MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 195179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017249	CGATC	2	10	64853	64862	20 %	20 %	20 %	40 %	384213804
1002	NC_017249	CG	3	6	64877	64882	0 %	0 %	50 %	50 %	384213804
1003	NC_017249	GATC	2	8	64928	64935	25 %	25 %	25 %	25 %	384213804
1004	NC_017249	ATC	2	6	64951	64956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213804
1005	NC_017249	CGA	2	6	65021	65026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213804
1006	NC_017249	TCA	2	6	65044	65049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213804
1007	NC_017249	GCC	2	6	65114	65119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213804
1008	NC_017249	CAGC	2	8	65131	65138	25 %	0 %	25 %	50 %	384213804
1009	NC_017249	GCCT	2	8	65189	65196	0 %	25 %	25 %	50 %	384213804
1010	NC_017249	CGAAG	2	10	65234	65243	40 %	0 %	40 %	20 %	384213804
1011	NC_017249	TCGCAC	2	12	65290	65301	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384213804
1012	NC_017249	GCT	2	6	65309	65314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213804
1013	NC_017249	GCT	2	6	65330	65335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213804
1014	NC_017249	CGT	2	6	65354	65359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213804
1015	NC_017249	TCA	2	6	65360	65365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213804
1016	NC_017249	C	6	6	65408	65413	0 %	0 %	0 %	100 %	384213804
1017	NC_017249	CG	3	6	65498	65503	0 %	0 %	50 %	50 %	384213804
1018	NC_017249	CGA	2	6	65522	65527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213804
1019	NC_017249	ACG	2	6	65566	65571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213804
1020	NC_017249	GCG	2	6	65576	65581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213804
1021	NC_017249	GCT	2	6	65660	65665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213804
1022	NC_017249	ACA	2	6	65755	65760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213804
1023	NC_017249	ATCG	2	8	65761	65768	25 %	25 %	25 %	25 %	384213804
1024	NC_017249	CAAC	2	8	66178	66185	50 %	0 %	0 %	50 %	384213805
1025	NC_017249	CCGT	2	8	66209	66216	0 %	25 %	25 %	50 %	384213805
1026	NC_017249	TCG	2	6	66246	66251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213805
1027	NC_017249	CGA	2	6	66277	66282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213805
1028	NC_017249	TTA	2	6	66376	66381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384213805
1029	NC_017249	GCTT	2	8	66459	66466	0 %	50 %	25 %	25 %	384213805
1030	NC_017249	CCG	2	6	66482	66487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213805
1031	NC_017249	TCT	2	6	66550	66555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213805
1032	NC_017249	TGG	2	6	66557	66562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213805
1033	NC_017249	TGC	2	6	66669	66674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213805
1034	NC_017249	CTG	2	6	66701	66706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213805
1035	NC_017249	GAA	2	6	66885	66890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213806
1036	NC_017249	CGA	2	6	67009	67014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213806
1037	NC_017249	TCG	2	6	67060	67065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213806
1038	NC_017249	TTG	2	6	67123	67128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213806
1039	NC_017249	CGG	2	6	67161	67166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213806
1040	NC_017249	GCT	2	6	67278	67283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213806
1041	NC_017249	GTT	2	6	67287	67292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213806
1042	NC_017249	TCG	2	6	67315	67320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213806
1043	NC_017249	TCG	2	6	67327	67332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213806
1044	NC_017249	CA	3	6	67333	67338	50 %	0 %	0 %	50 %	384213806
1045	NC_017249	TCA	2	6	67432	67437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213806
1046	NC_017249	CCA	2	6	67489	67494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213806
1047	NC_017249	TCG	2	6	67507	67512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213806
1048	NC_017249	AG	3	6	67542	67547	50 %	0 %	50 %	0 %	384213806
1049	NC_017249	CGAT	2	8	67579	67586	25 %	25 %	25 %	25 %	384213806
1050	NC_017249	ATCC	2	8	67743	67750	25 %	25 %	0 %	50 %	384213806
1051	NC_017249	AAG	2	6	69952	69957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213807
1052	NC_017249	AG	3	6	70279	70284	50 %	0 %	50 %	0 %	384213807
1053	NC_017249	GCG	2	6	70302	70307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213807
1054	NC_017249	GGA	2	6	70326	70331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213807
1055	NC_017249	ACC	2	6	70613	70618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213808
1056	NC_017249	TCCC	2	8	70629	70636	0 %	25 %	0 %	75 %	384213808
1057	NC_017249	CAT	2	6	70668	70673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213808
1058	NC_017249	CAT	2	6	70713	70718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213808
1059	NC_017249	TCA	2	6	71092	71097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213809
1060	NC_017249	CGC	2	6	71178	71183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213809
1061	NC_017249	CGG	2	6	71192	71197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213809
1062	NC_017249	CGA	2	6	71217	71222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213809
1063	NC_017249	CG	3	6	71577	71582	0 %	0 %	50 %	50 %	384213809
1064	NC_017249	GAC	2	6	71615	71620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213809
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1066	NC_017249	GCA	2	6	71783	71788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213809
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1068	NC_017249	GC	3	6	71816	71821	0 %	0 %	50 %	50 %	384213809
1069	NC_017249	CGC	2	6	71832	71837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213809
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1072	NC_017249	AGCG	2	8	72032	72039	25 %	0 %	50 %	25 %	384213809
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1081	NC_017249	CGT	2	6	72400	72405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213809
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1083	NC_017249	GC	4	8	72443	72450	0 %	0 %	50 %	50 %	384213809
1084	NC_017249	CGAG	2	8	72473	72480	25 %	0 %	50 %	25 %	384213809
1085	NC_017249	TCG	2	6	72481	72486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213809
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1088	NC_017249	GCG	2	6	72982	72987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213810
1089	NC_017249	CG	5	10	73003	73012	0 %	0 %	50 %	50 %	384213810
1090	NC_017249	CGA	2	6	73036	73041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213810
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1092	NC_017249	ACCATT	2	12	73200	73211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213810
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1094	NC_017249	CGAC	2	8	73299	73306	25 %	0 %	25 %	50 %	384213810
1095	NC_017249	AGAC	2	8	73327	73334	50 %	0 %	25 %	25 %	384213810
1096	NC_017249	CCAGC	2	10	73356	73365	20 %	0 %	20 %	60 %	384213810
1097	NC_017249	TCA	2	6	73501	73506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213810
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1100	NC_017249	AGC	2	6	73850	73855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213811
1101	NC_017249	GGCCG	2	10	73983	73992	0 %	0 %	60 %	40 %	384213811
1102	NC_017249	ATC	2	6	74047	74052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213811
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1104	NC_017249	GCG	2	6	74205	74210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213811
1105	NC_017249	AAC	2	6	74239	74244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213811
1106	NC_017249	GAAG	2	8	74323	74330	50 %	0 %	50 %	0 %	384213811
1107	NC_017249	CGA	2	6	74352	74357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213811
1108	NC_017249	TG	3	6	74380	74385	0 %	50 %	50 %	0 %	384213811
1109	NC_017249	ATG	2	6	74407	74412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213811
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1112	NC_017249	GCGAA	2	10	74557	74566	40 %	0 %	40 %	20 %	384213811
1113	NC_017249	GGT	2	6	74570	74575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213811
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1116	NC_017249	TCT	2	6	74949	74954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213812
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1118	NC_017249	CGAG	2	8	74972	74979	25 %	0 %	50 %	25 %	384213812
1119	NC_017249	ACC	2	6	75064	75069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213812
1120	NC_017249	GCA	2	6	75812	75817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213813
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1123	NC_017249	GC	3	6	75933	75938	0 %	0 %	50 %	50 %	384213813
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1125	NC_017249	ATC	2	6	75985	75990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213813
1126	NC_017249	TCG	2	6	76001	76006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213813
1127	NC_017249	TGCGC	2	10	76074	76083	0 %	20 %	40 %	40 %	384213813
1128	NC_017249	TGC	2	6	76091	76096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213813
1129	NC_017249	GCC	2	6	76099	76104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213813
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1134	NC_017249	TCG	3	9	76250	76258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213813
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1138	NC_017249	ATC	2	6	76348	76353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213813
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1143	NC_017249	CGC	2	6	76515	76520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213813
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1147	NC_017249	CAT	2	6	76703	76708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213814
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1150	NC_017249	CGA	2	6	76792	76797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213814
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1159	NC_017249	GCT	2	6	77160	77165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213814
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1165	NC_017249	CCGA	2	8	77298	77305	25 %	0 %	25 %	50 %	384213814
1166	NC_017249	GATC	2	8	77513	77520	25 %	25 %	25 %	25 %	384213815
1167	NC_017249	AATAGC	2	12	77521	77532	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384213815
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1236	NC_017249	CG	3	6	80566	80571	0 %	0 %	50 %	50 %	384213818
1237	NC_017249	TCG	2	6	80659	80664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213818
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1242	NC_017249	TCG	2	6	80878	80883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213818
1243	NC_017249	CG	3	6	80919	80924	0 %	0 %	50 %	50 %	384213818
1244	NC_017249	GCA	2	6	80936	80941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213818
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1246	NC_017249	GCG	2	6	81001	81006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213818
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1249	NC_017249	GAT	2	6	81092	81097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213818
1250	NC_017249	CCAG	2	8	81125	81132	25 %	0 %	25 %	50 %	384213818
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1252	NC_017249	GCA	2	6	81227	81232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213818
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1347	NC_017249	GCGCA	2	10	85089	85098	20 %	0 %	40 %	40 %	384213823
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1496	NC_017249	TGC	2	6	91968	91973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213829
1497	NC_017249	ATC	2	6	91976	91981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213829
1498	NC_017249	ATC	2	6	92030	92035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213829
1499	NC_017249	CCG	2	6	92042	92047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213829
1500	NC_017249	GTT	2	6	92080	92085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213829

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