MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Brucella suis 1330 chromosome II

Total Repeats: 710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017250	GCGAA	2	10	288	297	40 %	0 %	40 %	20 %	384222554
2	NC_017250	CATGG	2	10	431	440	20 %	20 %	40 %	20 %	384222554
3	NC_017250	CCGCG	2	10	782	791	0 %	0 %	40 %	60 %	384222554
4	NC_017250	ATTTC	2	10	1583	1592	20 %	60 %	0 %	20 %	384222556
5	NC_017250	GGGAG	2	10	1695	1704	20 %	0 %	80 %	0 %	384222556
6	NC_017250	CTGCC	2	10	2165	2174	0 %	20 %	20 %	60 %	384222558
7	NC_017250	CAAGG	2	10	2499	2508	40 %	0 %	40 %	20 %	384222558
8	NC_017250	GCCGC	2	10	4432	4441	0 %	0 %	40 %	60 %	384222560
9	NC_017250	ACCGA	2	10	8529	8538	40 %	0 %	20 %	40 %	384222563
10	NC_017250	CGGCG	2	10	11736	11745	0 %	0 %	60 %	40 %	384222567
11	NC_017250	CCCCG	2	10	13915	13924	0 %	0 %	20 %	80 %	384222569
12	NC_017250	GCCGA	2	10	15121	15130	20 %	0 %	40 %	40 %	384222570
13	NC_017250	CATCA	2	10	15567	15576	40 %	20 %	0 %	40 %	384222570
14	NC_017250	AGGCG	2	10	18910	18919	20 %	0 %	60 %	20 %	384222574
15	NC_017250	GCCAT	2	10	19174	19183	20 %	20 %	20 %	40 %	384222575
16	NC_017250	TGAGG	2	10	19460	19469	20 %	20 %	60 %	0 %	384222575
17	NC_017250	GCTTC	2	10	19542	19551	0 %	40 %	20 %	40 %	384222575
18	NC_017250	TCTCG	2	10	23173	23182	0 %	40 %	20 %	40 %	384222579
19	NC_017250	CGGCC	2	10	23887	23896	0 %	0 %	40 %	60 %	384222579
20	NC_017250	CGGCC	2	10	24375	24384	0 %	0 %	40 %	60 %	384222580
21	NC_017250	ATCCG	2	10	24822	24831	20 %	20 %	20 %	40 %	384222580
22	NC_017250	GGCGA	2	10	25176	25185	20 %	0 %	60 %	20 %	384222581
23	NC_017250	ACGGC	2	10	27207	27216	20 %	0 %	40 %	40 %	384222584
24	NC_017250	GCGCA	2	10	28314	28323	20 %	0 %	40 %	40 %	384222585
25	NC_017250	TCGGT	2	10	28531	28540	0 %	40 %	40 %	20 %	384222585
26	NC_017250	CCGCG	2	10	33723	33732	0 %	0 %	40 %	60 %	384222590
27	NC_017250	CTGCC	2	10	35754	35763	0 %	20 %	20 %	60 %	384222590
28	NC_017250	CGGAA	2	10	38782	38791	40 %	0 %	40 %	20 %	384222595
29	NC_017250	CATGC	2	10	41011	41020	20 %	20 %	20 %	40 %	384222597
30	NC_017250	GCGCC	2	10	41756	41765	0 %	0 %	40 %	60 %	384222598
31	NC_017250	CAGCG	2	10	42638	42647	20 %	0 %	40 %	40 %	384222599
32	NC_017250	CGGCG	2	10	43537	43546	0 %	0 %	60 %	40 %	384222601
33	NC_017250	GCAAA	2	10	44124	44133	60 %	0 %	20 %	20 %	384222602
34	NC_017250	TGAAA	2	10	44289	44298	60 %	20 %	20 %	0 %	384222603
35	NC_017250	CCGCT	2	10	50281	50290	0 %	20 %	20 %	60 %	384222607
36	NC_017250	GGTAA	2	10	51612	51621	40 %	20 %	40 %	0 %	384222608
37	NC_017250	CCGGC	2	10	52066	52075	0 %	0 %	40 %	60 %	384222608
38	NC_017250	CGGAA	2	10	52766	52775	40 %	0 %	40 %	20 %	384222608
39	NC_017250	GCCGT	2	10	55065	55074	0 %	20 %	40 %	40 %	384222610
40	NC_017250	CATTC	2	10	55314	55323	20 %	40 %	0 %	40 %	384222610
41	NC_017250	CTTCG	2	10	57192	57201	0 %	40 %	20 %	40 %	384222612
42	NC_017250	TTTGC	2	10	59177	59186	0 %	60 %	20 %	20 %	384222614
43	NC_017250	TGCCC	2	10	60574	60583	0 %	20 %	20 %	60 %	384222615
44	NC_017250	ATGCG	2	10	62515	62524	20 %	20 %	40 %	20 %	384222618
45	NC_017250	ATGTG	2	10	64353	64362	20 %	40 %	40 %	0 %	384222619
46	NC_017250	ATCGC	2	10	68511	68520	20 %	20 %	20 %	40 %	384222623
47	NC_017250	GACGG	2	10	68822	68831	20 %	0 %	60 %	20 %	384222623
48	NC_017250	AGGGC	2	10	78434	78443	20 %	0 %	60 %	20 %	384222632
49	NC_017250	AATTC	2	10	78554	78563	40 %	40 %	0 %	20 %	384222632
50	NC_017250	TCTGC	2	10	83142	83151	0 %	40 %	20 %	40 %	384222635
51	NC_017250	GCCGG	2	10	93484	93493	0 %	0 %	60 %	40 %	384222646
52	NC_017250	TGCGG	2	10	93508	93517	0 %	20 %	60 %	20 %	384222646
53	NC_017250	ATGAA	2	10	93737	93746	60 %	20 %	20 %	0 %	384222646
54	NC_017250	CTTTC	2	10	94106	94115	0 %	60 %	0 %	40 %	384222647
55	NC_017250	GCAAT	2	10	94732	94741	40 %	20 %	20 %	20 %	384222647
56	NC_017250	CTTGC	2	10	94976	94985	0 %	40 %	20 %	40 %	384222648
57	NC_017250	GGAAT	2	10	95246	95255	40 %	20 %	40 %	0 %	384222648
58	NC_017250	GTAAT	2	10	95866	95875	40 %	40 %	20 %	0 %	384222649
59	NC_017250	AAGCG	2	10	96097	96106	40 %	0 %	40 %	20 %	384222649
60	NC_017250	CCGAG	2	10	96553	96562	20 %	0 %	40 %	40 %	384222649
61	NC_017250	TCGCT	2	10	97703	97712	0 %	40 %	20 %	40 %	384222650
62	NC_017250	ATGGC	2	10	98219	98228	20 %	20 %	40 %	20 %	384222650
63	NC_017250	TTCGC	2	10	99605	99614	0 %	40 %	20 %	40 %	384222651
64	NC_017250	GCTCT	2	10	99718	99727	0 %	40 %	20 %	40 %	384222651
65	NC_017250	ATGAG	2	10	99812	99821	40 %	20 %	40 %	0 %	384222651
66	NC_017250	GTTCC	2	10	99924	99933	0 %	40 %	20 %	40 %	384222651
67	NC_017250	TGCTG	2	10	100532	100541	0 %	40 %	40 %	20 %	384222652
68	NC_017250	ATGAA	2	10	103445	103454	60 %	20 %	20 %	0 %	384222656
69	NC_017250	CCGCT	2	10	103740	103749	0 %	20 %	20 %	60 %	384222657
70	NC_017250	CCGAT	2	10	103893	103902	20 %	20 %	20 %	40 %	384222657
71	NC_017250	TCCTT	2	10	106789	106798	0 %	60 %	0 %	40 %	384222659
72	NC_017250	GGCGA	2	10	107770	107779	20 %	0 %	60 %	20 %	384222660
73	NC_017250	CCGCG	2	10	113326	113335	0 %	0 %	40 %	60 %	384222665
74	NC_017250	CGGTG	2	10	114914	114923	0 %	20 %	60 %	20 %	384222666
75	NC_017250	GCCAT	2	10	117873	117882	20 %	20 %	20 %	40 %	384222667
76	NC_017250	CGCGG	2	10	127996	128005	0 %	0 %	60 %	40 %	384222678
77	NC_017250	AATCA	2	10	129117	129126	60 %	20 %	0 %	20 %	384222680
78	NC_017250	TGGGC	2	10	132809	132818	0 %	20 %	60 %	20 %	384222685
79	NC_017250	CAAGA	2	10	132921	132930	60 %	0 %	20 %	20 %	384222685
80	NC_017250	TGGGA	2	10	136196	136205	20 %	20 %	60 %	0 %	384222691
81	NC_017250	GGGCA	3	15	140775	140789	20 %	0 %	60 %	20 %	384222696
82	NC_017250	CCGCA	2	10	143292	143301	20 %	0 %	20 %	60 %	384222700
83	NC_017250	ATGAA	2	10	144343	144352	60 %	20 %	20 %	0 %	384222701
84	NC_017250	CGCAG	2	10	146804	146813	20 %	0 %	40 %	40 %	384222704
85	NC_017250	CCGGC	2	10	150186	150195	0 %	0 %	40 %	60 %	384222710
86	NC_017250	CGCAT	2	10	150264	150273	20 %	20 %	20 %	40 %	384222710
87	NC_017250	CTATA	2	10	151741	151750	40 %	40 %	0 %	20 %	384222711
88	NC_017250	GCTTT	2	10	152725	152734	0 %	60 %	20 %	20 %	384222712
89	NC_017250	CGCGG	2	10	152804	152813	0 %	0 %	60 %	40 %	384222712
90	NC_017250	AGCGG	2	10	162957	162966	20 %	0 %	60 %	20 %	384222723
91	NC_017250	GCCGC	2	10	165445	165454	0 %	0 %	40 %	60 %	384222726
92	NC_017250	GTGGC	2	10	165761	165770	0 %	20 %	60 %	20 %	384222726
93	NC_017250	GCCTG	2	10	166558	166567	0 %	20 %	40 %	40 %	384222727
94	NC_017250	GGCCG	2	10	169513	169522	0 %	0 %	60 %	40 %	384222729
95	NC_017250	AGGGC	2	10	169946	169955	20 %	0 %	60 %	20 %	384222730
96	NC_017250	GCCCG	2	10	170756	170765	0 %	0 %	40 %	60 %	384222731
97	NC_017250	GTTCG	2	10	172408	172417	0 %	40 %	40 %	20 %	384222732
98	NC_017250	GTCTC	2	10	172443	172452	0 %	40 %	20 %	40 %	384222732
99	NC_017250	CTTCA	2	10	179887	179896	20 %	40 %	0 %	40 %	384222739
100	NC_017250	TGACC	2	10	180156	180165	20 %	20 %	20 %	40 %	384222739
101	NC_017250	GCCTC	2	10	182424	182433	0 %	20 %	20 %	60 %	384222743
102	NC_017250	GTGAA	2	10	190322	190331	40 %	20 %	40 %	0 %	384222750
103	NC_017250	GAAGA	2	10	190654	190663	60 %	0 %	40 %	0 %	384222750
104	NC_017250	GCCGC	2	10	191157	191166	0 %	0 %	40 %	60 %	384222750
105	NC_017250	GCGCC	2	10	197242	197251	0 %	0 %	40 %	60 %	384222753
106	NC_017250	GTTCA	2	10	197318	197327	20 %	40 %	20 %	20 %	384222753
107	NC_017250	CGTGT	2	10	203912	203921	0 %	40 %	40 %	20 %	384222761
108	NC_017250	CGGCA	2	10	204329	204338	20 %	0 %	40 %	40 %	384222761
109	NC_017250	GGCGT	2	10	205116	205125	0 %	20 %	60 %	20 %	384222761
110	NC_017250	AGGGC	2	10	205276	205285	20 %	0 %	60 %	20 %	384222761
111	NC_017250	TGAAG	2	10	209837	209846	40 %	20 %	40 %	0 %	384222765
112	NC_017250	TTCGA	2	10	210147	210156	20 %	40 %	20 %	20 %	384222765
113	NC_017250	CGCCT	2	10	210364	210373	0 %	20 %	20 %	60 %	384222766
114	NC_017250	CGGGC	2	10	210806	210815	0 %	0 %	60 %	40 %	384222766
115	NC_017250	GGCCG	2	10	212025	212034	0 %	0 %	60 %	40 %	384222767
116	NC_017250	CGCCA	2	10	216805	216814	20 %	0 %	20 %	60 %	384222770
117	NC_017250	GCCCG	2	10	218374	218383	0 %	0 %	40 %	60 %	384222772
118	NC_017250	GCGCA	2	10	220226	220235	20 %	0 %	40 %	40 %	384222774
119	NC_017250	CGCAA	2	10	220865	220874	40 %	0 %	20 %	40 %	384222774
120	NC_017250	TGTTT	2	10	222164	222173	0 %	80 %	20 %	0 %	384222775
121	NC_017250	GCGTG	2	10	222909	222918	0 %	20 %	60 %	20 %	384222776
122	NC_017250	GCCGC	2	10	225412	225421	0 %	0 %	40 %	60 %	384222779
123	NC_017250	GCGCA	2	10	225843	225852	20 %	0 %	40 %	40 %	384222780
124	NC_017250	GTCCT	2	10	226419	226428	0 %	40 %	20 %	40 %	384222780
125	NC_017250	CGCGG	2	10	227221	227230	0 %	0 %	60 %	40 %	384222781
126	NC_017250	TCTGG	2	10	230119	230128	0 %	40 %	40 %	20 %	384222787
127	NC_017250	TGCGC	2	10	230804	230813	0 %	20 %	40 %	40 %	384222788
128	NC_017250	CATCG	2	10	235344	235353	20 %	20 %	20 %	40 %	384222792
129	NC_017250	GTCAA	2	10	235876	235885	40 %	20 %	20 %	20 %	384222793
130	NC_017250	TCGGT	2	10	238708	238717	0 %	40 %	40 %	20 %	384222797
131	NC_017250	CCATG	2	10	241587	241596	20 %	20 %	20 %	40 %	384222801
132	NC_017250	GAATG	2	10	242383	242392	40 %	20 %	40 %	0 %	384222801
133	NC_017250	GCGCT	2	10	243109	243118	0 %	20 %	40 %	40 %	384222802
134	NC_017250	GCAAC	2	10	243850	243859	40 %	0 %	20 %	40 %	384222803
135	NC_017250	TGCTG	2	10	244054	244063	0 %	40 %	40 %	20 %	384222803
136	NC_017250	CGCGC	2	10	248665	248674	0 %	0 %	40 %	60 %	384222808
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141	NC_017250	GGCGC	2	10	251630	251639	0 %	0 %	60 %	40 %	384222810
142	NC_017250	GCTCG	2	10	251719	251728	0 %	20 %	40 %	40 %	384222810
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244	NC_017250	GGCAT	2	10	438613	438622	20 %	20 %	40 %	20 %	384222984
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246	NC_017250	ATGGC	2	10	440203	440212	20 %	20 %	40 %	20 %	384222985
247	NC_017250	GCGCG	2	10	442729	442738	0 %	0 %	60 %	40 %	384222988
248	NC_017250	TCGGT	2	10	450126	450135	0 %	40 %	40 %	20 %	384222997
249	NC_017250	GCGCG	2	10	451588	451597	0 %	0 %	60 %	40 %	384222998
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251	NC_017250	CGATG	2	10	455250	455259	20 %	20 %	40 %	20 %	384223002
252	NC_017250	GGCTG	2	10	455272	455281	0 %	20 %	60 %	20 %	384223002
253	NC_017250	AAGAA	2	10	456794	456803	80 %	0 %	20 %	0 %	384223003
254	NC_017250	GCTGT	2	10	457897	457906	0 %	40 %	40 %	20 %	384223003
255	NC_017250	TCGGC	2	10	459278	459287	0 %	20 %	40 %	40 %	384223005
256	NC_017250	TGGTC	2	10	464344	464353	0 %	40 %	40 %	20 %	384223012
257	NC_017250	TGGCT	2	10	465070	465079	0 %	40 %	40 %	20 %	384223013
258	NC_017250	AAGGA	2	10	466884	466893	60 %	0 %	40 %	0 %	384223015
259	NC_017250	ACGAC	2	10	468484	468493	40 %	0 %	20 %	40 %	384223017
260	NC_017250	TTCCA	2	10	469100	469109	20 %	40 %	0 %	40 %	384223018
261	NC_017250	GCGAG	2	10	469390	469399	20 %	0 %	60 %	20 %	384223018
262	NC_017250	TCGCT	2	10	470859	470868	0 %	40 %	20 %	40 %	384223019
263	NC_017250	TCCGG	2	10	472284	472293	0 %	20 %	40 %	40 %	384223020
264	NC_017250	CGGCC	2	10	476121	476130	0 %	0 %	40 %	60 %	384223027
265	NC_017250	CGCGC	2	10	477815	477824	0 %	0 %	40 %	60 %	384223030
266	NC_017250	GCGGG	2	10	481461	481470	0 %	0 %	80 %	20 %	384223031
267	NC_017250	CGGCA	2	10	484552	484561	20 %	0 %	40 %	40 %	384223034
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341	NC_017250	CTGAT	2	10	593738	593747	20 %	40 %	20 %	20 %	384223132
342	NC_017250	CCTCG	2	10	593907	593916	0 %	20 %	20 %	60 %	384223132
343	NC_017250	AGAGG	2	10	594269	594278	40 %	0 %	60 %	0 %	384223132
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364	NC_017250	GCGCC	2	10	645213	645222	0 %	0 %	40 %	60 %	384223188
365	NC_017250	TTGTC	2	10	645921	645930	0 %	60 %	20 %	20 %	384223189
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376	NC_017250	CGCCC	2	10	668124	668133	0 %	0 %	20 %	80 %	384223210
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378	NC_017250	ACAAA	2	10	671965	671974	80 %	0 %	0 %	20 %	384223214
379	NC_017250	GCCTT	2	10	672649	672658	0 %	40 %	20 %	40 %	384223215
380	NC_017250	GAGCA	2	10	673386	673395	40 %	0 %	40 %	20 %	384223215
381	NC_017250	CGGGG	2	10	674095	674104	0 %	0 %	80 %	20 %	384223216
382	NC_017250	CCAGC	2	10	677076	677085	20 %	0 %	20 %	60 %	384223220
383	NC_017250	CGGCG	2	10	677263	677272	0 %	0 %	60 %	40 %	384223220
384	NC_017250	GCTGC	2	10	677667	677676	0 %	20 %	40 %	40 %	384223220
385	NC_017250	GCCAT	2	10	678171	678180	20 %	20 %	20 %	40 %	384223220
386	NC_017250	TCGGA	2	10	679082	679091	20 %	20 %	40 %	20 %	384223221
387	NC_017250	CCAGA	2	10	679699	679708	40 %	0 %	20 %	40 %	384223222
388	NC_017250	TGCCG	2	10	680681	680690	0 %	20 %	40 %	40 %	384223222
389	NC_017250	CGCAC	2	10	681990	681999	20 %	0 %	20 %	60 %	384223223
390	NC_017250	CGGTC	2	10	682992	683001	0 %	20 %	40 %	40 %	384223224
391	NC_017250	ATGGA	2	10	683582	683591	40 %	20 %	40 %	0 %	384223225
392	NC_017250	GCCAT	2	10	685292	685301	20 %	20 %	20 %	40 %	384223226
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