622	0 %	0 %	60 %	40 %	384223867
115	NC_017251	TGCCT	2	10	187198	187207	0 %	40 %	20 %	40 %	384223868
116	NC_017251	GCATC	2	10	187768	187777	20 %	20 %	20 %	40 %	384223869
117	NC_017251	GACGC	2	10	189212	189221	20 %	0 %	40 %	40 %	384223870
118	NC_017251	AGGCG	2	10	189514	189523	20 %	0 %	60 %	20 %	384223870
119	NC_017251	CATGA	2	10	191293	191302	40 %	20 %	20 %	20 %	384223872
120	NC_017251	ATCCG	2	10	191860	191869	20 %	20 %	20 %	40 %	384223873
121	NC_017251	GCGCA	2	10	193259	193268	20 %	0 %	40 %	40 %	384223874
122	NC_017251	ACCGC	2	10	197617	197626	20 %	0 %	20 %	60 %	384223881
123	NC_017251	ATGTC	2	10	201375	201384	20 %	40 %	20 %	20 %	384223883
124	NC_017251	CCGGC	2	10	201657	201666	0 %	0 %	40 %	60 %	384223883
125	NC_017251	GCGCG	2	10	203146	203155	0 %	0 %	60 %	40 %	384223884
126	NC_017251	CCCGC	2	10	204012	204021	0 %	0 %	20 %	80 %	384223886
127	NC_017251	GGTTG	2	10	204203	204212	0 %	40 %	60 %	0 %	384223886
128	NC_017251	CGATC	2	10	205960	205969	20 %	20 %	20 %	40 %	384223887
129	NC_017251	GGCGC	2	10	208176	208185	0 %	0 %	60 %	40 %	384223889
130	NC_017251	GGGGC	2	10	210825	210834	0 %	0 %	80 %	20 %	384223892
131	NC_017251	TCCTT	2	10	211989	211998	0 %	60 %	0 %	40 %	384223892
132	NC_017251	ATCGC	2	10	213846	213855	20 %	20 %	20 %	40 %	384223893
133	NC_017251	GTTTC	2	10	215799	215808	0 %	60 %	20 %	20 %	384223894
134	NC_017251	GGCAA	2	10	216582	216591	40 %	0 %	40 %	20 %	384223894
135	NC_017251	TCAGG	2	10	220042	220051	20 %	20 %	40 %	20 %	384223896
136	NC_017251	ATGAC	2	10	220447	220456	40 %	20 %	20 %	20 %	384223899
137	NC_017251	GGATG	2	10	222176	222185	20 %	20 %	60 %	0 %	384223900
138	NC_017251	AGCCA	2	10	222340	222349	40 %	0 %	20 %	40 %	384223900
139	NC_017251	CGGGC	2	10	222572	222581	0 %	0 %	60 %	40 %	384223900
140	NC_017251	TTCGG	2	10	222682	222691	0 %	40 %	40 %	20 %	384223900
141	NC_017251	GCGCA	2	10	224842	224851	20 %	0 %	40 %	40 %	384223903
142	NC_017251	CGAAC	2	10	228650	228659	40 %	0 %	20 %	40 %	384223908
143	NC_017251	CGGGC	2	10	231141	231150	0 %	0 %	60 %	40 %	384223909
144	NC_017251	CCGAT	2	10	232397	232406	20 %	20 %	20 %	40 %	384223909
145	NC_017251	GGAAA	2	10	234226	234235	60 %	0 %	40 %	0 %	384223911
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148	NC_017251	CGCTG	2	10	242988	242997	0 %	20 %	40 %	40 %	384223920
149	NC_017251	CACGT	2	10	244449	244458	20 %	20 %	20 %	40 %	384223920
150	NC_017251	CTGGT	2	10	248109	248118	0 %	40 %	40 %	20 %	384223924
151	NC_017251	CGGCG	2	10	249235	249244	0 %	0 %	60 %	40 %	384223925
152	NC_017251	CGGAG	2	10	249395	249404	20 %	0 %	60 %	20 %	384223925
153	NC_017251	GCATC	2	10	250038	250047	20 %	20 %	20 %	40 %	384223926
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156	NC_017251	TGGCT	2	10	256236	256245	0 %	40 %	40 %	20 %	384223934
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159	NC_017251	CATTG	2	10	260201	260210	20 %	40 %	20 %	20 %	384223939
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164	NC_017251	GGCGG	2	10	269052	269061	0 %	0 %	80 %	20 %	384223950
165	NC_017251	TTGCG	2	10	270560	270569	0 %	40 %	40 %	20 %	384223951
166	NC_017251	GCGTC	2	10	271703	271712	0 %	20 %	40 %	40 %	384223952
167	NC_017251	GAAGT	2	10	275915	275924	40 %	20 %	40 %	0 %	384223960
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169	NC_017251	GCATG	2	10	277036	277045	20 %	20 %	40 %	20 %	384223960
170	NC_017251	GCATG	2	10	280623	280632	20 %	20 %	40 %	20 %	384223964
171	NC_017251	GGCGC	2	10	281637	281646	0 %	0 %	60 %	40 %	384223966
172	NC_017251	GCGAT	2	10	283068	283077	20 %	20 %	40 %	20 %	384223967
173	NC_017251	ATGAC	2	10	283194	283203	40 %	20 %	20 %	20 %	384223967
174	NC_017251	AGATC	2	10	283216	283225	40 %	20 %	20 %	20 %	384223967
175	NC_017251	TTCGC	2	10	283393	283402	0 %	40 %	20 %	40 %	384223967
176	NC_017251	CTCGC	2	10	284180	284189	0 %	20 %	20 %	60 %	384223967
177	NC_017251	CGCGG	2	10	284705	284714	0 %	0 %	60 %	40 %	384223967
178	NC_017251	TCGGT	2	10	284949	284958	0 %	40 %	40 %	20 %	384223967
179	NC_017251	GCGCG	2	10	286015	286024	0 %	0 %	60 %	40 %	384223968
180	NC_017251	CGCGC	2	10	286581	286590	0 %	0 %	40 %	60 %	384223968
181	NC_017251	AGATC	2	10	289109	289118	40 %	20 %	20 %	20 %	384223970
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193	NC_017251	TCTAT	2	10	308018	308027	20 %	60 %	0 %	20 %	384223986
194	NC_017251	GGATG	2	10	308545	308554	20 %	20 %	60 %	0 %	384223986
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198	NC_017251	CGCGG	2	10	315535	315544	0 %	0 %	60 %	40 %	384223993
199	NC_017251	GCCGT	2	10	319319	319328	0 %	20 %	40 %	40 %	384223996
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203	NC_017251	GGGCA	2	10	322158	322167	20 %	0 %	60 %	20 %	384224000
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214	NC_017251	GATTT	2	10	334655	334664	20 %	60 %	20 %	0 %	384224012
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232	NC_017251	CTTCA	2	10	363101	363110	20 %	40 %	0 %	40 %	384224040
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239	NC_017251	CGGCA	2	10	368324	368333	20 %	0 %	40 %	40 %	384224045
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243	NC_017251	GGCGG	2	10	376225	376234	0 %	0 %	80 %	20 %	384224052
244	NC_017251	GCGCG	2	10	378961	378970	0 %	0 %	60 %	40 %	384224055
245	NC_017251	CTTTC	2	10	379123	379132	0 %	60 %	0 %	40 %	384224055
246	NC_017251	TGCGC	2	10	382095	382104	0 %	20 %	40 %	40 %	384224058
247	NC_017251	GGATC	2	10	385021	385030	20 %	20 %	40 %	20 %	384224059
248	NC_017251	CAGGA	2	10	385892	385901	40 %	0 %	40 %	20 %	384224060
249	NC_017251	GCCTG	2	10	386024	386033	0 %	20 %	40 %	40 %	384224060
250	NC_017251	ATGGC	2	10	387794	387803	20 %	20 %	40 %	20 %	384224062
251	NC_017251	GGGCA	2	10	388134	388143	20 %	0 %	60 %	20 %	384224062
252	NC_017251	GGCTG	2	10	389764	389773	0 %	20 %	60 %	20 %	384224063
253	NC_017251	ACAAA	2	10	390110	390119	80 %	0 %	0 %	20 %	384224064
254	NC_017251	TGTGG	2	10	391404	391413	0 %	40 %	60 %	0 %	384224065
255	NC_017251	CGATC	2	10	392467	392476	20 %	20 %	20 %	40 %	384224069
256	NC_017251	GCAGG	2	10	395157	395166	20 %	0 %	60 %	20 %	384224073
257	NC_017251	GCATG	2	10	395197	395206	20 %	20 %	40 %	20 %	384224073
258	NC_017251	CGGCG	2	10	395228	395237	0 %	0 %	60 %	40 %	384224073
259	NC_017251	CCGGC	2	10	395432	395441	0 %	0 %	40 %	60 %	384224073
260	NC_017251	GACAT	2	10	395958	395967	40 %	20 %	20 %	20 %	384224074
261	NC_017251	GGCGC	2	10	396490	396499	0 %	0 %	60 %	40 %	384224074
262	NC_017251	CGGCC	2	10	396856	396865	0 %	0 %	40 %	60 %	384224074
263	NC_017251	ACGGC	2	10	397188	397197	20 %	0 %	40 %	40 %	384224075
264	NC_017251	GGCCC	2	10	397358	397367	0 %	0 %	40 %	60 %	384224075
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388	NC_017251	TCCGA	2	10	599484	599493	20 %	20 %	20 %	40 %	384224284
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499	NC_017251	GCCGG	2	10	775129	775138	0 %	0 %	60 %	40 %	384224468
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