MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 195179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017249	CCTG	2	8	245296	245303	0 %	25 %	25 %	50 %	384213978
5003	NC_017249	CGA	2	6	245329	245334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213978
5004	NC_017249	TCG	2	6	245349	245354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213978
5005	NC_017249	GCA	2	6	245458	245463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213978
5006	NC_017249	AGC	2	6	245547	245552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213978
5007	NC_017249	GC	3	6	245551	245556	0 %	0 %	50 %	50 %	384213978
5008	NC_017249	CGT	2	6	245557	245562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213978
5009	NC_017249	GTC	2	6	245612	245617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213978
5010	NC_017249	TCG	2	6	245634	245639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213978
5011	NC_017249	ATG	2	6	245786	245791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213979
5012	NC_017249	CGT	2	6	245825	245830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213979
5013	NC_017249	CGT	2	6	245856	245861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213979
5014	NC_017249	ACG	2	6	245867	245872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213979
5015	NC_017249	CGAGG	2	10	246012	246021	20 %	0 %	60 %	20 %	384213979
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5017	NC_017249	CG	3	6	246063	246068	0 %	0 %	50 %	50 %	384213979
5018	NC_017249	CGC	2	6	246096	246101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213979
5019	NC_017249	TCA	2	6	246125	246130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213979
5020	NC_017249	AGG	2	6	246155	246160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213979
5021	NC_017249	CGGC	2	8	246171	246178	0 %	0 %	50 %	50 %	384213979
5022	NC_017249	TGCG	2	8	246226	246233	0 %	25 %	50 %	25 %	384213979
5023	NC_017249	GAA	2	6	246243	246248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213979
5024	NC_017249	TGG	2	6	246317	246322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213979
5025	NC_017249	GCC	2	6	246330	246335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213979
5026	NC_017249	TGT	3	9	246413	246421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213979
5027	NC_017249	GC	3	6	246439	246444	0 %	0 %	50 %	50 %	384213979
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5030	NC_017249	CGT	2	6	246524	246529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213979
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5034	NC_017249	ATC	2	6	246622	246627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213979
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5037	NC_017249	GATA	2	8	246785	246792	50 %	25 %	25 %	0 %	384213979
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5040	NC_017249	TGG	2	6	246922	246927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213979
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5043	NC_017249	TCA	2	6	247089	247094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213980
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5053	NC_017249	CGG	2	6	247762	247767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213981
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5059	NC_017249	CAT	2	6	248023	248028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213981
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5120	NC_017249	GCC	2	6	250611	250616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213982
5121	NC_017249	GAT	2	6	250632	250637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213982
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5123	NC_017249	GCA	2	6	250682	250687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213982
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5232	NC_017249	GC	3	6	255911	255916	0 %	0 %	50 %	50 %	384213986
5233	NC_017249	GCG	2	6	255931	255936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213986
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5239	NC_017249	TCT	2	6	256051	256056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213986
5240	NC_017249	CGC	2	6	256063	256068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213986
5241	NC_017249	CAG	2	6	256343	256348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213987
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5243	NC_017249	CGGC	2	8	256438	256445	0 %	0 %	50 %	50 %	384213987
5244	NC_017249	TCG	3	9	256467	256475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213987
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5253	NC_017249	ACGCG	2	10	256848	256857	20 %	0 %	40 %	40 %	384213987
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5364	NC_017249	GGA	2	6	261313	261318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213991
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5485	NC_017249	CGTCCT	2	12	267160	267171	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384213996
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