MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 2967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017243	TTTTA	2	10	1431	1440	20 %	80 %	0 %	0 %	384207499
2	NC_017243	ATAAA	2	10	2485	2494	80 %	20 %	0 %	0 %	384207499
3	NC_017243	TAATA	2	10	3060	3069	60 %	40 %	0 %	0 %	384207500
4	NC_017243	ATTTT	2	10	3649	3658	20 %	80 %	0 %	0 %	384207501
5	NC_017243	TATTT	2	10	6263	6272	20 %	80 %	0 %	0 %	384207503
6	NC_017243	CTTAT	2	10	7320	7329	20 %	60 %	0 %	20 %	384207504
7	NC_017243	TATGC	2	10	8198	8207	20 %	40 %	20 %	20 %	384207506
8	NC_017243	ATGCA	2	10	9204	9213	40 %	20 %	20 %	20 %	384207507
9	NC_017243	ATTTT	2	10	9757	9766	20 %	80 %	0 %	0 %	384207507
10	NC_017243	ATAAA	2	10	12046	12055	80 %	20 %	0 %	0 %	384207508
11	NC_017243	TAATA	2	10	12419	12428	60 %	40 %	0 %	0 %	384207508
12	NC_017243	TTTAT	2	10	12720	12729	20 %	80 %	0 %	0 %	384207509
13	NC_017243	ATTTT	2	10	12810	12819	20 %	80 %	0 %	0 %	384207509
14	NC_017243	CTCTT	2	10	13573	13582	0 %	60 %	0 %	40 %	384207510
15	NC_017243	TCTAT	2	10	13718	13727	20 %	60 %	0 %	20 %	384207510
16	NC_017243	AAAAG	2	10	15475	15484	80 %	0 %	20 %	0 %	384207513
17	NC_017243	AAAGA	2	10	15513	15522	80 %	0 %	20 %	0 %	384207513
18	NC_017243	ACAAT	2	10	19406	19415	60 %	20 %	0 %	20 %	384207516
19	NC_017243	AAAAT	2	10	19873	19882	80 %	20 %	0 %	0 %	384207517
20	NC_017243	TACAT	2	10	21587	21596	40 %	40 %	0 %	20 %	384207518
21	NC_017243	TTTAT	2	10	29512	29521	20 %	80 %	0 %	0 %	384207526
22	NC_017243	TAATG	2	10	31942	31951	40 %	40 %	20 %	0 %	384207527
23	NC_017243	TAAAT	2	10	32437	32446	60 %	40 %	0 %	0 %	384207527
24	NC_017243	AAAAG	2	10	33186	33195	80 %	0 %	20 %	0 %	384207528
25	NC_017243	AAATC	2	10	33495	33504	60 %	20 %	0 %	20 %	384207528
26	NC_017243	AATAT	2	10	33682	33691	60 %	40 %	0 %	0 %	384207528
27	NC_017243	AAGTA	2	10	34024	34033	60 %	20 %	20 %	0 %	384207529
28	NC_017243	TAAAA	2	10	34865	34874	80 %	20 %	0 %	0 %	384207530
29	NC_017243	ACAAA	2	10	34940	34949	80 %	0 %	0 %	20 %	384207530
30	NC_017243	ATTTT	2	10	35624	35633	20 %	80 %	0 %	0 %	384207531
31	NC_017243	TAAAT	2	10	36106	36115	60 %	40 %	0 %	0 %	384207531
32	NC_017243	TTTAT	2	10	37265	37274	20 %	80 %	0 %	0 %	384207533
33	NC_017243	AATGA	2	10	37376	37385	60 %	20 %	20 %	0 %	384207533
34	NC_017243	TATAC	2	10	38312	38321	40 %	40 %	0 %	20 %	384207534
35	NC_017243	TTAAT	2	10	38796	38805	40 %	60 %	0 %	0 %	384207534
36	NC_017243	TAATA	2	10	39964	39973	60 %	40 %	0 %	0 %	384207536
37	NC_017243	AATCC	2	10	40888	40897	40 %	20 %	0 %	40 %	384207537
38	NC_017243	TTAAT	2	10	42119	42128	40 %	60 %	0 %	0 %	384207538
39	NC_017243	CCATA	2	10	42654	42663	40 %	20 %	0 %	40 %	384207539
40	NC_017243	TTATC	2	10	42912	42921	20 %	60 %	0 %	20 %	384207540
41	NC_017243	TTGTC	2	10	46721	46730	0 %	60 %	20 %	20 %	384207543
42	NC_017243	AAAAG	2	10	46914	46923	80 %	0 %	20 %	0 %	384207543
43	NC_017243	AAATG	2	10	47306	47315	60 %	20 %	20 %	0 %	384207543
44	NC_017243	TGATA	2	10	47849	47858	40 %	40 %	20 %	0 %	384207543
45	NC_017243	CTTAT	2	10	48207	48216	20 %	60 %	0 %	20 %	384207544
46	NC_017243	AAAAG	2	10	49999	50008	80 %	0 %	20 %	0 %	384207544
47	NC_017243	ATTAT	2	10	50889	50898	40 %	60 %	0 %	0 %	384207545
48	NC_017243	TCAAA	2	10	53185	53194	60 %	20 %	0 %	20 %	384207548
49	NC_017243	ACAAG	2	10	53301	53310	60 %	0 %	20 %	20 %	384207548
50	NC_017243	TGTTA	2	10	53797	53806	20 %	60 %	20 %	0 %	384207549
51	NC_017243	TAAAA	2	10	54116	54125	80 %	20 %	0 %	0 %	384207549
52	NC_017243	TTACC	2	10	54673	54682	20 %	40 %	0 %	40 %	384207550
53	NC_017243	CTATA	2	10	54899	54908	40 %	40 %	0 %	20 %	384207550
54	NC_017243	ATATC	2	10	55614	55623	40 %	40 %	0 %	20 %	384207551
55	NC_017243	AATTG	2	10	55722	55731	40 %	40 %	20 %	0 %	384207551
56	NC_017243	TCTTT	2	10	57344	57353	0 %	80 %	0 %	20 %	384207552
57	NC_017243	CAAAT	2	10	59570	59579	60 %	20 %	0 %	20 %	384207554
58	NC_017243	TAAAA	2	10	60127	60136	80 %	20 %	0 %	0 %	384207555
59	NC_017243	ATATA	2	10	61430	61439	60 %	40 %	0 %	0 %	384207557
60	NC_017243	ATGAA	2	10	62234	62243	60 %	20 %	20 %	0 %	384207558
61	NC_017243	AAATC	2	10	62812	62821	60 %	20 %	0 %	20 %	384207560
62	NC_017243	AAGAT	2	10	63229	63238	60 %	20 %	20 %	0 %	384207561
63	NC_017243	ACCAT	2	10	63493	63502	40 %	20 %	0 %	40 %	384207562
64	NC_017243	CAATA	2	10	64194	64203	60 %	20 %	0 %	20 %	384207563
65	NC_017243	AATTT	2	10	64750	64759	40 %	60 %	0 %	0 %	384207564
66	NC_017243	AAGAA	2	10	67948	67957	80 %	0 %	20 %	0 %	384207567
67	NC_017243	AAAAG	2	10	68742	68751	80 %	0 %	20 %	0 %	384207567
68	NC_017243	ATATT	2	10	69784	69793	40 %	60 %	0 %	0 %	384207569
69	NC_017243	AATTA	2	10	70540	70549	60 %	40 %	0 %	0 %	384207570
70	NC_017243	AAAAT	2	10	73538	73547	80 %	20 %	0 %	0 %	384207576
71	NC_017243	AAAAG	2	10	74868	74877	80 %	0 %	20 %	0 %	384207578
72	NC_017243	AAAAG	2	10	75816	75825	80 %	0 %	20 %	0 %	384207578
73	NC_017243	GAGAT	2	10	75913	75922	40 %	20 %	40 %	0 %	384207578
74	NC_017243	AGCAA	2	10	76858	76867	60 %	0 %	20 %	20 %	384207579
75	NC_017243	AAATA	2	10	79015	79024	80 %	20 %	0 %	0 %	384207582
76	NC_017243	AGAAA	2	10	79029	79038	80 %	0 %	20 %	0 %	384207582
77	NC_017243	ATCAA	2	10	79173	79182	60 %	20 %	0 %	20 %	384207582
78	NC_017243	ATAGA	2	10	79567	79576	60 %	20 %	20 %	0 %	384207583
79	NC_017243	TAAAA	2	10	79691	79700	80 %	20 %	0 %	0 %	384207583
80	NC_017243	AAACA	2	10	79952	79961	80 %	0 %	0 %	20 %	384207583
81	NC_017243	ATAAA	2	10	83063	83072	80 %	20 %	0 %	0 %	384207588
82	NC_017243	TTAAA	2	10	85001	85010	60 %	40 %	0 %	0 %	384207590
83	NC_017243	AATGG	2	10	85081	85090	40 %	20 %	40 %	0 %	384207590
84	NC_017243	TTTAA	2	10	85680	85689	40 %	60 %	0 %	0 %	384207591
85	NC_017243	AAAAT	2	10	87397	87406	80 %	20 %	0 %	0 %	384207592
86	NC_017243	TGAAA	2	10	87686	87695	60 %	20 %	20 %	0 %	384207593
87	NC_017243	AATGA	2	10	88781	88790	60 %	20 %	20 %	0 %	384207594
88	NC_017243	TTGAT	2	10	91952	91961	20 %	60 %	20 %	0 %	384207599
89	NC_017243	CTATT	2	10	92476	92485	20 %	60 %	0 %	20 %	384207600
90	NC_017243	TGTAC	2	10	92820	92829	20 %	40 %	20 %	20 %	384207600
91	NC_017243	AAAAT	2	10	94211	94220	80 %	20 %	0 %	0 %	384207602
92	NC_017243	AATTA	2	10	94296	94305	60 %	40 %	0 %	0 %	384207602
93	NC_017243	ATCAA	2	10	94527	94536	60 %	20 %	0 %	20 %	384207602
94	NC_017243	TTTAT	2	10	94691	94700	20 %	80 %	0 %	0 %	384207603
95	NC_017243	ATTTA	2	10	95317	95326	40 %	60 %	0 %	0 %	384207604
96	NC_017243	AATTT	2	10	96834	96843	40 %	60 %	0 %	0 %	384207605
97	NC_017243	GAAAT	2	10	97603	97612	60 %	20 %	20 %	0 %	384207605
98	NC_017243	TTTTA	2	10	99854	99863	20 %	80 %	0 %	0 %	384207608
99	NC_017243	CAATT	2	10	100158	100167	40 %	40 %	0 %	20 %	384207608
100	NC_017243	TAAAA	2	10	100195	100204	80 %	20 %	0 %	0 %	384207608
101	NC_017243	ATATT	2	10	100345	100354	40 %	60 %	0 %	0 %	384207608
102	NC_017243	TATAT	2	10	101223	101232	40 %	60 %	0 %	0 %	384207609
103	NC_017243	ATTAT	2	10	103697	103706	40 %	60 %	0 %	0 %	384207610
104	NC_017243	TTACT	2	10	105746	105755	20 %	60 %	0 %	20 %	384207611
105	NC_017243	AAATA	2	10	106673	106682	80 %	20 %	0 %	0 %	384207612
106	NC_017243	AATAT	2	10	107248	107257	60 %	40 %	0 %	0 %	384207612
107	NC_017243	TATAA	2	10	107358	107367	60 %	40 %	0 %	0 %	384207612
108	NC_017243	ATATC	2	10	107495	107504	40 %	40 %	0 %	20 %	384207612
109	NC_017243	AATAA	2	10	107928	107937	80 %	20 %	0 %	0 %	384207612
110	NC_017243	TAAAA	2	10	108715	108724	80 %	20 %	0 %	0 %	384207612
111	NC_017243	GAAAG	2	10	109080	109089	60 %	0 %	40 %	0 %	384207612
112	NC_017243	TTAAA	2	10	110516	110525	60 %	40 %	0 %	0 %	384207615
113	NC_017243	ATTGC	2	10	111008	111017	20 %	40 %	20 %	20 %	384207615
114	NC_017243	TGAAT	2	10	112767	112776	40 %	40 %	20 %	0 %	384207615
115	NC_017243	AAAAG	2	10	113480	113489	80 %	0 %	20 %	0 %	384207616
116	NC_017243	CATAC	2	10	115277	115286	40 %	20 %	0 %	40 %	384207617
117	NC_017243	TATCA	2	10	116125	116134	40 %	40 %	0 %	20 %	384207618
118	NC_017243	TATAG	2	10	119052	119061	40 %	40 %	20 %	0 %	384207619
119	NC_017243	TTTGA	2	10	120830	120839	20 %	60 %	20 %	0 %	384207620
120	NC_017243	ATATT	2	10	121484	121493	40 %	60 %	0 %	0 %	384207622
121	NC_017243	AAAAG	2	10	121608	121617	80 %	0 %	20 %	0 %	384207622
122	NC_017243	TTTCT	2	10	124522	124531	0 %	80 %	0 %	20 %	384207625
123	NC_017243	TATGA	2	10	126482	126491	40 %	40 %	20 %	0 %	384207628
124	NC_017243	TAATT	2	10	127043	127052	40 %	60 %	0 %	0 %	384207628
125	NC_017243	TAAAA	2	10	127109	127118	80 %	20 %	0 %	0 %	384207629
126	NC_017243	TTTGA	2	10	127512	127521	20 %	60 %	20 %	0 %	384207630
127	NC_017243	TAATA	2	10	128090	128099	60 %	40 %	0 %	0 %	384207630
128	NC_017243	AATAA	2	10	129928	129937	80 %	20 %	0 %	0 %	384207632
129	NC_017243	TGATT	2	10	132157	132166	20 %	60 %	20 %	0 %	384207634
130	NC_017243	TATAA	2	10	132752	132761	60 %	40 %	0 %	0 %	384207634
131	NC_017243	CAAAA	2	10	133925	133934	80 %	0 %	0 %	20 %	384207635
132	NC_017243	TAAAT	2	10	135917	135926	60 %	40 %	0 %	0 %	384207639
133	NC_017243	TAAAA	2	10	137812	137821	80 %	20 %	0 %	0 %	384207640
134	NC_017243	TAAAA	2	10	139824	139833	80 %	20 %	0 %	0 %	384207641
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136	NC_017243	TAAAT	2	10	142860	142869	60 %	40 %	0 %	0 %	384207643
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