MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017243	TCTT	2	8	138272	138279	0 %	75 %	0 %	25 %	384207640
3502	NC_017243	TAAA	2	8	138286	138293	75 %	25 %	0 %	0 %	384207640
3503	NC_017243	A	7	7	138469	138475	100 %	0 %	0 %	0 %	384207641
3504	NC_017243	AAT	2	6	138522	138527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207641
3505	NC_017243	ATT	2	6	138552	138557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207641
3506	NC_017243	TGA	2	6	138570	138575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207641
3507	NC_017243	T	6	6	138630	138635	0 %	100 %	0 %	0 %	384207641
3508	NC_017243	AGA	2	6	138648	138653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207641
3509	NC_017243	ATT	2	6	138701	138706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207641
3510	NC_017243	TGGA	2	8	138721	138728	25 %	25 %	50 %	0 %	384207641
3511	NC_017243	AAT	3	9	138763	138771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207641
3512	NC_017243	TA	3	6	138790	138795	50 %	50 %	0 %	0 %	384207641
3513	NC_017243	ATC	2	6	138819	138824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207641
3514	NC_017243	ATG	2	6	138827	138832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207641
3515	NC_017243	ATC	2	6	138861	138866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207641
3516	NC_017243	AT	3	6	138931	138936	50 %	50 %	0 %	0 %	384207641
3517	NC_017243	TAA	2	6	138948	138953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207641
3518	NC_017243	ATA	2	6	138995	139000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207641
3519	NC_017243	T	6	6	139002	139007	0 %	100 %	0 %	0 %	384207641
3520	NC_017243	TAA	2	6	139080	139085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207641
3521	NC_017243	TAAT	2	8	139103	139110	50 %	50 %	0 %	0 %	384207641
3522	NC_017243	TAA	2	6	139113	139118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207641
3523	NC_017243	GT	3	6	139122	139127	0 %	50 %	50 %	0 %	384207641
3524	NC_017243	ATA	2	6	139133	139138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207641
3525	NC_017243	TTC	2	6	139140	139145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207641
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3527	NC_017243	ATT	2	6	139198	139203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207641
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3529	NC_017243	AATT	2	8	139292	139299	50 %	50 %	0 %	0 %	384207641
3530	NC_017243	A	7	7	139312	139318	100 %	0 %	0 %	0 %	384207641
3531	NC_017243	TTA	2	6	139321	139326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207641
3532	NC_017243	TA	3	6	139384	139389	50 %	50 %	0 %	0 %	384207641
3533	NC_017243	AT	3	6	139413	139418	50 %	50 %	0 %	0 %	384207641
3534	NC_017243	ATG	2	6	139484	139489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207641
3535	NC_017243	CTA	2	6	139538	139543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207641
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3537	NC_017243	GGA	2	6	139674	139679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207641
3538	NC_017243	ATC	2	6	139698	139703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207641
3539	NC_017243	ATG	2	6	139735	139740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207641
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3541	NC_017243	TAC	2	6	139785	139790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207641
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3543	NC_017243	ATG	2	6	139811	139816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207641
3544	NC_017243	TAAAA	2	10	139824	139833	80 %	20 %	0 %	0 %	384207641
3545	NC_017243	A	6	6	139830	139835	100 %	0 %	0 %	0 %	384207641
3546	NC_017243	AGA	2	6	139851	139856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207641
3547	NC_017243	GCA	2	6	139903	139908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207641
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3550	NC_017243	ATAA	2	8	140029	140036	75 %	25 %	0 %	0 %	384207641
3551	NC_017243	CAG	2	6	140039	140044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207641
3552	NC_017243	AGA	2	6	140094	140099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207641
3553	NC_017243	CAG	2	6	140132	140137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207641
3554	NC_017243	AAG	2	6	140144	140149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207641
3555	NC_017243	CA	3	6	140196	140201	50 %	0 %	0 %	50 %	384207641
3556	NC_017243	CTT	2	6	140210	140215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207641
3557	NC_017243	GCA	2	6	140233	140238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207641
3558	NC_017243	TTA	2	6	140248	140253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207641
3559	NC_017243	GAA	2	6	140272	140277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207641
3560	NC_017243	T	6	6	140287	140292	0 %	100 %	0 %	0 %	384207641
3561	NC_017243	ATAGTT	2	12	140561	140572	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384207642
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3563	NC_017243	TAGC	2	8	140610	140617	25 %	25 %	25 %	25 %	384207642
3564	NC_017243	AATA	2	8	140623	140630	75 %	25 %	0 %	0 %	384207642
3565	NC_017243	CTT	2	6	140705	140710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207642
3566	NC_017243	AAT	2	6	140740	140745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207642
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3570	NC_017243	ATTT	2	8	140805	140812	25 %	75 %	0 %	0 %	384207642
3571	NC_017243	ATA	2	6	140814	140819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207642
3572	NC_017243	TA	3	6	140825	140830	50 %	50 %	0 %	0 %	384207642
3573	NC_017243	GAA	2	6	140890	140895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207642
3574	NC_017243	GCA	3	9	140912	140920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207642
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3578	NC_017243	ATAA	2	8	140996	141003	75 %	25 %	0 %	0 %	384207642
3579	NC_017243	TA	4	8	141031	141038	50 %	50 %	0 %	0 %	384207642
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3590	NC_017243	T	7	7	141295	141301	0 %	100 %	0 %	0 %	384207642
3591	NC_017243	ATG	2	6	141329	141334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
3592	NC_017243	ATT	2	6	141352	141357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207642
3593	NC_017243	ATT	2	6	141394	141399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207642
3594	NC_017243	TAT	2	6	141412	141417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207642
3595	NC_017243	TCT	2	6	141422	141427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207642
3596	NC_017243	TA	3	6	141443	141448	50 %	50 %	0 %	0 %	384207642
3597	NC_017243	TGA	2	6	141481	141486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
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3601	NC_017243	TAGC	2	8	141678	141685	25 %	25 %	25 %	25 %	384207642
3602	NC_017243	GAA	2	6	141713	141718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207642
3603	NC_017243	ATC	2	6	141757	141762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207642
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3605	NC_017243	GTA	2	6	141815	141820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
3606	NC_017243	GGC	2	6	141824	141829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384207642
3607	NC_017243	TAC	2	6	141844	141849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207642
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3609	NC_017243	ATG	2	6	141870	141875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207642
3610	NC_017243	TAAAA	2	10	141883	141892	80 %	20 %	0 %	0 %	384207642
3611	NC_017243	A	6	6	141889	141894	100 %	0 %	0 %	0 %	384207642
3612	NC_017243	AGA	2	6	141910	141915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207642
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3617	NC_017243	CAG	2	6	142098	142103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207642
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3621	NC_017243	CTT	2	6	142269	142274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207642
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