MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 195179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017249	GGT	2	6	268346	268351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213997
5503	NC_017249	CGA	2	6	268382	268387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213997
5504	NC_017249	C	6	6	268436	268441	0 %	0 %	0 %	100 %	384213997
5505	NC_017249	CGC	2	6	268547	268552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213997
5506	NC_017249	GTA	2	6	268635	268640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213997
5507	NC_017249	CAA	2	6	268687	268692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213997
5508	NC_017249	GCG	2	6	268750	268755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213997
5509	NC_017249	CAG	2	6	268797	268802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213997
5510	NC_017249	TAA	2	6	268834	268839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384213997
5511	NC_017249	GGC	2	6	268905	268910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213997
5512	NC_017249	CGATG	2	10	268921	268930	20 %	20 %	40 %	20 %	384213997
5513	NC_017249	CGC	2	6	268961	268966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213997
5514	NC_017249	CGG	2	6	268982	268987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213997
5515	NC_017249	TCT	2	6	268999	269004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213997
5516	NC_017249	CAA	2	6	269033	269038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213997
5517	NC_017249	CGA	2	6	269057	269062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213997
5518	NC_017249	GT	3	6	270469	270474	0 %	50 %	50 %	0 %	384213998
5519	NC_017249	TGC	2	6	270475	270480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213998
5520	NC_017249	ATA	2	6	270486	270491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384213998
5521	NC_017249	GTGC	2	8	270522	270529	0 %	25 %	50 %	25 %	384213998
5522	NC_017249	CCAGGA	2	12	270569	270580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213998
5523	NC_017249	CGTCC	2	10	270627	270636	0 %	20 %	20 %	60 %	384213998
5524	NC_017249	CTC	2	6	270679	270684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213998
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5528	NC_017249	AG	3	6	270900	270905	50 %	0 %	50 %	0 %	384213999
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5533	NC_017249	CGA	2	6	271114	271119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213999
5534	NC_017249	CG	5	10	271139	271148	0 %	0 %	50 %	50 %	384213999
5535	NC_017249	GCG	2	6	271180	271185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213999
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5545	NC_017249	TCG	2	6	272045	272050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214000
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5551	NC_017249	GC	3	6	272385	272390	0 %	0 %	50 %	50 %	384214000
5552	NC_017249	CGC	2	6	272445	272450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214000
5553	NC_017249	CG	3	6	272511	272516	0 %	0 %	50 %	50 %	384214000
5554	NC_017249	ACA	2	6	272532	272537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384214000
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5558	NC_017249	CGC	2	6	272751	272756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214000
5559	NC_017249	GCG	2	6	272842	272847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214000
5560	NC_017249	CTG	2	6	272908	272913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214000
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5591	NC_017249	GC	3	6	274897	274902	0 %	0 %	50 %	50 %	384214003
5592	NC_017249	CCAA	2	8	274916	274923	50 %	0 %	0 %	50 %	384214003
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5742	NC_017249	GGC	2	6	282789	282794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214009
5743	NC_017249	GATC	2	8	282818	282825	25 %	25 %	25 %	25 %	384214009
5744	NC_017249	GAC	2	6	282836	282841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214009
5745	NC_017249	TCG	2	6	283003	283008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214009
5746	NC_017249	CG	3	6	283047	283052	0 %	0 %	50 %	50 %	384214009
5747	NC_017249	AGC	3	9	283066	283074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214009
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5750	NC_017249	CCGT	2	8	283201	283208	0 %	25 %	25 %	50 %	384214009
5751	NC_017249	GA	3	6	283267	283272	50 %	0 %	50 %	0 %	384214009
5752	NC_017249	ATC	2	6	283323	283328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214009
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5755	NC_017249	GCA	2	6	283508	283513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214009
5756	NC_017249	GCA	2	6	283550	283555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214009
5757	NC_017249	GGC	2	6	283610	283615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214009
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5759	NC_017249	GGCCG	2	10	283671	283680	0 %	0 %	60 %	40 %	384214009
5760	NC_017249	CGGG	2	8	283709	283716	0 %	0 %	75 %	25 %	384214009
5761	NC_017249	C	7	7	283828	283834	0 %	0 %	0 %	100 %	384214009
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5765	NC_017249	CGT	2	6	283979	283984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214009
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5767	NC_017249	ATC	2	6	284190	284195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214009
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5771	NC_017249	TCGA	2	8	284808	284815	25 %	25 %	25 %	25 %	384214010
5772	NC_017249	AG	3	6	284893	284898	50 %	0 %	50 %	0 %	384214010
5773	NC_017249	GC	3	6	284917	284922	0 %	0 %	50 %	50 %	384214010
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5777	NC_017249	CCG	2	6	285076	285081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214010
5778	NC_017249	GC	3	6	285096	285101	0 %	0 %	50 %	50 %	384214010
5779	NC_017249	GCG	2	6	285120	285125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214010
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5784	NC_017249	GCCT	2	8	285263	285270	0 %	25 %	25 %	50 %	384214010
5785	NC_017249	GCCA	2	8	285308	285315	25 %	0 %	25 %	50 %	384214010
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5833	NC_017249	GGCGCT	2	12	287192	287203	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384214010
5834	NC_017249	TCG	2	6	287275	287280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214010
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5844	NC_017249	ATC	2	6	288540	288545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214012
5845	NC_017249	CAA	2	6	288548	288553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384214012
5846	NC_017249	TCG	2	6	288583	288588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214012
5847	NC_017249	AGGGCA	2	12	288592	288603	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384214012
5848	NC_017249	CAGC	2	8	288751	288758	25 %	0 %	25 %	50 %	384214013
5849	NC_017249	GCG	2	6	288768	288773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214013
5850	NC_017249	GCG	2	6	288786	288791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214013
5851	NC_017249	CGA	2	6	288792	288797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214013
5852	NC_017249	CGA	2	6	288831	288836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214013
5853	NC_017249	CGG	2	6	288840	288845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214013
5854	NC_017249	CTT	2	6	288874	288879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384214013
5855	NC_017249	CAT	2	6	288880	288885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214013
5856	NC_017249	CCGCGA	2	12	288927	288938	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384214013
5857	NC_017249	CG	4	8	288940	288947	0 %	0 %	50 %	50 %	384214013
5858	NC_017249	CAG	2	6	288976	288981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214013
5859	NC_017249	GGC	2	6	289000	289005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214013
5860	NC_017249	CAGCAC	2	12	289021	289032	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384214013
5861	NC_017249	GCG	2	6	289055	289060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214013
5862	NC_017249	CGA	2	6	289074	289079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214013
5863	NC_017249	GCG	2	6	289098	289103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214013
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5983	NC_017249	ATC	2	6	294118	294123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214017
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5986	NC_017249	GCA	2	6	294282	294287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214017
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