MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 195179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017249	CGA	2	6	201629	201634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213935
4003	NC_017249	GCC	2	6	201641	201646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213935
4004	NC_017249	CGACGG	2	12	201694	201705	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384213935
4005	NC_017249	TTCG	2	8	201707	201714	0 %	50 %	25 %	25 %	384213935
4006	NC_017249	ACC	2	6	201758	201763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213935
4007	NC_017249	GGT	2	6	201935	201940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213935
4008	NC_017249	GCG	3	9	201962	201970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213935
4009	NC_017249	TGA	2	6	202038	202043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213936
4010	NC_017249	CGA	2	6	202077	202082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213936
4011	NC_017249	GCG	2	6	202106	202111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213936
4012	NC_017249	CGC	2	6	202164	202169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213936
4013	NC_017249	CGAACG	2	12	202278	202289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213936
4014	NC_017249	GCG	2	6	202305	202310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213936
4015	NC_017249	GC	3	6	202355	202360	0 %	0 %	50 %	50 %	384213936
4016	NC_017249	CAG	2	6	202387	202392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213936
4017	NC_017249	GCC	2	6	202403	202408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213936
4018	NC_017249	TGA	4	12	202422	202433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213936
4019	NC_017249	ATCG	2	8	202471	202478	25 %	25 %	25 %	25 %	384213936
4020	NC_017249	GCC	2	6	202480	202485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213936
4021	NC_017249	GCC	2	6	202513	202518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213936
4022	NC_017249	GAT	2	6	202543	202548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213936
4023	NC_017249	CGGCG	2	10	202585	202594	0 %	0 %	60 %	40 %	384213936
4024	NC_017249	GCG	2	6	202600	202605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213936
4025	NC_017249	GAT	2	6	202606	202611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213936
4026	NC_017249	CAG	2	6	202621	202626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213936
4027	NC_017249	ACCA	2	8	202639	202646	50 %	0 %	0 %	50 %	384213936
4028	NC_017249	CAT	2	6	202759	202764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213936
4029	NC_017249	GAT	2	6	202771	202776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213936
4030	NC_017249	GAT	2	6	202801	202806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213936
4031	NC_017249	CGC	2	6	202831	202836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213936
4032	NC_017249	TCT	2	6	202956	202961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213937
4033	NC_017249	GCG	2	6	202991	202996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213937
4034	NC_017249	TGG	2	6	203004	203009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213937
4035	NC_017249	GAT	2	6	203088	203093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213937
4036	NC_017249	ATC	2	6	203123	203128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213937
4037	NC_017249	GC	3	6	203133	203138	0 %	0 %	50 %	50 %	384213937
4038	NC_017249	TCG	2	6	203181	203186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213937
4039	NC_017249	CGT	2	6	203197	203202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213937
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4041	NC_017249	TGT	2	6	203304	203309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213937
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4043	NC_017249	GTC	2	6	203342	203347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213937
4044	NC_017249	CAT	2	6	203446	203451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213937
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4047	NC_017249	TTCA	2	8	203578	203585	25 %	50 %	0 %	25 %	384213937
4048	NC_017249	GCT	2	6	203604	203609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213937
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4050	NC_017249	CTC	2	6	203674	203679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213937
4051	NC_017249	CGT	2	6	203712	203717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213937
4052	NC_017249	AGC	3	9	203735	203743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213937
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4055	NC_017249	GCC	2	6	203884	203889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213937
4056	NC_017249	CGC	2	6	203895	203900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213937
4057	NC_017249	CGA	3	9	203928	203936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213937
4058	NC_017249	GCCGGA	2	12	203938	203949	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384213937
4059	NC_017249	GCC	2	6	203956	203961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213937
4060	NC_017249	ACCG	2	8	203998	204005	25 %	0 %	25 %	50 %	384213937
4061	NC_017249	GCC	2	6	204019	204024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213937
4062	NC_017249	TGG	2	6	204096	204101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213937
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4064	NC_017249	ATG	2	6	204167	204172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213937
4065	NC_017249	CGC	2	6	204214	204219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213937
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4067	NC_017249	CATCGG	2	12	204387	204398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384213937
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4087	NC_017249	CGGC	2	8	205289	205296	0 %	0 %	50 %	50 %	384213938
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4091	NC_017249	CGA	2	6	205438	205443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213938
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4098	NC_017249	GC	3	6	205585	205590	0 %	0 %	50 %	50 %	384213938
4099	NC_017249	TGG	2	6	205594	205599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213938
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4101	NC_017249	GCA	2	6	205631	205636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213938
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4105	NC_017249	CAG	2	6	205739	205744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213938
4106	NC_017249	CGG	2	6	205751	205756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213938
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4113	NC_017249	CTCG	2	8	206310	206317	0 %	25 %	25 %	50 %	384213939
4114	NC_017249	AGG	2	6	206327	206332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213939
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4120	NC_017249	CAGGA	2	10	206842	206851	40 %	0 %	40 %	20 %	384213940
4121	NC_017249	GC	3	6	206916	206921	0 %	0 %	50 %	50 %	384213940
4122	NC_017249	TCT	2	6	207072	207077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213940
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4220	NC_017249	TGC	2	6	210968	210973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213942
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4222	NC_017249	GC	5	10	211078	211087	0 %	0 %	50 %	50 %	384213942
4223	NC_017249	TGG	2	6	211088	211093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213942
4224	NC_017249	CGGC	2	8	211263	211270	0 %	0 %	50 %	50 %	384213942
4225	NC_017249	CGC	2	6	211302	211307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213942
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4227	NC_017249	CGCGAC	2	12	211347	211358	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384213942
4228	NC_017249	CGA	2	6	211433	211438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213942
4229	NC_017249	GCCG	2	8	211473	211480	0 %	0 %	50 %	50 %	384213942
4230	NC_017249	GCG	2	6	211502	211507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213942
4231	NC_017249	ACCTCG	2	12	211546	211557	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384213942
4232	NC_017249	GCT	2	6	211563	211568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213942
4233	NC_017249	GCC	3	9	211585	211593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213942
4234	NC_017249	GC	3	6	211601	211606	0 %	0 %	50 %	50 %	384213942
4235	NC_017249	TC	3	6	211677	211682	0 %	50 %	0 %	50 %	384213942
4236	NC_017249	GC	4	8	211709	211716	0 %	0 %	50 %	50 %	384213942
4237	NC_017249	GC	3	6	211762	211767	0 %	0 %	50 %	50 %	384213942
4238	NC_017249	GTG	2	6	211843	211848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213942
4239	NC_017249	GCCG	2	8	211872	211879	0 %	0 %	50 %	50 %	384213942
4240	NC_017249	GCG	2	6	211928	211933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213942
4241	NC_017249	CG	4	8	211932	211939	0 %	0 %	50 %	50 %	384213942
4242	NC_017249	CTCGGC	2	12	212008	212019	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384213942
4243	NC_017249	TGG	3	9	212128	212136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213943
4244	NC_017249	GC	3	6	212140	212145	0 %	0 %	50 %	50 %	384213943
4245	NC_017249	TCG	2	6	212146	212151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213943
4246	NC_017249	CGG	2	6	212222	212227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213943
4247	NC_017249	CCTG	2	8	212308	212315	0 %	25 %	25 %	50 %	384213943
4248	NC_017249	GCTACG	2	12	212335	212346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384213943
4249	NC_017249	CTG	2	6	212358	212363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213943
4250	NC_017249	CG	3	6	212407	212412	0 %	0 %	50 %	50 %	384213943
4251	NC_017249	CCTGG	2	10	212423	212432	0 %	20 %	40 %	40 %	384213943
4252	NC_017249	CAA	2	6	212441	212446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213943
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4255	NC_017249	GCT	3	9	212714	212722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213944
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4264	NC_017249	GC	3	6	212987	212992	0 %	0 %	50 %	50 %	384213944
4265	NC_017249	CG	3	6	213023	213028	0 %	0 %	50 %	50 %	384213944
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4274	NC_017249	CAGCGC	2	12	213186	213197	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384213944
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4345	NC_017249	CG	3	6	215980	215985	0 %	0 %	50 %	50 %	384213948
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4353	NC_017249	ACGCC	2	10	216197	216206	20 %	0 %	20 %	60 %	384213949
4354	NC_017249	GGC	3	9	216249	216257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213949
4355	NC_017249	AGC	2	6	216316	216321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213949
4356	NC_017249	GC	4	8	216362	216369	0 %	0 %	50 %	50 %	384213949
4357	NC_017249	ACG	2	6	216428	216433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213949
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4359	NC_017249	TGA	2	6	216464	216469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213949
4360	NC_017249	CGC	2	6	216473	216478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213949
4361	NC_017249	ACCG	2	8	216483	216490	25 %	0 %	25 %	50 %	384213949
4362	NC_017249	CGC	2	6	216504	216509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213949
4363	NC_017249	CGA	2	6	216515	216520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213949
4364	NC_017249	CGC	2	6	216560	216565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213949
4365	NC_017249	TGA	2	6	216581	216586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213949
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4395	NC_017249	TGC	2	6	217876	217881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213950
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4400	NC_017249	GTCGAC	2	12	218030	218041	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384213951
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4463	NC_017249	CAT	2	6	221274	221279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213953
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4467	NC_017249	CCTGC	2	10	221397	221406	0 %	20 %	20 %	60 %	384213953
4468	NC_017249	TGA	2	6	221435	221440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213953
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4471	NC_017249	CGG	2	6	221631	221636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213953
4472	NC_017249	GC	3	6	221694	221699	0 %	0 %	50 %	50 %	384213953
4473	NC_017249	CTG	2	6	221728	221733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213953
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4475	NC_017249	CGG	3	9	221763	221771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213953
4476	NC_017249	CG	3	6	221773	221778	0 %	0 %	50 %	50 %	384213953
4477	NC_017249	CAT	2	6	221784	221789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213953
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4479	NC_017249	GCCC	2	8	221919	221926	0 %	0 %	25 %	75 %	384213953
4480	NC_017249	CGA	2	6	221940	221945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213953
4481	NC_017249	CTC	2	6	221947	221952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213953
4482	NC_017249	AAG	2	6	221953	221958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213953
4483	NC_017249	TCGG	2	8	221971	221978	0 %	25 %	50 %	25 %	384213953
4484	NC_017249	TGC	2	6	222074	222079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213953
4485	NC_017249	CG	3	6	222087	222092	0 %	0 %	50 %	50 %	384213953
4486	NC_017249	GAA	2	6	222108	222113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213953
4487	NC_017249	GTCGCT	2	12	222114	222125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213953
4488	NC_017249	GCG	2	6	222128	222133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213953
4489	NC_017249	GC	3	6	222155	222160	0 %	0 %	50 %	50 %	384213953
4490	NC_017249	AAG	2	6	222250	222255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213953
4491	NC_017249	CGCC	2	8	222287	222294	0 %	0 %	25 %	75 %	384213953
4492	NC_017249	GTC	2	6	222417	222422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213954
4493	NC_017249	CTCG	2	8	222465	222472	0 %	25 %	25 %	50 %	384213954
4494	NC_017249	CCG	2	6	222575	222580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213954
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4496	NC_017249	AGA	2	6	222698	222703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213954
4497	NC_017249	TCGCG	2	10	222705	222714	0 %	20 %	40 %	40 %	384213954
4498	NC_017249	CTG	2	6	222715	222720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213954
4499	NC_017249	GAC	2	6	222736	222741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213954
4500	NC_017249	GTG	2	6	222748	222753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213954

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